Molekyyligraafi on yhdistetty suuntaamaton graafi , joka vastaa yksitellen kemiallisen yhdisteen rakennekaavaa siten, että graafin kärjet vastaavat molekyylin atomeja ja graafin reunat vastaavat näiden atomien välisiin kemiallisiin sidoksiin . "Molekyyligraafin" käsite on perustieto tietokonekemiassa ja kemoinformatiikassa . Kuten rakennekaava, molekyylikaavio on molekyylin malli, eikä se, kuten mikä tahansa malli , heijasta kaikkia prototyypin ominaisuuksia. Toisin kuin rakennekaavassa, jossa aina ilmoitetaan, mihin kemialliseen alkuaineeseen tietty atomi kuuluu, molekyylikuvaajan kärjet voivat olla merkitsemättömiä - tässä tapauksessa molekyylikaavio heijastaa vain molekyylin rakennetta, mutta ei koostumusta. Samoin molekyyligraafin reunat voivat olla leimaamattomia, jolloin yksittäisten ja useiden kemiallisten sidosten välillä ei tehdä eroa. Joissakin tapauksissa voidaan käyttää molekyylikaaviota, joka heijastaa vain orgaanisen yhdisteen molekyylin hiilirunkoa. Tämä abstraktiotaso on kätevä lukuisten kemiallisten ongelmien laskennalliseen ratkaisuun.
Molekyyligraafin luonnollinen jatke on reaktiograafi , jonka reunat vastaavat atomien välisten sidosten muodostumista, katkeamista ja uudelleenjärjestelyä.
"Korostamme, että R. Baderin [1] teoriassa empiirinen ajatus additiivisuudesta perustettiin ensimmäisen kerran, juuri tämä teoria mahdollisti tiukan fyysisen merkityksen antamisen useille klassisen käsitteille. kemiallisen rakenteen teoria , erityisesti "valenssialku" (sidospolku) ja kemiallinen rakennekaava (molekyylikaavio)." [2]
| Molekyylivisualisointi | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| Kemialliset kaavat |
| ||||
| Molekyylimallit |
| ||||
| Muut | |||||
| Rakennekemia | |
|---|---|
| kemiallinen sidos | |
| Rakenteen näyttö | |
| Elektroniset ominaisuudet | |
| Stereokemia | |