Kolmen verkkotunnuksen järjestelmä

Kolmen tason järjestelmä on Carl Woesen vuonna 1977 ehdottama  biologinen luokitus [1] [2] . Hän jakaa solujen elämänmuodot kolmeen alueeseen: arkeat , bakteerit ja eukaryootit . Erityisesti kiinnitetään erityistä huomiota prokaryoottien jakamiseen kahteen ryhmään, joita alun perin kutsuttiin Eubacteriaksi (nykyisin bakteeriksi) ja arkkibakteereiksi (nykyisin Archaea). Woese väitti 16s rRNA-geenien eroihin perustuen , että nämä kaksi ryhmää ja eukaryootit erosivat yhteisestä esi-isästä, jolla oli huonosti kehittynyt geneettinen laite, jota usein kutsutaan progenoottiksi . Osoittaakseen tämän erottelun Woese antoi jokaiselle ryhmälle toimialueen tilan ja jakoi ne useisiin valtakuntiin. Aluksi Woese käytti termiä " kuningaskunta " korkeimman luokan fylogeneettisille ryhmille, mutta nyt (vuodesta 1990 [2] ) käytetään termiä " alue ".

Huhtikuussa 2016 tutkijaryhmä julkaisi päivitetyn ja tarkistetun version Elämänpuusta Nature Microbiology -lehdessä. Siinä suurin osa oksista kuuluu bakteereille, joista monet elävät mudassa ja niittymaissa. Myös tämä työ vahvisti jälleen kerran, että eukaryootit ja arkeat liittyvät läheisesti toisiinsa [3] .

Luokitus

Kolmen toimialueen järjestelmä lisää uuden tason luokitteluun verrattuna 5 tai 6 valtakunnan järjestelmässä käytettyihin valtakuntiin. Luokituksessa tunnustetaan perustavanlaatuinen ero näiden kahden prokaryoottiryhmän välillä, koska arkeat ovat lähempänä eukaryootteja kuin bakteereja. Tällä hetkellä järjestelmä tunnistaa seuraavat alueet kussakin toimialueella:

Verkkotunnus Archaea . Ne eroavat eubakteereista RNA -ominaisuuksiltaan ja biokemialtaan . Niillä on ainutlaatuinen muinainen evoluutiohistoria , minkä vuoksi niitä pidetään yhtenä maan vanhimmista organismeista . Usein niitä kutsutaan myös arkebakteereiksi . Usein heitä luonnehditaan äärimmäisten ympäristöjen asukkaiksi.

Bakteerialue . Prokaryooteilla ei ole ydinkalvoa. Näitä ovat useimmat tunnetut patogeeniset prokaryootit (katso poikkeuksia [5] ), arkeaa on tutkittu paljon yksityiskohtaisemmin.

Eukaryoottialue . Siellä on ydinkalvo , erilaisia ​​kalvoorganelleja ilmestyy.

Jokaisen kolmen alueen edustajilla on omat ominaisuutensa, joiden vuoksi he vievät tiettyjä ekologisia markkinarakoja ja suorittavat erityisiä toimintoja. Monet bakteerit ovat sienten ohella hajottajia , eli ne hajottavat orgaanisia jäännöksiä ja aiheuttavat myös erilaisia ​​sairauksia. Arkeat ovat sopeutuneet erilaisiin ankariin ympäristöihin, kuten korkeisiin lämpötiloihin, korkeaan happamuuteen tai rikkipitoisuuteen jne. Lisäksi ne käyttävät valtavasti erilaisia ​​energialähteitä. Eukaryoottisolut ovat monimutkaisemmin organisoituneita ja plastisempia, mikä mahdollisti niiden yhdistymisen erittäin organisoituneiksi soluryhmiksi. Tämä oli monisoluisten organismien alku. Itse asiassa eukaryoottisten soluelinten valikoima syntyi , mahdollisesti eri toimintoja suorittavien solujen fuusion seurauksena.

Muistiinpanot

  1. Woese C., Fox G. Prokaryoottialueen filogeneettinen rakenne: ensisijaiset valtakunnat. (englanti)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America  : Journal. - 1977. - Voi. 74 , nro. 11 . - P. 5088-5090 . - doi : 10.1073/pnas.74.11.5088 . - . — PMID 270744 .
  2. 1 2 Woese C., Kandler O., Wheelis M. Kohti luonnollista organismijärjestelmää: ehdotus alueille Archaea, Bacteria ja Eucarya.  (englanti)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America  : Journal. - 1990. - Voi. 87 , no. 12 . - P. 4576-4579 . - doi : 10.1073/pnas.87.12.4576 . - . — PMID 2112744 . Arkistoitu alkuperäisestä 27. kesäkuuta 2008.
  3. Laura A. Hug, Brett J. Baker, Karthik Anantharaman, Christopher T. Brown, Alexander J. Probst. Uusi näkymä elämänpuusta  (englanniksi)  // Nature Microbiology. – 11.4.2016. — Voi. 1 , iss. 5 . — ISSN 2058-5276 . - doi : 10.1038/nmikrobiol.2016.48 . Arkistoitu alkuperäisestä 21. lokakuuta 2019.
  4. Laura A. Hug, Brett J. Baker, Karthik Anantharaman, Christopher T. Brown, Alexander J. Probst. Uusi näkymä elämänpuusta  (englanniksi)  // Nature Microbiology. – 11.4.2016. — Voi. 1 , iss. 5 . — ISSN 2058-5276 . - doi : 10.1038/nmikrobiol.2016.48 . Arkistoitu alkuperäisestä 21. lokakuuta 2019.
  5. Paul B. Eckburg, Paul W. Lepp ja David A. Relman (2003) Archaea and Their Potential Role in Human Disease. Infektio ja immuniteetti, s. 591-596, voi. 71, nro. 2 doi : 10.1128/IAI.71.2.591-596.2003