4,5-disyanimidatsoli

4,5-disyanimidatsoli [1] [2]
Kenraali
Chem. kaava C5H2N4 _ _ _ _ _
Fyysiset ominaisuudet
Osavaltio värittömiä kiteitä
Moolimassa 118,10 g/ mol
Tiheys 1,43 g/cm³
Lämpöominaisuudet
Lämpötila
 •  sulaminen 175 - 176 °C
 •  vilkkuu 170,2 °C
Luokitus
Reg. CAS-numero 1122-28-7
Turvallisuus
Lyhyt hahmo. vaara (H) H315 , H318 , H335
varotoimenpiteitä. (P) P280 , P302+P352 , P305+P351+P338+P310
merkkisana Vaarallinen
GHS-piktogrammit CGS-järjestelmän "korroosio" -piktogrammiCGS-järjestelmän kuvamerkki "huutomerkki".
Tiedot perustuvat standardiolosuhteisiin (25 °C, 100 kPa), ellei toisin mainita.

4,5-disyanimidatsoli on orgaaninen aine, imidatsolijohdannainen . Sillä on käyttöä aktivaattorina oligonukleotidien automaattisessa synteesissä sekä nukleosidiamidofosfiittien synteesissä .

Haetaan

4,5-disyanimidatsolia on kaupallisesti saatavilla. Lisäpuhdistukseen kuuluu valkaisu aktiivihiilellä ja kiteyttäminen kuumasta vedestä [1] .

Sovellus

Oligonukleotidien kiinteäfaasisynteesi

Avainvaihe oligonukleotidien automaattisessa synteesissä on ketjun pidentyminen. Tätä varten amidofosfiittireagenssi aktivoidaan heikolla hapolla, minkä seurauksena se fosforyloi kasvavan ketjun 5'-hydroksyyliryhmän kiinteällä alustalla. Aktivaattorin roolin voi suorittaa myös 4,5-disyaani-imidatsoli. Uskotaan, että tässä tapauksessa se korvaa di-isopropyyliamiiniryhmän amidofosfiitissa, ja tuloksena oleva välituoteyhdiste reagoi nopeasti kasvavan ketjun hydroksyyliryhmän kanssa, jolloin saadaan fosforiesteri. Synteettinen sykli päättyy sitten reagoimattomien hydroksyyliryhmien estoon ja fosfotriesterin hapettumiseen fosfaatiksi [1] .

Klassinen aktivaattori tässä synteesin vaiheessa on 1H-tetratsolin liuos asetonitriilissä , mutta erittäin puhtaan 4,5-disyaani-imidatsolin liuoksilla on osoitettu olevan tiettyjä etuja. Keskeinen ero on, että 4,5-disyaani-imidatsolilla on vähemmän happamia ominaisuuksia (pKa = 5,2 vs. 4,8 tetratsolilla), mikä vähentää vahingossa tapahtuvaa dimetoksitrityyliryhmien häviämistä kondensaatioprosessin aikana ja välttää sivutuotteiden muodostumisen. Lisäksi on osoitettu, että amidofosfiittireagenssien aktivaationopeus 4,5-disyaani-imidatsolilla on kaksi kertaa suurempi kuin tetratsolin. Nämä kaksi seikkaa ovat erityisen tärkeitä käytettäessä 2'-modifioituja nukleosideja, jotka ovat vaikeampia ja vaativat siksi pidempiä kondensaatioaikoja. Näin ollen ei ole toivottavaa, että sellaiset reagenssit ovat happaman reagenssin läsnä ollessa pitkään: tämä johtaa pitkittyneiden synteesituotteiden muodostumiseen (N+1, N+2...) [1] .

Myös 4,5-disyaani-imidatsolilla on korkeampi liukoisuus asetonitriiliin (jopa 1,1 M verrattuna 0,5 M tetratsoliin). Lopuksi 4,5-disyaani-imidatsolia pidetään turvallisempana kuin lueteltua räjähtävää tetratsolia [1] .

Nukleosidiamidofosfiittien synteesi

Nukleosidiamidofosfiittien synteesi itsessään sisältää myös reaktion alkoholiryhmän ja N,N,N',N'-tetraisopropyyli-O-(2-syaanietyyli)diamidofosfiitin amidofosfiittifunktion välillä. Näin ollen tässä tapauksessa 4,5-disyaani-imidatsoli voi toimia myös fosfityloivan reagenssin aktivaattorina [1] .

Muistiinpanot

  1. ↑ 1 2 3 4 5 6 EROS, 2018 .
  2. ↑ 4,5 -disyaani-imidatsoli  . Sigma Aldrich . Käyttöönottopäivä: 7.1.2021.

Kirjallisuus

Linkit