Nukleotidisekvenssi
Nukleotidisekvenssi , geneettinen sekvenssi - nukleiinihappojen nukleotiditähteiden järjestys . Määritetään sekvensoinnilla .
DNA : n nukleotidisekvenssien tallentamiseen käytetään IUPAC :n suosituksen mukaisesti latinalaisten aakkosten merkkejä. [yksi]
- A = adeniini [2]
- C = sytosiini
- G = guaniini
- T = tymiini
- R = GA guaniini tai adeniini - puriini (puriini ) emäkset
- Y = TC-pyrimidiini (p y rimidiini ) emäkset
- K = GT, joka sisältää ketoryhmän
- M = AC, joka sisältää aminoryhmän
- S = GC "vahva" ( vahva) muodostaen 3 vetysidosta
- W = AT "heikko" ( w eak) muodostaen 2 vetysidosta
- B = GTC (mikä tahansa muu kuin A)
- D = GAT (mikä tahansa paitsi C)
- H = ACT (mikä tahansa muu kuin G)
- V = GCA (mikä tahansa muu kuin T)
- N = AGCT (mikä tahansa)
Sekvenssin epämääräisyyttä ilmaisevia symboleja tarvitaan, kun tarkka sekvenssi on tuntematon, epäolennainen tai sen eri muunnelmat tunnetaan.
Symbolit A, C, G, U ( uridiini )
ovat yleensä riittäviä RNA -sekvenssien kirjoittamiseen .
Kaikki sekvenssit kirjoitetaan ilman välilyöntejä, vasemmalta oikealle, 5'-päästä 3'-päähän .
Muistiinpanot
- ↑ Nukleiinihapposekvenssien epätäydellisesti määriteltyjen emästen nimikkeistö arkistoitu 21. elokuuta 2017, Wayback Machine , NC-IUB, 1984.
- ↑ perusnimiä käytetään mukavuussyistä, ei nukleosideja
Katso myös