Santa Apolónia Station ( port. Santa Apolónia ) on rautatieasema Lissabonin kaupungissa ( Portugali ) .
Santa Apolonia on Lissabonin vanhin rautatieasema, joka avattiin 1. toukokuuta 1865 . Se sijaitsee historiallisen Alfaman alueen välissä St. Georgen kukkulan ja Tejojoen rinteessä . Rossion aseman valmistuttua vuonna 1890 se menetti merkityksensä Lissabonin pääasemana; kuitenkin sen jälkeen kun kaupungin rautatieverkosto järjestettiin uudelleen 1900-luvun puolivälissä, siitä tuli jälleen Portugalin pääkaupungin de facto päärautatieasema.
Nykyään suurin osa Lissaboniin saapuvista pitkän matkan junista kulkee koillislinjaa pitkin, jonka varrella 6,5 km Santa Apoloniasta on vuonna 1998 rakennettu moderni Orienten asema . Useimmat junat, jotka ovat pysähtyneet Orientiin, saapuvat kuitenkin Santa Apolonian asemalle.