2068 vuosi. Salaperäinen signaali Marsista on löydetty . Spectrum International Security Organization lähetti kapteeni Scarletin ja kapteeni Blackin tutkimaan näitä signaaleja. Saavuttuaan punaiselle planeetalle agentit pääsivät Marsin pinnalle muukalaisella mönkijällä "Bizon". Pian he löysivät signaalien lähteen: se osoittautui vieraskaupungiksi, joka toteutui hämmästyneiden ihmisten edessä. Muukalaiset lähettivät skannerin tutkimaan maan asukkaita, mutta kapteeni Black päätti, että lähetetty esine oli elävä ammus ja ampui häntä kohti raketin, jonka räjähdys tuhosi kaupungin täysin. Mutta muukalainen kaupunki toipui pian. Kaupunkien asukkaat, mysteronit, kostavat: he tappavat Blackin ja julistavat sodan maan päälle. Scarlet palasi maan päälle kuolleen toverinsa kanssa. Vainajalle järjestetään hautajaiset Spectrum-agenttien ja kapteeni Blackin menehtyneen tyttöystävän Destinyn läsnä ollessa. Myöhemmin Spectrumin päällikkö eversti White isännöi YK:n konferenssia keskustellakseen Mysteronin uhasta. Mutta alienit ottavat kapteeni Scarletin hallintaansa työskennelläkseen heille, sillä kapteeni on nyt tuhoaseen. Scarlet meni suunnitteluosastolle vahingoittamaan moottoreita, jotka pitävät tukikohta-aluksen ilmassa. Luutnantti Green huomasi, että tukikohdassa oli jotain vialla. Kapteeni Blue meni Scarletin perään pysäyttääkseen hänet. Kapteeni Bluen laukaus sai Scarletin putoamaan suurelta korkeudelta ja putoamaan energiakanavan läpi putoamisen aikana. Scarlet on kuollut. Mutta kehon uudelleenluomisen tuloksena saatu kyky retrometabolismiin teki kapteenista haavoittumattoman. Hän "herättää kuolleista", mutta nyt salakavalaisilla muukalaisilla ei ole valtaa Scarletiin. Hänet otetaan säilöön. Samaan aikaan Mysteronit elvyttävät kapteeni Blackin uudeksi agentiksi. Scarlet aistii tämän ja pakenee turvasta, mutta hän ei pysty pysäyttämään Blackia.
Kapteeni Black varastaa ydinpolttoainetta, joka kuuluu sotilastutkimuksen keskukselle. Eversti White lähettää kapteeni Scarletin ja kapteeni Bluen tekemään yhteistyötä FBI:n kanssa kansainväliseksi terroristiksi julistetun kapteeni Blackin etsimiseksi. Samaan aikaan entinen Spectrum-agentti soluttautui YK:n torniin, joka isännöi konferenssia Mysteron-uhkasta ja muutti Venäjän edustajasta eversti Zamatevista "ulkopuoliseksi". Kun konferenssissa keskusteltiin kysymyksistä puolustamisesta vihollista vastaan, Zamatev sanoi aikovansa lähettää vampyyreiden laivueen Spectrumiin vartioimaan tukikohtaa. Tajuttuaan eversti Whiten hengen olevan vaarassa kapteeni Blackilta, Scarlet ja Blue lensivät suoraan YK:n torniin ja kun Black otti tähtäyksen, Scarlet hyppäsi ikkunan läpi ja ampui laukauksen, jonka piti tappaa Spectrum Commander. Destiny löysi Blackin ja vei hänet aseella, mutta hänen tunteensa voittivat hänet ja Black pakeni. Uskoen, että Spectrum on virheensä vuoksi menettänyt mahdollisuuden tuhota vihollinen, Destiny päättää jättää Spectrumin. Kapteeni Black tuhoaa venäläisiä hävittäjiä kuljettaneen ajoneuvon ja herättää heidät henkiin Mysteronien agenteiksi. Scarlet ja Blue tajuavat, että Black varastaa ydinpolttoainetta kaikkialta maailmasta ja kuljettaa sitä Siperiaan, ja heidät lähetetään pysäyttämään hänet. Vampyyrilentueet hyökkäävät tukikohtaan, mutta enkelit torjuvat heidän hyökkäyksensä. Mysteronit kuitenkin ottavat Destinyn koneen hallintaansa ja asettavat sen törmäyskurssille tukikohdan kanssa. Samaan aikaan kapteeni Black vangitsi Scarletin ja kertoi hänelle, että hän oli kerännyt tarpeeksi polttoainetta luodakseen pommin, joka tuhoaisi puolet maapallosta.
