NevGen
Kokeneet kirjoittajat eivät ole vielä tarkistaneet sivun nykyistä versiota, ja se voi poiketa merkittävästi 21. tammikuuta 2020 tarkistetusta
versiosta . tarkastukset vaativat
4 muokkausta .
NevGen tai NevGen on yksi maailman haplogroup -ennustusprojekteista , ja se on kehitetty serbilaisen DNA-projektin ja Serbian sukututkimusseuran Poreklo- seuran johdolla . Kirjoittajat ovat Aco Nevsky (salanimi) ja Milos Cetkovich-Gentula. Ohjelma luotiin toukokuussa 2014 työpöytäsovellukseksi serbialaisten sukututkijoiden tarpeisiin, vuoden 2015 lopusta lähtien ohjelmasta on myös verkkoversio. NevGen käyttää kuntotietokonetta sekä Bayesin - alleelitaajuuden lähestymistapaa ennustaakseen, mikä haploryhmä vastaa Y-STR- haplotyyppiä . Lisäksi se käyttää eri STR-merkkien arvojen keskinäistä riippuvuutta laskettaessa haarautumistodennäköisyyksiä. Jatkuva edistyminen ja lukuisat tieteelliset artikkelit, joissa häntä on sovellettu, tekevät hänestä yhden maailman tunnetuimmista Y-DNA-haploryhmän ennustajista.
Sovellukset tieteessä
Käytetään seuraavissa tieteellisissä kirjoituksissa (luetteloa voidaan laajentaa):
- Dogan S., Babic N., Gurkan C., Goksu A., Marjanovic D., Hadziavdic V. Y-kromosomaalinen haploryhmäjakauma Bosnia ja Hertsegovinan Tuzlan kantonissa: Konkordanssitutkimus, jossa käytettiin neljää erilaista in silico -määritysalgoritmia, jotka perustuvat Y: ään -STR data (englanniksi) // Homo : päiväkirja. - 2016. - Vol. 67 , no. 6 . - s. 471-483 . - doi : 10.1016/j.jchb.2016.10.003 .
- Szargut M., Ossowski A., Kuś M., Zielińska G., Rębacz-Maron E. Haplogroup-ennustus eri Y-STR-pohjaisilla työkaluilla näytteissä Tansanian yhdistyneestä tasavallasta (englanniksi) : Journal. - 2016. - doi : 10.13140/RG.2.2.25831.04003 .
- Mustafin KK, Alborova IE, Semenov AS, Vishnevsky VP Haplogroup Analysis for a Medieval Russian Burial оf 16th-17th Centures in Radonezh (Moskovan alue) (englanniksi) // Studia Slavica et Balcanica Petropolitana : Journal. - 2018. - Vol. 24 , ei. 2 . - s. 169-180 . - doi : 10.21638/spbu19.2018.209 .
- Diepenbroek M., Cytacka S., Szargut M., Arciszewska J., Zielińska G., Ossowski A. Ihmisen Y-kromosomin miesspesifisen alueen analyysi valaisee historiallisia tapahtumia natsien miehittämässä Itä-Puolassa (englanniksi) // International Journal oikeuslääketiede: lehti. - 2018. - s. 395-409 . - doi : 10.1007/s00414-018-1943-0 .
- Poriswanish N., Neumann R., Wetton JH, Wagstaff J., Larmuseau MH, Jobling MA, toukokuu, CA Rekombinaatiopisteet laajennetussa ihmisen pseudoautosomaalisessa domeenissa, jotka on ennustettu kaksijuosteisista katkeamiskartoista ja karakterisoitu siittiöpohjaisella crossover-analyysillä (eng. ) // PLoS-genetiikka : päiväkirja. - 2018. - Vol. 14 , ei. 10 . - doi : 10.1371/journal.pgen.1007680 .
- Kačar T., Stamenković G., Blagojević J., Krtinić J., Mijović D., Marjanović D. Y-kromosomin geneettiset tiedot, jotka määritellään 23 lyhyellä tandemtoistolla Serbian populaatiossa Balkanin niemimaalla (englanniksi) // Ihmisen biologian Annals : päiväkirja. - 2019. - Vol. 46 , nro. 1 . - s. 77-83 . - doi : 10.1080/03014460.2019.1584242 .
- Al-Snan NR, Messaoudi SA, Khubrani YM, Wetton JH, Jobling MA, Bakhiet M. Genetic variation at 27 y-strs in four regions of Bahrain // bioRxiv : Journal. - 2019. - doi : 10.1101/787341 .
- Kiesler KM, Andreaggi KS, Ring JD, Taylor CR, Marshall CK, Vallone PM Täyden mitokondrioiden genomien sekvensointi NIST-populaationäytteille (määrittämätön) // Forensic Science International: Genetics Supplement Series. - 2019. - S. 452-453 .
- López-Ramírez YL, Aguilar-Velázquez JA, López-Armenta M., Ruiz-Hernández M., Rangel-Villalobos H. Isän sukulinjat ja oikeuslääketieteelliset parametrit perustuvat 23 Y-STR:ään (Powerplex® Y23) Mestizo-uroksissa (México City ) englanti) // Kansainvälinen oikeuslääketieteen lehti: aikakauslehti. - 2019. - s. 199-202 . - doi : 10.1007/s00414-019-02183-1 .
- Szargut M., Diepenbroek M., Zielińska G., Cytacka S., Arciszewska J., Jałowińska K., Ossowski A. Onko MPS aina vastaus? Kahden PCR-pohjaisen menetelmän käyttö Y-kromosomaalisen haplotyypin määrittämiseen erittäin ja kohtalaisesti hajoamassa luumateriaalissa // Forensic Science International: Genetics : päiväkirja. - 2019. - s. 181-189 . - doi : 10.1016/j.fsigen.2019.07.016 .
- Daniels-Higginbotham J., Gorden EM, Farmer SK, Spatola B., Damann F., Bellantoni N., Parson W. DNA-testaus paljastaa Griswoldiin Connecticutissa haudatun 1800-luvun vampyyrin JB55:n oletetun identiteetin // Genes :journal . - 2019. - s. 1-11 . - doi : 10.3390/genes10090636 .
- Jannuzzi J., Ribeiro J., Alho C., Arão G., Cicarelli R., Corrêa H., Mota MF Miespuoliset sukulinjat brasilialaisissa populaatioissa ja haploryhmän ennustustyökalujen suorituskyky // Forensic Science International: Genetics : päiväkirja. - 2020. - Vol. 44 . - doi : 10.1016/j.fsigen.2019.102163 .
- Fóthi E., Gonzalez A., Fehér T., et ai. Miespuolisten unkarilaisten valloittajien geneettinen analyysi: valloittavien unkarilaisten heimojen eurooppalaiset ja aasialaiset isälinjat (englanniksi) // Archaeol Anthropol Sci : Journal. - 2020. - Vol. 12 , ei. 31 . - s. 77-83 . - doi : 10.1007/s12520-019-00996-0 .
Katso myös
Linkit