NAMD

NAMD
Kehittäjä Illinoisin yliopisto Urbanassa ja Champaignissa
Sisään kirjoitettu C++
Käyttöjärjestelmä Poikkitaso
uusin versio
Verkkosivusto ks.uiuc.edu/Research/nam…
 Mediatiedostot Wikimedia Commonsissa

NAMD ( NA noscale M olecular Dynamics ) on Charm++ rinnakkaisohjelmointimallilla kirjoitettu ilmainen molekyylidynamiikkaohjelma , jolla on korkea rinnakkaistehokkuus ja jota käytetään usein suurten järjestelmien (miljoonien atomien) simulointiin. Ohjelman ovat luoneet yhdessä teoreettinen ja laskennallinen biofysiikkaryhmä (TCB) ja Parallel Programming Laboratory (PPL) Illinoisin yliopistossa Urbanassa ja Champaignissa .

Nelson ym. [2] ilmoittivat ohjelman vuonna 1995 rinnakkaisena molekyylidynamiikkaohjelmana, joka sisältää interaktiivisia simulaatioita, jotka on yhdistetty VMD -visualisointiohjelmaan . Ohjelma tukee moniprosessointia , kykyä käyttää grafiikkaprosessoreita laskelmiin ( CUDA -tekniikka ).

Katso myös

Muistiinpanot

  1. http://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/2.10/announce.html
  2. Nelson M. et ai. NAMD - Rinnakkainen, oliosuuntautunut molekyylidynamiikkaohjelma // International Journal of Supercomputer Applications and High Performance Computing . - 1996. - V.10. - s. 251-268, 1996.

Linkit