Morfologia ( biologiassa ) tutkii sekä organismin , taksonin tai sen osien ulkoista rakennetta (muotoa, rakennetta, väriä, kuvioita) että elävän organismin sisäistä rakennetta (esimerkiksi ihmisen morfologiaa ). Se on jaettu ulkoiseen morfologiaan (tai eidonomiaan) ja sisäiseen morfologiaan (tai anatomiaan ). Morfologia eroaa fysiologiasta siinä, että jälkimmäinen tutkii ensisijaisesti organismin toimintaa.
Itse asiassa morfologian käsitteen esitteli saksalainen runoilija ja luonnontieteilijä I. W. Goethe ja määritteli sen "oppiksi orgaanisten kappaleiden muodosta, sen muodostumisesta ja muuttamisesta".
Termiä "yleinen morfologia" käytetään myös, mikä viittaa organismin tunnettuihin tai tärkeimpiin erottaviin piirteisiin tai taksonin morfologiaan. Organismin yleisen morfologian kuvaus voi sisältää esimerkiksi sen muodon, päävärit, perusvärit jne., mutta ei hienoja yksityiskohtia.
Useimmat taksonit eroavat muista morfologisista ominaisuuksista. Läheisillä taksoneilla on pääsääntöisesti paljon vähemmän eroja kuin niihin liittyvillä kaukaisemilla, mutta poikkeuksiakin on. Pelkästään morfologiseen tietoon luottamuksen epäluotettavuus piilee kuitenkin siinä, että kahden morfologisesti erilaisen organismiryhmän DNA:ta analysoitaessa voi käydä ilmi, että ne kaikki kuuluvat samaan lajiin. Päinvastoin, joskus toisistaan riippumattomat taksonit osoittautuvat ulkonäöltään identtisiksi konvergentin evoluution tai jopa mimiikin kautta .