Sukusiitoskerroin

Kokeneet kirjoittajat eivät ole vielä tarkistaneet sivun nykyistä versiota, ja se voi poiketa merkittävästi 30. kesäkuuta 2018 tarkistetusta versiosta . tarkastukset vaativat 9 muokkausta .

Suhdekerroin on kahden ihmisen välisen sukulaisuuden (tai biologisen suhteen) mitta .

Sukusiitoskerroin voidaan laskea yksilölle ja se mittaa esi-isien vähentymisen astetta tietyn yksilön sukutaulussa.

Itse termin sukusiitoskerroin määritteli Sewell Wright vuonna 1922, ja se johdettiin vuonna 1921 laaditusta termin sukusiitoskerroin määritelmästä . Tätä mittaa käytetään yleisimmin genetiikassa ja sukututkimuksessa .

Yleensä mitä korkeampi sukusiitosaste on, sitä lähempänä suhdekerroin on yhtä, prosentteina ilmaistuna [1] , ja se on yleensä nolla henkilöillä, joilla on kaukaisia ​​yhteisiä esivanhempia.

Sukusiitoskerroin

Sukusiitoskerroin ("f") mittaa organismien sisäsiitosten aiheuttamien geneettisten (patogeneettisten) vaikutusten todennäköisyyttä, ja lisäksi se tulisi laskea etukäteen tunnettujen sukutaulujen (eli sukutaulujen täydellisyystietojen) perusteella. dokumentoidaan molempien risteytyneiden organismien sukututkimus (esimerkiksi etukäteen annetulla ja muuttumattomalla risteytysjärjestelmällä.) [2] Tämä mitta ilmaisee tietyn risteytysjärjestelmän tuloksena olevan homotsygoottisuuden odotetun prosenttiosuuden.

Jokaiselle geenille , jolla on yhtä yleisiä dominantteja ja resessiivisiä piirteitä A ja a , satunnainen risteytys johtaa 50 %:iin homotsygoottisista piirteistä (25 % AA -tyypistä ja 25 % aa -tyypistä ), ja läheisesti sisäsiittoisessa populaatiossa tämä arvo on 100 % (100 % tyyppi AA tai 100 % tyyppi aa ). Sukusiitoskerroin f on luku 0:sta (jos homotsygoottisuus on 50 %) 1:een (jos homotsygoottisuus on 100 %), jossa f = 2h -1, missä h  on todennäköisyys olla homotsygoottinen vain kyseiselle geenille .

On huomattava, että f on matemaattinen odotus kyseessä olevan geenin todennäköisyyspohjaisen Mendelin periytymislain läsnä ollessa. Kerrointa ei määritetä vain yhdestä organismista. Sukusiitoskerroin on tilastollinen arvo, joka on määritetty molempien organismien verilinjojen parametreistä, eikä tätä kerrointa voida laskea vain näiden kahden organismin genotyypeistä.

Kahden yksilön B ja C välinen suhdekerroin ("r") määritetään summaamalla kertoimet, jotka on laskettu kullekin sukulinjalle, johon heidän yhteiset esi-isänsä liittyvät. Jokainen tällainen linja yhdistää kaksi ihmistä jonkin yhteisen esi-isän kautta, kulkee erillisten ihmisten kautta, jotka eivät ole sukua useammin kuin kerran. Suhdekerroin esi-isän A ja jälkeläisen O välillä, erotettuna n sukupolven verran, määritellään seuraavasti:

p AO = 2 −n ⋅((1+ f A )/(1+ f O )) ½

jossa f B ja f O ovat A:n ja O:n sisäsiitoskertoimet.

Suhdekerroin r BC lasketaan tällä hetkellä lisäämällä kaikki polkukertoimet:

r BC = Σ p AB ⋅ p AC .

Olettaen, että sukutaulu voidaan jäljittää melko etäisiltä (tarkastelun kohteena olevasta geenistä) linjan osista ( f A = 0), r :n määritelmää voidaan yksinkertaistaa.

r BC = Σ p 2 − L ( p ) ,

jossa p luettelee kaikki mahdolliset polut, jotka yhdistävät B:n ja C:n sukupolviin, joilla on ainutlaatuiset yhteiset esi-isät (eli kaikki polut törmäävät kyseisten kahden sukutaulun yhteiseen esi-isään eivätkä välttämättä kulje esi-isän yhteisen esivanhemman tai yhteisen esi-isän kautta yhteinen esi-isä, sisältäen vain yhden yhteisen esi-isän annetussa polussa, ja L(p) on polun p pituus .

Esimerkki yksinkertaisimman ongelman ratkaisemisesta: Olettaen, että kahdella ihmisellä on (on) yksi 32 esi-isästä n = 5 sukupolvea sitten, mutta heillä ei ole yhteisiä esivanhempia neljän tai vähemmän sukupolven aikana, lasketaan heidän suhdekerroin r seuraa:

r = 2 n ⋅2 −2 n = 2 − n , mikä on, koska n = 5, r = 2 5 • 2 -10 = 2 -5 = 1/32 noin 0,0313 tai 3 %.

