Nestekromatografia on kromatografiaa , jossa liikkuva faasi on neste.
Nestekromatografia jaetaan neste-adsorptioon (yhdisteiden erottuminen johtuu niiden erilaisesta kyvystä adsorboitua ja desorboitua adsorbentin pinnalta), neste-nesteeksi tai jakautumiseen (erotus tapahtuu erilaisen liukoisuuden vuoksi liikkuvaan faasiin - eluentti ja stationaarifaasi, fysikaalisesti sorboitu tai kemiallisesti oksastettu kiinteän adsorbentin pintaan), ioninvaihtokromatografia, jossa erotus saavutetaan analysoitujen ionisoituvien aineiden reversiibelin vuorovaikutuksen ansiosta sorbentin - ioninvaihtimen ioniryhmien kanssa. Erityinen paikka nestekromatografisten menetelmien käytössä on kokoekskluusio- eli geelikromatografialla ja affiniteetti eli biospesifisyys.
Venäläinen tiedemies Mikhail Tsvet löysi vuonna 1903 nestekromatografian menetelmänä , joka käytti sitä erottamaan kasvipigmentit liitujauheella täytetyissä aineosissa . Tsvetin ehdottama nestekromatografiamenetelmä unohdettiin ansaitsemattomasti, ja sitä käytettiin tuskin yli 30 vuoteen.