Dicer

Kokeneet kirjoittajat eivät ole vielä tarkistaneet sivun nykyistä versiota, ja se voi poiketa merkittävästi 16. huhtikuuta 2018 tarkistetusta versiosta . tarkastukset vaativat 3 muokkausta .
Dicer 1, ribonukleaasi III

RNaasi IIIb:n ja hiiren dsRNA:ta sitovan domeenin rakenne (Dicer).
Käytettävissä olevat rakenteet
ATE Ortologinen haku: PDBe , RCSB
Tunnisteet
SymboliDICER1  ; DCR1; Dicer; HERNA; MNG1; RMSE2
Ulkoiset tunnuksetOMIM:  606241 MGI :  2177178 Homologeeni :  13251 GeneCards : DICER1-geeni
EY-numero3.1.26.3
ortologit
NäytäIhmisenHiiri
Entrez23405192119
YhtyeENSG00000100697ENSMUSG00000041415
UniProtQ9UPY3Q8R418
RefSeq (mRNA)NM_001195573NM_148948
RefSeq (proteiini)NP_001182502NP_683750
Locus (UCSC)Chr 14:
95,55 – 95,62 Mb
Chr 12:
104,69 – 104,75 Mb
Hae PubMedistä[yksi][2]

Dicer  on RNaasi III (RNase III) -perheen ribonukleaasi , joka katkaisee kaksijuosteisia RNA- ja pre-miRNA-molekyylejä (premiRNA ) tuottaakseen lyhyitä kaksijuosteisia RNA-fragmentteja, joita kutsutaan pieniksi häiritseväksi RNA:ksi (siRNA) ja miRNA :ksi (miRNA). Nämä fragmentit ovat pituudeltaan noin 20-25 nukleotidia , ja tyypillisesti 2-3 nukleotidin ylitys 3'-päässä [1] .

Dicer sisältää kaksi RNase III - domeenia ja yhden PAZ - domeenin . Näiden alueiden välinen etäisyys molekyylissä määräytyy yhdistävän silmukan pituuden ja kulman perusteella ja määrittää tuloksena olevan siRNA:n pituuden. Dicer katalysoi RNA-interferenssiprosessin ensimmäistä vaihetta ja käynnistää RISC :n (RNA-indusoidun vaimennuskompleksin) muodostumisen, jonka katalyyttinen komponentti, Argonaute - proteiini , on endonukleaasi, joka hajottaa siRNA:n johtavan juosteen kanssa komplementaarisia mRNA:ita [2] .

Katso myös

Muistiinpanot

  1. 1 2 Macrae I., Zhou K., Li F., Repic A., Brooks A., Cande W., Adams P., Doudna J. Dicerin kaksijuosteisen RNA:n käsittelyn  rakenneperusta // - 2006. - Voi. 311 , no. 5758 . - s. 195-198 . - doi : 10.1126/tiede.1121638 . — PMID 16410517 .
  2. Jaronczyk K., Carmichael J., Hobman T. RNA-interferenssireitin proteiinien toimintojen tutkiminen: jotkut toiminnot ovat RISCy-keskeisempiä kuin toiset?  (eng.)  // Biochem J : päiväkirja. - 2005. - Voi. 387 , no. Pt 3 . - s. 561-571 . - doi : 10.1042/BJ20041822 . — PMID 15845026 .