Yksilöillä, joille sama tilanne on kehittynyt suhteessa heidän 1024 esi-isänsä esimerkiksi kymmenen sukupolvea sitten, r :n arvo on r = 2 −10 = 0,1 %. Haluttu r :n arvo voidaan laskea muutaman prosentin tarkkuudella (jos molempien yksilöiden sukutaulut ovat tiedossa esim. jopa viiden sukupolven, neljä sukupolvea ja vielä sukupolvia sitten) syvyydellä, ja prosentin kymmenesosien tarkkuudella (jos kyseessä olevien sukutaulujen syvyys on vähintään kymmenen sukupolven ajalta). Jos yhteisten esivanhempien r :n haluttu arvo otetaan huomioon 20 sukupolvea sitten (joka voi vastata noin 500 vuoden aikaväliä ihmisen sukupuussa), niin keskiajalla eläneiden ihmisten yksittäiset geenit ovat jo mukana laskennassa. , ja kertoimen r arvo putoaa alle miljoonasosan).

Ihmissuhteet

Suhdekerrointa käytetään joskus ilmaisemaan sukulaisuusasteen numeerinen vastine ihmisen sukututkimuksessa .

Ihmissuhteissa suhdekertoimen arvo lasketaan sukupuun tietojen perusteella, joka kattaa suhteellisen pienen määrän sukupolvia - noin kolme tai neljä. Kuten edellä mainittiin, suhdekertoimen arvo lasketaan alarajaksi, joka voi olla useita prosentteja pienempi kuin todellinen arvo. Kertoimet voidaan määrittää 1 %:n tarkkuudella edellyttäen, että molempien henkilöiden sukutaulu on tiedossa seitsemännelle sukupolvelle. [3]

Tutkinto

suhteet

Suhteet Kerroin

suhteet (r)

Graafinen kaavio
0 identtiset kaksoset; klooneja 100 % [4] (1)
yksi vanhempi-lapsi [5] 50 % ( 2–1 )
2 sisarukset/sisarukset 50 % (2 -2 +2 -2 )
2 3/4 veljet/sisaret; 37,5 % (2 -2 +2⋅2 -4 )
2 isoisä/isoäiti ja pojanpoika/tyttärentytär 25 % ( 2–2 )
2 velipuoli/sisarukset 25 % ( 2–2 )
3 täti/setä ja veljenpoika/veljenpoika 25 % ( 2⋅2−3 )
neljä kahdesti serkut/sisaret 25 % (2 -3 +2 -3 )
GaryGlenda
AdamAgatha
BettyBenHelenHugh
DavidIrene
3 isoisoisä/isoisoäiti ja isolapsenpoika/isolapsenlapsentytär 12,5 % ( 2–3 )
neljä serkut/sisaret 12,5 % (2⋅2 −4 )
AdamAnna
LaskuttaaBettyCharlesCaroline
DavidEmma
6 neljä kertaa serkkuja 12,5 % (8⋅2 −6 )
6 kolme kertaa serkkuja 9,38 % (6⋅2 −6 )
neljä puoliserkut/sisarukset 6,25 % ( 2–4 )
5 isoveljenpojat/veljentyttäret tai isosedät/tätit 6,25 % (2⋅2 −5 )
AdamAnna
LaskuttaaBettyCharlesCaroline
DianaDavidEmma
Frank
6 kahdesti kakkosserkut 6,25 % (4⋅2 −6 )
6 serkut/sisarukset 3,13 % (2⋅2 −6 )
AdamAnna
LaskuttaaBettyCharlesCaroline
DianaDavidEmmaEric
FrankGloria
kahdeksan neljännet serkut/sisarukset 0,78 % (2⋅2 −8 )
AdamAnna
LaskuttaaBettyCharlesCaroline
DianaDavidEmmaEric
FrankFelicityGeorgeGloria
HarryIsabelle
kymmenen viidesserkut/sisarukset 0,20 % (2⋅2 −10 ) [6]

Useimmiten insestilait vaikuttavat suhteisiin, joissa r = 25% tai enemmän, vaikka monet jättävät huomiotta melko harvinaisen kaksoisserkkujen tapauksen. Joissakin maissa seksuaaliset suhteet tai avioliitot eriasteisten serkkujen tai vain adoption tai perinnön kautta läheisten henkilöiden välillä ovat kiellettyjä . Kaikkien hedelmöitysmahdollisuuksien olemassaolo jätetään yleensä huomiotta.

Katso myös

Viitteet

  1. ↑ tiukasti ottaen r=1 klooneille ja identtisille kaksosille, mutta koska r:n määritelmän tarkoituksena on yleensä arvioida kahden yksilön soveltuvuutta jalostukseen, ne katsotaan tyypillisesti vastakkaista sukupuolta oleviksi.
  2. ↑ "Arvoisimman sukusiitoskertoimen tulisi mitata mahdollisimman suoraan ne vaikutukset, joita keskimääräisesti odotetaan parittelujärjestelmältä tietyssä sukutaulussa."
  3. ↑ Seitsemän sukupolven täysi sukupuu (128 polkua 7. asteen esi-isille) on kohtuuton jopa korkea-aatelisille.
  4. ↑ Korvaamalla "sukupolven" määritelmässä käsite " meioos ".
  5. ↑ Sukulaisten valinta . Benjamin/Cummings. Haettu 25. marraskuuta 2007. Arkistoitu alkuperäisestä 17. toukokuuta 2015.
  6. ↑ Tämän asteen suhde on yleensä mahdoton erottaa suhteesta satunnaiseen yksilöön samassa populaatiossa (heimo, maa, etninen ryhmä).

Bibliografia