Yhdysvaltain ilmavoimien kuljetuskone löydettiin törmäyskurssilta tukikohdan kanssa. Eversti White käskee enkeleitä sieppaamaan lentokoneen ja tuhoamaan sen, jos se ei vastaa pyyntöön poiketa kurssilta. Destiny ampuu alas lentokoneen. Räjähdys vapauttaa kuitenkin hyönteisparven, joka ympäröi Destiny Interceptoria. Virheet pääsevät koneeseen konehuoneen kautta ja alkavat välittömästi tuhota sen järjestelmiä. Destiny erottaa hätäohjaamon, kun hyönteiset ovat tuhonneet Interceptorin moottorit, mutta olennot tarttuvat ajoneuvon runkoon ja alkavat pureskella metallia päästäkseen sisälle. Destiny tajuaa, ettei hän voi laskeutua tukikohtaan, joten hän päättää kaatua saadakseen selville, että hyönteiset vaurioittivat hänen laskuvarjoaan. Kapteeni Scarlet käskee Destinyä hyppäämään koneesta joka tapauksessa. Tyttö hyppää ja lentää alustan ohi, josta Scarlet sitten hyppää. Saavutettuaan putoavan Destinyn Scarlet tarttuu häneen ja avaa laskuvarjonsa. Molemmat laskeutuvat onnistuneesti. Myöhemmin eversti White ilmoittaa agenteilleen, että kuljetuskone sisälsi lastin kokeellisia kyberbugeja, jotka Mysteronit olivat vangiksineet. Uskoen, että uhka on eliminoitu, Destiny palaa huoneeseensa tietämättä, että hänen G-pukuun on piiloutunut yksikin bugi. Tämä olento lisää itseään luoden massiivisen parven, joka soluttautuu nopeasti kaikkiin tukikohdan järjestelmiin; Bugit vangitsevat nukkuvan luutnantti Greenin ja sotkevat hänet aineeseen, jonka ansiosta ne pääsivät tunkeutumaan hänen aivoihinsa saadakseen selville, missä atomireaktori sijaitsee tukikohdassa...
Kun Spektri menettää yhteyden Marsin Elysiumin asemaan, eversti White lähettää sinne kapteeni Scarletin, kapteeni Bluen, tohtori Goldin, Destinyn ja Harmonyn. Saavuttuaan Marsin kiertoradalle joukkue lähetetään planeetan pinnalle avaruusaluksella, mutta alus joutuu rakettihyökkäyksen kohteeksi asemalta. Destiny pystyi laskeutumaan, mutta avaruusalus vaurioitui pahasti; ainoa paikka yöpyä oli Elysiumin asema, joka oli Mysteronien hallinnassa. Kapteeni Scarletin johtama joukkue Buffalossa menee suoraan sinne. Matkalla mönkijä törmäsi Bisoniin, joka kuului Elysiumille. Siitä löydettiin kolme miehistön jäsentä, jotka kuolivat hapenpuutteesta ja ilmeisesti pakenivat asemalta. Paikalle saapuessaan ryhmä huomaa, että Spectrumin vapaaehtoishenkilökunnan jäljellä olevat jäsenet on kaikki murhattu julmasti. Destiny ja Harmony yrittävät päästä Marsin tukialukselle, ja kun he saapuvat sinne, he saavat tietää, että sen järjestelmät ovat vaurioituneet. Spectrum-tiimi löytää pian sabotöörin: se osoittautuu vihamielisiin ympäristöihin suunniteltu ja tarkoitettu automaattiseksi tiedustelurobotiksi, jonka Mysteronit ovat vangiksineet ja muutettu tappokoneeksi. Käyttämällä Captain Blueta syöttinä Scarlet houkuttelee robotin ulos, hyppää sen päälle kuin hevosen ja tuhoaa sen magneettisella räjähteellä. Scarlet ja Blue kuitenkin saavat tietää, että on olemassa toinen robotti, jota myös hallitsevat Mysteronit ja että se on matkalla kohti Destinyä...
