C-hepatiittiviruksen genotyypit

C-hepatiittivirus on jaettu 8 genotyyppiin, ja ne puolestaan ​​​​yli 100 alatyyppiin. Hepatiitti C -viruksen genotyypit eroavat toisistaan ​​nukleotiditason vaihtelussa yli 30 %; viruksen genotyypin alatyypit vaihtelevat keskenään noin 15 %. [yksi]

Kaikki virusgenotyypit voivat johtaa kirroosiin ja hepatosellulaariseen karsinoomaan , mutta genotyyppi 3 on tekijä taudin nopeammassa etenemisessä. [2] 

Genotyypit 1-4 ovat maantieteellisesti yleisimpiä. Pohjois-Amerikassa ja Länsi-Euroopassa alatyyppi 1a [3] on yleisin , ja sen osuus on jopa 70 % kaikista tapauksista. Keski- ja Itä-Euroopassa alatyyppi 1b on yleisin. Entisen Neuvostoliiton alueella yleisimmät ovat alatyyppi 1b ja genotyyppi 3. Genotyyppi 4 on yleisin Lähi-idässä ja Afrikassa : Egyptissä sen osuus kaikista tartunnoista on jopa 90 %. [neljä]

Vaikeimmin hoidettavat ovat alatyyppi 1a ja genotyyppi 3. Genotyypin 2 suuresta geneettisestä monimuotoisuudesta johtuen, koska genotyyppi 2 tulee usein rekombinantteihin muiden genotyyppien kanssa, on genotyypin 2 yksittäisiä kantoja, jotka ovat vastustuskykyisempiä terapialle.

Kehittynein hoitoon on alatyyppi 1b.

Tehdyn evoluutioanalyysin mukaan genotyypin 3a viruksen lähin yhteinen esi -isä oli olemassa noin 200 vuotta sitten. [5]

Hepatiitti C -viruksen alatyyppien maantieteellinen jakautuminen
Genotyypit Osajoukot Maantieteellinen levinneisyys [6]
Genotyyppi 1 1a, 1b... 1n - 13 nimettyä ja 7 nimeämätöntä alatyyppiä yhteensä Pohjois-Amerikka, Euraasia, Keski-Afrikka
Genotyyppi 2 2a, 2b... 2u —

yhteensä 15 nimettyä ja 8 nimeämätöntä alatyyppiä

Länsi-Afrikka, Italia
Genotyyppi 3 3a, 3b... 3k - yhteensä 8 nimettyä alatyyppiä ja 1 nimeämätön Hindustan, Kaakkois-Aasia, entisen Neuvostoliiton tasavallat
Genotyyppi 4 4a, 4b... 4w - yhteensä 18 nimettyä ja 10 nimeämätöntä alatyyppiä Keski-Afrikka, Egypti
Genotyyppi 5 5a Etelä-Afrikka ja Aasia
Genotyyppi 6 6a, 6b... 6xf - 29 nimettyä alatyyppiä yhteensä ja 21 nimeämätöntä Kaakkois-Aasia
Genotyyppi 7 Kongon demokraattinen tasavalta [7]
Genotyyppi 8 Punjabin osavaltio (Intia)
Rekombinanttigenotyypit 1a/1c, 1b/1a, 2/5, 2b/1a, 2b/6w, 2k/1b, 4d/4a, 6n/6o ja muut [8]

Määritysmenetelmät

Tärkeimmät HCV-genotyypin diagnosointimenetelmät ovat seuraavat:

Linkit

  1. ↑ Uuden HCV-genotyypin ja alatyyppien tunnistaminen potilailla, joita hoidetaan sofosbuvir-pohjaisilla hoito-ohjelmilla . www.natap.org (8. marraskuuta 2017). Haettu 10. marraskuuta 2017. Arkistoitu alkuperäisestä 10. marraskuuta 2017.
  2. ↑ Hepatiitti C genotyyppi 3 voi olla tekijä maksafibroosin nopeampaan etenemiseen . www.hv-info.ru (28. lokakuuta 2009). Haettu 10. marraskuuta 2017. Arkistoitu alkuperäisestä 20. lokakuuta 2017.
  3. ↑ Arkistoitu kopio . Haettu 11. huhtikuuta 2017. Arkistoitu alkuperäisestä 22. maaliskuuta 2017. [ täsmennettävä ]
  4. ↑ Nouroz, Faisal. Yleiskatsaus hepatiitti C -viruksen genotyypeistä ja sen torjunnasta  (englanniksi)  // Egyptian Journal of Medical Human Genetics : Journal. - 2015. - Vol. 16 , ei. 4 . - s. 291-298 . - doi : 10.1016/j.ejmhg.2015.05.003 .
  5. ↑ Akkarathamrongsin S, Hacharoen P, Tangkijvanich P, et ai. Hepatiitti C -viruksen alatyypin 3a infektion molekyyliepidemiologia ja geneettinen historia Thaimaassa. Intervirology 2013; 56:284–94.
  6. ↑ Uusi näkemys hepatiitti C -rokotteen kehityksestä  //  Journal of Biomedicine & Biotechnology : päiväkirja. - 2010. - Vol. 2010 . — P. 548280 . - doi : 10.1155/2010/548280 . — PMID 20625493 .
  7. ↑ Donald G. Murphy, Erwin Sablon, Jasmine Chamberland, Eric Fournier, Raymond Dandavino. Hepatiitti C -viruksen genotyyppi 7, uusi genotyyppi Keski-Afrikasta  (englanniksi)  // Journal of Clinical Microbiology. - 01-03-2015. — Voi. 53 , iss. 3 . - s. 967-972 . — ISSN 1098-660X 0095-1137, 1098-660X . - doi : 10.1128/JCM.02831-14 . Arkistoitu alkuperäisestä 27. toukokuuta 2018.
  8. ↑ Andrea Galli, Jens Bukh. Hepatiitti C -viruksen rekombinaation molekyylimekanismien vertaileva analyysi  (englanniksi)  // Trends in Microbiology. - Cell Press , 1.6.2014. — Voi. 22 , iss. 6 . - s. 354-364 . — ISSN 1878-4380 0966-842X, 1878-4380 . - doi : 10.1016/j.tim.2014.02.005 .