Openbabel
openbabel |
---|
|
Tyyppi |
Kemoinformatiikka |
Sisään kirjoitettu |
C++ |
Käyttöjärjestelmä |
Monialustainen ohjelmisto |
uusin versio |
2.3.2 ( 17. lokakuuta 2011 ) |
Luettavat tiedostomuodot |
CML [1] [2] , International Chemical Identifier [3] [2] , MDL Molfile [d] [4] [2] , Protein Data Bank [5] , FASTA (muoto) [6] , Alchemy Format [d] [7] , Gaussin kuutiotiedosto [d] [8] , CDX-muoto [d] [9] , CIF [10] , XYZ-tiedostomuoto [d] [11] , vapaamuotoinen murtomuoto [d] [12 ] ja MCDL-muoto [d] |
Luodut tiedostomuodot |
SMILES [13] [2] , CML [1] [2] , International Chemical Identifier [3] [2] , InChIKey [d] [14] [2] , MDL Molfile [d] [4] [2] , Multilevel Neighborhoods of Atoms -muoto [d] [15] , vapaamuotoinen murtomuoto [d] [12] , MCDL-muoto [d] [16] ja CAChe MolStruct [d] [17] |
Lisenssi |
GNU yleinen julkinen lisenssi |
Verkkosivusto |
openbabel.sourceforge.net/… |
OpenBabel on ilmainen kemian asiantuntijajärjestelmä, jota käytetään ensisijaisesti tiedostomuotojen muuntamiseen. Tämä ohjelma on saatavilla UNIX- ja Windows -käyttöjärjestelmille, ja sitä jaetaan GNU GPL :n ehtojen mukaisesti .
OpenBabel, kuten JOELib , perustuu OELib- kirjastoon , joka puolestaan käyttää Babel -ohjelman ideoita .
Tärkeimmät ominaisuudet
- Kemian asiantuntijajärjestelmä
- Muodin muuntaminen
- Fragmenttien etsiminen (käyttäen SMILES )
Katso myös
Muistiinpanot
- ↑ 1 2 Chemical Markup Language (cml, mrv)
- ↑ 1 2 3 4 5 6 7 8 Tuetut tiedostomuodot ja vaihtoehdot
- ↑ 1 2 InChI-muoto (tuumaa)
- ↑ 1 2 MDL MOL-muoto (mol, mdl, sdf, sd)
- ↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Protein_Data_Bank_format.html
- ↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/FASTA_format.html
- ↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Alchemy_format.html
- ↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Gaussian_cube_format.html
- ↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/ChemDraw_binary_format.html
- ↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Crystallographic_Information_File.html
- ↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/XYZ_cartesian_coordinates_format.html
- ↑ 1 2 http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Free_Form_Fractional_format.html
- ↑ SMILES-muoto (hymy, hymyilee)
- ↑ InChIKey (inchikey)
- ↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Multilevel_Neighborhoods_of_Atoms_(MNA).html
- ↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/MCDL_format.html
- ↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/CAChe_MolStruct_format.html
Linkit