Tuntematon esine pääsee maan ilmakehään. Eversti White määräsi enkelit lähetettäväksi hänen luokseen. Lentäjät päättävät, että esine on vanha avaruuskapseli, joka on matkalla pohjoisnavalle. Kapteeni Scarlet ja kapteeni Blue matkustavat sinne ja saavat selville, että pakokotelo kuuluu Jupiteriin suuntautuvalle Endeavour II -matkalle, joka katosi mystisesti viisitoista vuotta sitten. Astuessaan sisään Scarlet ja Blue saavat selville, että kaksi kolmen hengen tiimin jäsentä on kuollut kryokammioissaan; kolmas jäsen on kuitenkin edelleen elossa. Se osoittautui komentaja Lewisiksi, luutnantti Greenin isäksi. Lewis lähetettiin tukikohtaan, jossa tohtori Gold tutki hänet, mutta Lewis osoittautui Mysteronien kaksoiskappaleeksi, ja kun Gold yritti ottaa häneltä verinäytteitä DNA:n testaamiseksi, Lewis hypnotisoi lääkärin ja pakottaa hänet ottaa näyte itsestään. Tiedot on väärennetty, Lewis palasi tyttärelleen Sirenalle. Hän on mukana avaruusjärjestössä New Mexicossa, eikä tiedä, että hänen "isänsä" aikoo räjäyttää reaktorin, jättimäisen räjähdyksen, joka jättää vain savureiän Kaliforniasta Texasiin...
Kapteeni Blue ja Angel Destiny ohjaavat Mercury-avaruusalusta, joka kuului Kansainväliselle avaruusjärjestölle huippusalaisessa avaruustehtävässä. Heidän on lähetettävä Maan kiertoradalle uusi satelliitti, joka antaa varoitussignaaleja lähestyvästä hyökkäyksestä tunnistamalla energiaa Marsissa. Heti kun Mercury saavutti kiertoradalle, aluksen hallinta siirtyi kuitenkin jonkin ulkopuolisen voiman johdosta ja sen järjestelmä määritti uuden lentoradan. Sillä välin Spectrum vastaanottaa televisiolähetyksen tuntemattomalta kiristäjältä, joka vaatii 50 miljoonan dollarin lunnaita timanteista tai Mercury alkaa palata ilmakehään Pohjois-Amerikan yllä ja kaataa aluksen Washingtoniin. Kapteeni Scarlet lähetetään avaruussatamaan tutkimaan. Saapuessaan hän saa tietää tohtori Celine Kopalskilta, että kapteeni Black on avaruussataman juurella. Scarlet jäljittää Mysteron-agentin, mutta hän pakenee Scarlet's Cheetahilla. Kapteeni jahtaa pakolaista helikopterilla, kunnes Harmony saapuu Interceptorilla ja tuhoaa kapteeni Blackin laukauksella koneesta. Blue ja Destiny saavat tietää, että Yhdysvaltain hallitus suostuu lunastamaan heidät. Tohtori Kopalski valittiin jättämään timantit määrättyyn paikkaan, joka osoittautui Prosperityn hylätyksi kaivoskaupungiksi. Kopalski osoittautui kuitenkin sabotoijaksi: hän vaihtoi salkkuja ja varasti timantit. Mutta kun Kopalski palasi kotiin väärin hankituilla tuloilla, kapteeni Black tuli hänen luokseen ja hypnotisoi hänet ja varasti avaruusalusjärjestelmää ohjaavan navigointitietokoneen. Black hankkii kannettavan tietokoneen ja käyttää sitä asettaakseen Mercuryn törmäyskurssille Valkoisen talon kanssa...
