Ferredoksiinista riippuvainen nitriittireduktaasi

ferredoksiinista riippuvainen nitriittireduktaasi

Nitriittireduktaasi Spinacia oleraceasta . Syrogem näkyy harmaana, rauta-rikkiklusteri ruskeana. [yksi]
Tunnisteet
Koodi KF 1.7.7.1
CAS-numero 37256-44-3
Entsyymitietokannat
IntEnz IntEnz-näkymä
BRENDA BRENDA sisääntulo
ExPASy NiceZyme-näkymä
MetaCyc metabolinen reitti
KEGG KEGG-merkintä
PRIAM profiili
ATE:n rakenteet RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum
Geeniontologia AmiGO  • EGO
Hae
PMC artikkeleita
PubMed artikkeleita
NCBI NCBI-proteiinit
CAS 37256-44-3

Ferredoksiinista riippuvainen nitriittireduktaasi on entsyymi, joka katalysoi reaktiota:

NO 2 - + 6 Fd palautus + 8 H + → NH 4 + + 2 H 2 O + 6 Fd- oksidi

Korkeammissa kasveissa tätä entsyymiä esiintyy yksinomaan plastideissa , joissa sillä on keskeinen rooli typen assimilaatiossa pelkistämällä nitriitin ammoniakiksi . [2] Toisin kuin nitraattireduktaasilla , nitriittireduktaasilla on erittäin korkea entsymaattinen aktiivisuus, mikä varmistaa, että nitriitti ei kerry soluun. NO 2 on kemiallisesti erittäin aktiivinen ja voimakas myrkky kasveille [3] .

Entsyymi voi käyttää erilaisia ​​ferredoksiinin isoformeja . Fotosynteettisissä kudoksissa reaktio etenee fotosysteemi I :n pelkistämästä ferredoksiinista ja juurissa käytetään FdIII-isoformia, jolla on vähemmän negatiivinen redox-potentiaali, joka palautuu helposti NADPH :n ansiosta pentoosifosfaattireitistä ferredoksiini -entsyymin mukana. -NADP + reduktaasi . [neljä]

Korkeammissa kasveissa ferredoksiinista riippuvaista nitriittireduktaasia koodaa kloroplastin NIR -geeni , ja nitraatti (mutta ei nitriitti ) ja valo indusoivat sitä . [5]

Rakennus

Ferredoksiinista riippuvainen nitriittireduktaasi on monomeeri, jonka molekyylipaino on 60-70 kDa, ja se koostuu kahdesta domeenista ja kofaktorista, jotka siirtävät elektroneja ferredoksiinista nitriittiin. Ferredoksiini sitoutuu molekyylin N-terminaaliseen sekvenssiin. Nitriitin sitoutumiskohta on paikantunut proteiinin toiselle puoliskolle C-päässä. Nämä ovat [4Fe-4S]-rauta-rikkiklusteri ja syrogem . [6] [7]

Muistiinpanot

  1. ATE 2AKJ
  2. Zumft WG, Paneque A., Aparicio PJ, Losada M. Nitraatin vähentämismekanismi Chlorellassa   // Biochem . Biophys. Res. commun. : päiväkirja. - 1969. - Voi. 36 , ei. 6 . - s. 980-986 . - doi : 10.1016/0006-291X(69)90300-3 . — PMID 4390523 .
  3. Strasburger: Plant Physiology, osa 2, s. 156
  4. Guy Thomas Hanke, Yoko Kimata-Ariga, Isao Taniguchi ja Toshiharu Hase. Arabidopsis Ferredoxinsin jälkeinen genominen karakterisointi  //  Plant Physiology : Journal. - 2004. - Voi. 134 , nro. 1 . - s. 255-264 . - doi : 10.1104/pp.103.032755 .
  5. Kasvien fysiologia. I. P. Ermakov s. 368
  6. Joy KW, Hageman RH Korkeammista kasveista peräisin olevan nitriittireduktaasin puhdistus ja ominaisuudet sekä sen riippuvuus ferredoksiinista   // Biochem . J. : päiväkirja. - 1966. - Voi. 100 , ei. 1 . - s. 263-273 . — PMID 4381617 .
  7. Ramirez JM, Del Campo FF, Paneque A., Losada M. Ferredoksiini-nitriittireduktaasi pinaatista   // Biochim . Biophys. acta. : päiväkirja. - 1966. - Voi. 118 , nro. 1 . - s. 58-71 . - doi : 10.1016/s0926-6593(66)80144-3 . — PMID 5954064 .