Moniproteiinikompleksi (tai yksinkertaisesti proteiinikompleksi ) on kahden tai useamman linkitetyn polypeptidiketjun ryhmä. Eri polypeptidiketjuilla voi olla erilaisia toimintoja. Moniproteiinikompleksi eroaa multientsymaattisesta polypeptidistä siinä, että viimeksi mainitussa yhdessä polypeptidiketjussa on lukuisia katalyyttisiä domeeneja [1] .
Proteiinikompleksit ovat eräs kvaternäärisen rakenteen muoto . Proteiinit , jotka muodostavat proteiinikomplekseja, ovat yhteydessä toisiinsa ei-kovalenttisilla proteiini-proteiini-vuorovaikutuksilla , ja eri proteiinikomplekseilla on vaihteleva stabiilisuusaste ajan myötä. Nämä kompleksit ovat monien (ellei useimpien) biologisten prosessien kulmakivi, ja yhdessä ne muodostavat erilaisia molekyylikoneita, jotka suorittavat monenlaisia biologisia toimintoja. Yhä useammin tutkijat pitävät solua komponenttina, joka koostuu modulaarisista supramolekulaarisista komplekseista, joista jokainen suorittaa itsenäisen, erillisen biologisen toiminnon [2] .
Läheisyydestä johtuen entsyymikompleksin ja substraattien välisten vuorovaikutusten nopeutta ja sitoutumisen selektiivisyyttä voidaan parantaa merkittävästi, mikä johtaa korkeampaan solutehokkuuteen. Monet solujen leikkaamiseen ja proteiinien eristämiseen käytetyt tekniikat ovat luonnostaan tuhoavia tällaisille suurille komplekseille, ja siksi on usein vaikeaa määrittää komponentteja, jotka muodostavat proteiinikompleksin. Esimerkki proteiinikomplekseista ovat molekyylien hajoamisproteasomit ja useimmat RNA-polymeraasit . Stabiilisissa komplekseissa suuret hydrofobiset vuorovaikutukset proteiinien välillä piiloutuvat yleensä yli 2500 neliön angströmin pinta-alalle [3] .
Proteiinikompleksien molekyylirakenne voidaan määrittää käyttämällä kokeellisia tekniikoita, kuten röntgenkristallografiaa , yksittäisen hiukkasen analyysiä tai ydinmagneettista resonanssia (NMR).