Geenien kytkentäepätasapaino
Kytkentäepätasapaino ( LD ) on eri lokusten alleelitaajuuksien ei-satunnainen jakauma , joka voi johtua paitsi geenien läheisestä geneettisestä sidoksesta , myös tietyn alleeliyhdistelmän mukautuvasta edusta. joka kasvaa vastaavasti satunnaisjakaumalla odotettavissa olevaan frekvenssiin verrattuna.
Ohjelmat LD:n laskemiseen
- LiAn - Linkage Analysis 3.7 Arkistoitu 11. lokakuuta 2009 Wayback Machinessa (Ias) (online)
- Arlequin 3.5 arkistoitu 29. joulukuuta 2020 Wayback Machinessa (p-arvot, D, D', r², χ²) (Windows)
- LinkDos verkossa Arkistoitu 18. syyskuuta 2009 Wayback Machinessa (Δ, D, D') (verkossa)
- MultiLocus 1.3b arkistoitu 27. toukokuuta 2009 Wayback Machinessa (Ia, rd) (Windows, MacOS)
- MIDAS – Multiallelic Interallelic Disequilibrium Analysis Software 1.0 (Python, Windows, Linux)
Visualisointi
Linkit