Serpin

Serpiinit ( eng.  Serpins , lyhenne sanoista seriiniproteaasi -  inhibiittorit , "seriiniproteaasi-inhibiittorit") ovat ryhmä proteiineja , joilla on tietty rakenteellinen samankaltaisuus keskenään ja joista monet inhiboivat seriiniproteaaseja , eli proteaaseja , joissa on seriiniä aktiivinen keskus .

Johdanto

Aluksi tämä termi merkitsi proteiiniluokkaa, joka spesifisesti inhiboi tiettyjä seriiniproteaaseja (esimerkiksi antitrombiini on serpiini , joka inhiboi spesifisesti seriiniproteaasitrombiinia ). Myöhemmin kuitenkin kävi ilmi, että joillakin rakenteellisesti serpiinien kaltaisilla proteiineilla ei ole inhiboivaa vaikutusta (esim. munanvalkuaisen pääproteiini ovalbumiini ), mutta silti ne luokitellaan myös serpiineiksi.

Luokitus

Vuonna 2001 julkaistiin serpiinien luokittelu, jonka mukaan 500 serpiineiksi luokiteltua proteiinia jaettiin 16 kladiin (yhdestä prekursorista syntyneisiin ryhmiin). Katso (Silverman et ai.) Bibliography.

Luokan tärkeimmät edustajat

Seuraavat proteiinit kuuluvat serpiinien luokkaan:

• Seriiniproteaasit:
  • alfa-antitrypsiini ;
  • alfa-antikymotrypsiini ;
  • alfa-antiplasmiini ( fibrinolyysin estäjä );
  • antitrombiini ( hyytymisen estäjä , erityisesti tekijä X , tekijä IX ja trombiini ;
  • C1-inhibiittori ;
  • Neuroserpin ;
  • plasminogeeniaktivaattori-1 :n estäjä ja plasminogeeniaktivaattori-2 :n estäjä ( fibrinolyysin estäjä );
  • Proteiini Z:n kaltainen proteaasi-inhibiittori (ZPI, inaktivoi tekijä X ja tekijä XI )

• Sitovat globuliinit ja muut proteiinit:
  • Transcortin
  • tyroksiinia sitova globuliini
  • Angiotensiini
  • ovalbumiini

Bibliografia

• Silverman GA, Bird PI, Carrell RW, Church FC, Coughlin PB, Gettins PG, Irving JA, Lomas DA, Luke CJ, Moyer RW, Pemberton PA, Remold-O'Donnell E, Salvesen GS, Travis J, Whisstock JC. Serpiinit ovat rakenteellisesti samankaltaisten mutta toiminnallisesti monimuotoisten proteiinien kasvava superperhe. Evoluutio, estomekanismi, uudet toiminnot ja tarkistettu nimikkeistö. J Biol Chem 2001;276:33293-6. PMID 11435447 .
• Gettins PGW. Serpin rakenne, mekanismi ja toiminta . Chem Rev 2002; 102:4751-803. DOI 10.1021/cr010170+ .
• Irving JA, Steenbakkers PJ, Lesk AM, Op den Camp HJ, Pike RN, Whisstock JC. Serpinit prokaryooteissa. Mol Biol Evol. 2002 marraskuu;19(11):1881-90. PMID 12411597 .
• Irving JA, Pike RN, Lesk AM, Whisstock. Serpin-superperheen fysiologia: Aminohappojen säilymisen mallien vaikutukset rakenteeseen ja toimintaan. Genome Res. 2000; kymmenen; 1845-64. PMID 11116082 .