Syanofagit ovat viruksia, jotka infektoivat syanobakteereja . Nimi on johdettu termistä faagi , joka viittaa virukseen, joka tartuttaa bakteereja . Syanobakteerien tärkeä rooli maailman valtamerten orgaanisen aineen ensisijaisina tuottajina on niiden ekologian tutkiminen tärkeää globaalin hiilen kierron ymmärtämisessä . Syanofageilla on tärkeä rooli syanobakteeriyhteisössä, koska ne sisältävät hyvin usein geenejä proteiineille, jotka vastaavat fotosynteesistä ( terminaalinen oksidaasi ), vastustuskyvystä fosforin puutokselle tai fotosysteemin yksi tai kaksi pieniä säätelyalayksiköitä . Tästä huolimatta syanofaagien geneettinen monimuotoisuus voidaan jakaa hyvin määriteltyihin samankaltaisten isolaattien ryhmiin, mikä on epätyypillistä bakteriofageille yleensä [1] . Tällaisia ryhmiä voidaan löytää vakaasti samasta paikasta vuosikymmenen tai pidemmänkin ajan, kuten on osoitettu vuosina 1999-2013 Synechococcus spp. Uuden Englannin rannikkovesillä [2] .