Lomallaan kyllästynyt Destiny päättää osallistua lentonäytökseen muiden enkelien kanssa lentotukikohdassa Etelä-Englannissa. Mutta kun joukkue suorittaa henkeäsalpaavan taitoharjoittelun, kapteeni Black ilmestyy ja Mysteron-laitteen avulla sammuttaa kaikki digitaaliset elektroniikkajärjestelmät alueella. Kun Angel Interceptorsin järjestelmät karkaavat hallinnasta, Harmonyn kone lentää liian lähelle Destinyn konetta ja vahingoittaa sen siipeä; Harmony onnistuu karkaamaan ennen koneen syöksymistä. Destiny muuttuu avuttomaksi, kun hänen sieppaajansa viedään törmäyskurssille Control Towerin kanssa. Viime hetkellä Black kuitenkin deaktivoi laitteen ja Destiny tekee turvallisen laskun. Eversti White on huolissaan tapahtuneesta, koska epäonnistumisen toistuminen voi aiheuttaa vakavia seurauksia planeetalle. Hän sanoo, että alueilla, joilla poikkeavuuksia esiintyi, alkoi ilmestyä viljaympyröitä. Kapteeni Scarlet ja kapteeni Blue lähetetään Hummingbird-helikopterilla tutkimaan ilmiötä. Laskeutumispaikka on ympyrä, joka sijaitsee anomaliavyöhykkeen matemaattisessa keskustassa, mutta agenttien saapuessa he näkevät ympyrän kadonneen mystisesti. Scarlet tuntee yhtäkkiä pahoinvointia, mikä osoittaa Mysteronien läsnäolon lähellä, sitten Blue huomaa, että kaikki Hummingbirdin järjestelmät ovat sammuneet. Heidän ympärillään oleva kenttäympyrä ilmestyy yhtäkkiä ja syöksyy maan alle agenttien ja heidän helikopterinsa mukana. Kuilun alaosassa he kohtaavat kasvotusten kapteeni Blackin kanssa. Hänen kauttaan Mysteronit sanovat, että ihmiskunnan tulee antautua 24 tunnin sisällä, muuten he aiheuttavat maailmanlaajuisen ihmisen aiheuttaman katastrofin, joka tuhoaa koko ihmiskunnan...
Lumisella vuorensolalla kapteeni Black päästää lumivyöryn ja tuhoaa kuorma-auton, joka sisältää vallankumouksellista uutta kemiallista yhdistettä. Jonkin aikaa myöhemmin Afrikan autiomaassa kapteeni Scarlet auttaa professori Susan Toddia Hydrolabista kokeellisessa projektissa, jolla edistetään sadetta. Sen jälkeen, kun Angel Interceptors on vapauttanut erityistä kemiallista yhdistettä ilmakehään, massa raskaita pilviä ilmaantuu nopeasti ja sade alkaa sataa kuivalle aavikon tasangolle. Todd tanssii kiihkeästi ja iloisesti sateessa. Seuraavana päivänä hän ja Scarlet palaavat tukikohtaan tapaamaan Susanin kollegaa, professori Vandammin, mutta kun Todd ilmestyy Spectrumin päämajaan, hän alkaa hallusinoida. Vainoharhaisuuden merkkejä osoittava Todd vetää aseen Scarletista, ampuu eversti Whiten ja lyö häntä käsivarteen. Sitten hän ottaa professori Vandammin panttivangiksi ja vaatii, että hänet viedään välittömästi pois tukikohdasta. Destiny yrittää pysäyttää Susanin, mutta vahingossa tapahtuva kaatuminen aiheuttaa Toddin kuoleman. Vandamm uskoo, että dementia johtui ylimääräisestä kovasta työstä, mutta White epäilee jotain ja antaa Scarletille tehtäväksi tutkia kokeen paikkaa, kun hän itse palaa Hydrolabiin Vandammin kanssa. Scarlet katselee videomateriaalia kokemuksesta ja löytää parven surikaatteja, jotka ovat myös jääneet kiinni sateeseen. Hän löytää eläimet nopeasti, mutta ne kaikki tappoi yksi eläin laumastaan, josta tuli jostain syystä aggressiivinen ja peloissaan. Scarlet kertoo Whitelle, että Mysteronit vaikuttivat jollain tavalla Hydrolab-kokeeseen, ja jos seuraava koe suoritetaan, tuhannet ihmiset alkavat tappaa toisiaan. Eversti White löytää Hydrolabin työntekijöiden joukosta kapteeni Blackin, joka hiljaa ilmestyessään hämmästytti komentajan välittömästi. Scarlet menettää yhteyden häneen, ja sillä välin Hydra Condor -kone lähetetään tehtävälle stimuloida sadetta vaarallisten kemikaalien avulla ...
