Konfiguraatiokoodaus on menetelmä reaktion koodaamiseksi, jossa jokaiselle reaktiolle annetaan tietty binäärinumero. Näin ollen reaktioiden kokonaismäärä, jotka voidaan koodata tällä tavalla N bitillä, on . Tällainen reaktio voi auttaa tunnistamaan ärsykkeen riippumattoman piirteen tai ominaisuuden, kuten sijainnin verkkokalvolla (oikealla, vasemmalla), koon, vaaka- tai pystysuuntaisen venymän. Sitä käytetään kuvien koodaamiseen ja niiden tunnistamiseen hermoverkkojen avulla.