Nitraattireduktaasi on yksi typen aineenvaihdunnan tärkeimmistä entsyymeistä. Sen tehtävänä on pelkistää nitraatti-ioni nitriitti -ioniksi . Proteiini itsessään koostuu useista domeeneista: ensimmäinen, FAD :n sisältävä domeeni, on suunniteltu vastaanottamaan elektroneja ja siirtämään niitä edelleen sytokromi b 557 :ään , josta ne puolestaan pääsevät molybdopteriiniin (molybdeenipitoinen koentsyymi ). Samanaikaisesti molybdeeniatomi muuttaa hapetustilaansa +6:sta +4:ään ja sitten hapettuessaan jälleen antaa kaksi elektronia nitraatti- ionille , minkä jälkeen se pelkistyy nitriitti-ioniksi ja vedeksi. NADH +H + toimii elektronin luovuttajana nitraattireduktaasille kasveissa , NADPH +H + :lle sienissä ja pelkistetylle ferredoksiinille bakteereissa . Yllä olevassa reaktiossa tuotettu nitriitti toimii substraattina nitriittireduktaasille lisäpelkistystä varten. Nitraattireduktaasi on aktiivinen kasveissa vain plastideissa . Toisin kuin nitriittireduktaasilla, sillä on alhainen katalysoitu reaktionopeus.