Paikkakohtainen rekombinaatio

Kohdespesifinen rekombinaatio  on eräänlainen geneettinen rekombinaatio , jossa DNA-säikeiden vaihdon aikana tapahtuu reaktio tiettyjen kohtien välillä [1] [2] [3] . DNA-segmenttien vaihtaminen tapahtuu tunnistamalla ja yhdistämällä lyhyitä DNA-sekvenssejä (kohtia), joissa erityiset entsyymit katkaisevat, järjestävät uudelleen ja yhdistävät DNA-säikeitä. Joillekin rekombinaatiojärjestelmille riittää vain rekombinaasientsyymi, kun taas toiset edellyttävät lisätekijöiden läsnäoloa. Luonnossa paikkaspesifinen rekombinaatio tapahtuu, kun virus integroituu genomiin ( proviruksen muodostuminen ).

Paikkaspesifiset rekombinaatiojärjestelmät ovat erittäin spesifisiä, nopeita ja tehokkaita myös monimutkaisten eukaryoottisten genomien kanssa työskennellessä [4] ja tästä syystä niitä käytetään laajalti geenitekniikassa [5] Ne ovat mukana monissa soluprosesseissa, mukaan lukien bakteerien genomin replikaatio, patogeneesi, liikkuvien geneettisten elementtien liikkuminen ja vasta-aineiden muodostuminen nisäkkään lymfoidisoluissa .

Rekombinaatiokohdat ovat yleensä 30-200 nukleotidin pituisia ja koostuvat kahdesta käänteisestä toistosta, joihin rekombinaasi sitoutuu, ja joiden välissä sijaitsee sekvenssi, jossa rekombinaatio tapahtuu. Molemmat kohdat, joissa rekombinaatio tapahtuu, ovat yleensä identtisiä, mutta poikkeuksiakin on (esimerkiksi faagin λ attP ja attB integraatiokohdat , katso lambda-faagi ) [6] .

Katso myös

Muistiinpanot

  1. ↑ Bode, J; Schlake, T; asadasasada Iber, M; Schuebeler, D; Seibler, J; Snežkov, E; Nikolaev, L. Transgeneetikon työkalupakki: uusia menetelmiä eukaryoottisten genomien kohdennettuun modifiointiin   // Biol . Chem. : päiväkirja. - 2000. - Voi. 381 , no. 9-10 . - s. 801-813 . - doi : 10.1515/BC.2000.103 . — PMID 11076013 .
  2. ↑ Kolb, A. F. Genome Engineering käyttäen paikkaspesifisiä rekombinaaseja  //  Cloning & Stem Cells: Journal. - 2002. - Voi. 4 , ei. 1 . - s. 65-80 . - doi : 10.1089/153623002753632066 . — PMID 12006158 .
  3. ↑ Coates, CJ; Kaminski, JM; Summers, JB; Segal, DJ; Miller, AD; Kolb, AF Kohdennettu genomin modifikaatio: DNA:ta modifioivien entsyymien johdannaiset kohdistustyökaluina  //  Trends in Biotechnology : päiväkirja. - Cell Press , 2005. - Voi. 23 , ei. 8 . - s. 407-419 . - doi : 10.1016/j.tibtech.2005.06.009 . — PMID 15993503 . Arkistoitu alkuperäisestä 29. elokuuta 2006.
  4. ↑ Sauer, B. Indusoitava geenikohdistus hiirissä Cre/loxSystem-järjestelmän avulla  //  Methods : Journal. - 1998. - Voi. 14 , ei. 4 . - s. 381-392 . - doi : 10.1006/meth.1998.0593 . — PMID 9608509 . Arkistoitu alkuperäisestä 11. kesäkuuta 2011.
  5. ↑ Akopian, A.; Stark, WM Site-Specific DNA Recombinases as Instruments for Genomic Surgery  (englanniksi)  // Advances in Genetics : Journal. - 2005. - Voi. Genetiikan edistysaskeleita . - s. 1-23 . — ISBN 978-0-12-017655-7 . - doi : 10.1016/S0065-2660(05)55001-6 .
  6. ↑ Landy A. Lambda-paikkakohtaisen rekombinoinnin dynaamiset, rakenteelliset ja sääntelylliset näkökohdat   // Biochemistryn vuosikatsaus : päiväkirja. - 1989. - Voi. 58 , no. 1 . - s. 913-941 . doi : 10.1146 / annurev.bi.58.070189.004405 . — PMID 2528323 .
  Siirry Wikidata-kohteeseen  Sanakirjat ja tietosanakirjat