Kapteeni Scarlet ja Destiny pitävät tauon kiipeäessään. He kiipeävät korkealle vuorelle erämaassa ja ihailevat sieltä avautuvaa näkymää ilolla. Eversti White ilmoittaa Destinylle, että Aerospace Research Division on valinnut hänet tehtävänohjaustarkastukseen. Kun Destiny ajaa kohti Falconin lentotukikohtaa, hänet ohittaa auto, joka suistuu tieltä ja kaatuu. Tyttö ryntäsi auttamaan, mutta kun hän löytää tyhjän auton, hän tajuaa liian myöhään, että se oli ansa. Pian hänet vangittiin kapteeni Black. Myöhemmin Destiny murtautuu kansainväliseen puolustuspäämajaan ja varastaa ohjuksen laukaisukoodit. Vartija löytää hänet, mutta Destiny hakkaa häntä pahasti. Kun White näyttää Scarletille videomateriaalia tapahtumasta. Kapteeni on hyvin järkyttynyt, koska hänen rakastamansa tyttö ei ole enää siellä ja nyt hän on Mysteronien vallan alla. Hän ei kuitenkaan tiedä, että rikoksen todella teki Gina Martinelli, josta tehtiin Destinyn kaksoiskappale saksalaisen tiedemiehen herra Januksen luomalla laitteella. Black pitää todellisen Destinyn Janus-klinikalla ja pakottaa tiedemiehen antamaan hänelle keksinnön, jonka hän käyttää tuhotakseen tukikohdan replikantin Gina Martinellin avulla Destinyn varjossa ...
Etäkahvilassa Phoenixissa, Arizonassa, Spectrumin lentoinsinööri Xander Storey ottaa yhteyttä kahteen Mysteron-agenttiin. Story suostuu tuhoamaan Spectrum-tukikohdan vastineeksi alienien lupauksesta lopettaa sodan maan asukkaita vastaan ja rahapalkinnosta. Hän haluaa lähteä, kun kapteeni Scarlet ryntää ruokalaan aseella, mutta agentti ammutaan kuoliaaksi. Mysteronit tietävät, että kapteeni palaa pian henkiin, ja sitovat Scarletin pylvääseen ja sieppaavat öljyauton ja vievät hänet ruokalaan. Räjähdys tuhosi rakennuksen täysin. Kapteeni Blue löytää kumppaninsa tuhoutuneen ruumiin ja tuo sen tukikohtaan. Tohtori Goldin mielestä vaurio on liian vakava eikä siinä ole merkkejä retrometabolismista. Hän joutuu julistamaan Scarletin kuolleeksi. Kun Destiny ja Blue surevat ystävänsä menetystä, Story saapuu tukikohtaan pommi kätkettynä työkalukoteloonsa. Samaan aikaan sairaalassa Scarlet tulee tajuihinsa, mutta käy ilmi, että kukaan ei näe tai kuule häntä ja että Kapteenista on jotenkin tullut aineeton - hän on kuin haamu...
Skotlannin vuoristossa iäkäs nainen, rouva Mackenzie, on huolestunut Grampianin ydinvoimalan läheltä ohitettujen vihreiden valojen ilmaantumisesta. hän raportoi tapauksesta viranomaisille, mutta kukaan ei usko häntä. Kun eversti White saa tietää tapauksesta, hän lähettää välittömästi kapteeni Scarletin tutkimaan voimalaitosta ja määrää Angela Harmonyn, joka tuolloin ohjasi Spectrum Flight Schoolissa, käymään Mistress Mackenzien luona. Yhdessä Gadget Johnsonin kanssa Harmony lentää taloon Hummingbird-helikopterilla tietämättä, että hänen kollegansa on juuri korvattu Mysteronilla. Voimalaitoksella Scarletille kerrotaan, että yksikään neljäsataa työntekijää ei nähnyt mitään poikkeavaa; sillä välin Harmony näkee, että Mistress Mackenzien talo on kunnossa, mutta sitten Johnson hyökkää hänen kimppuunsa, mutta hän onnistuu puolustamaan itseään. Sitten emäntä Mackenzie ryntää Harmonyn luo ja voittaa hänet. Mysteronit pyytävät Harmonyn kertomaan eversti Whitelle, että kaikki on hyvin, mutta hän lähettää koodatun hälytyksen. White laittaa Spectrumin hätätilaan ja lähettää Scarletin rouva Mackenzien taloon. Mysteronit kuitenkin järjestivät huolellisesti tämän tapahtumaketjun, joka halusi kidnapata Rhyno Scarletin ja käyttää hänen raskaita aseitaan ydinvoimalan räjäyttämiseen...
