Gene knockdown on tekniikka , joka vähentää yhden tai useamman geenin ilmentymistä muuttamalla vastaavaa nukleotidisekvenssiä tai käyttämällä lyhyttä oligonukleotidia , joka on komplementaarinen vastaavalle mRNA - molekyylille . Geenin knockdown - menetelmällä tarkoitetaan käänteisgenetiikan menetelmiä . Kun geenin sekvenssi muuttuu, organismin sanotaan häviävän kyseisestä geenistä. Jos käytetään lyhyitä oligonukleotideja, jotka ovat komplementaarisia vastaavan mRNA:n kanssa tai sitoutuvat DNA :ssa olevaan nukleotidisekvenssiin, geenin kaatuminen johtaa tilapäiseen muutokseen geenin ilmentymisen parametreissä muuttamatta kromosomien rakennetta ja geenin DNA-sekvenssiä.
Jos kyseessä on lyhytaikainen knockdown, oligonukleotidin sitoutuminen geeniin tai transkripteihin vähentää ilmentymistä johtuen transkription , translaation tai mRNA:n hajoamisen estämisestä (esimerkiksi RNA-interferenssireitin kautta), myös pre-mRNA- silmukointi voi olla heikentynyt . [1] [2] Tutkijat tutkivat geenin sammuttamisen tai sen ilmentymisen vähentämisen vaikutusta organismin fenotyyppiin ja vertaavat sitä normaaleihin yksilöihin. Lyhytaikaisia geenien tyrmäyksiä käytetään usein kehitysbiologiassa, koska oligonukleotidit voidaan helposti viedä tsygoottiin ja ne siirtyvät kaikkiin tytärsoluihin alkion kehityksen aikana. [3]