Subfossiilit tai subfossiiliset jäänteet ovat fossiileja , jotka eivät ole saavuttaneet täydellistä fossiilistumista (eli kivettymistä). Usein puhumme eläinten jäännöksistä, jotka ovat säilyttäneet paitsi luuston , myös hieman muuttuneet pehmytkudokset. Kasvien ja eläinten jäännökset voidaan säilyttää subfossiilisesti. Ensimmäisessä tapauksessa tähteet voivat säilyttää solurakenteen osittain tai kokonaan. Termiä käytetään pääasiassa paleontologiassa .
Kasvien subfossiileja kutsutaan fytoleimeiksi [1] .
Subfossiileja löytyy ikiroutasta, meripihkasta ja soista.