Eversti White syö illallista ravintolassa tyttärensä Victorian kanssa. Luutnantti Green raportoi, että Yhdysvaltain ilmavoimien Little Marwoodin tukikohdasta varastettu lentokone haluaa räjäyttää ydinvoimalan Schleswig-Holsteinissa, Saksassa. Yhdessä henkivartijoiden kapteeni Scarletin ja Destinyn kanssa kapteeni Blue and White lähti Hummingbird-helikopterilla takaa-amaan varastettua konetta; he tapaavat pian Angel Interceptors ja varastettu vampyyri tuhoutuu pian. Vaikka Spectrumin huomio kuitenkin hajaantui, kolme ihmistä sieppaavat Victorian ja ottavat panttivangiksi. Kun Whiten vaimo Diana lähettää hänelle siitä videoviestin, eversti lähtee välittömästi tukikohdasta Stallionin ratsastusmoottoripyörällä ja suuntaa kotiin; siellä sieppaajat ottavat yhteyttä häneen, jotka uhkaavat olla tappamatta Victoriaa, jos White Rhynon avulla auttaa heitä hyökkäämään panssaroidun erikoisjunan kimppuun matkalla Pariisiin, jotta he voivat varastaa hänen lastinsa miljardi dollaria kultaharkkoja. Valkoisella ei ole muuta vaihtoehtoa kuin suostua, mutta hän ei tiedä, että kaikkia sieppaajien toimia johtaa kapteeni Black ja että hän haluaa heikentää Whiten uskoa, jotta eversti vapautetaan spektrin komennosta ... Akhilleuksen sanansaattaja
Spectrumin koulutuskeskuksessa, joka sijaitsee Balmeathin linnassa Skotlannissa, kapteeni Scarlet ja Angel Destiny joutuvat koetukselle kuulustelun sitkeydestä ja psykologisesta profiilista. Skotlantilaisten tukikohtatyöntekijöiden epäammattimaisuuteen kyllästynyt Scarlet pakenee hetkeä paranneltuaan sellistä ja vapauttaa Destinyn. Yhdessä he pakenevat moottoripyörällä, mikä suututtaa suuresti tukikohdan komentajaa, kylmää Astrid Wintersiä. Myöhemmin samana yönä Winters kuoli auto-onnettomuudessa Mysteronien ohjaamassa ja syntyi uudelleen replikanttina; palatessaan tukikohtaan kapteeni Scarletin tappamisen sijaan Winters sanoo kuitenkin edustavansa sitä osaa mysteroneista, jotka uskovat sodan Maan kanssa olevan virhe. Hän tarjoutuu välittämään tietoa mysteronien kukistamisesta, mutta vaatii itsepäisesti välittävänsä sen vain eversti Whitelle henkilökohtaisesti; Todisteena hyvistä aikomuksistaan hän paljastaa myös, että Mysteronit suunnittelevat tappavansa maapallon tieteellisen eliitin World Science Congressissa. Epävarma pitäisikö todella luottaa Winteriin, White lähettää kapteeni Bluen ja kapteeni Ocherin tutkimaan konferenssia ja määrää Scarletin suojelemaan Wintersiä hänen ollessaan linnassa. Samaan aikaan saatuaan tietää Wintersin petollisista aikeista Mysteronit lähettävät joukon replikanttejaan hyökkäämään linnaan taisteluhelikoptereilla...
Nevadan organismintutkimuskeskuksessa Mysteronit tartuttavat tarkoituksella tohtori Michael Kingin ja hänen avustajansa Dana Parrishin mutatoidulla versiolla Ruthersin taudista. Nämä tiedemiehet kuolevat muutamassa sekunnissa, kunnes heidät herätetään henkiin replikantteina, joista jokainen voi tappaa ihmisen yhdellä kosketuksella. myöhemmin Spectrumin henkilökunta seuraa näitä pahaenteisiä tapahtumia turvalokin kautta. Eversti White antaa välittömästi kapteeni Scarletin ja kapteeni Bluen tehtäväksi löytää kadonneet tiedemiehet; kuitenkin Scarlet, joka näki mysteronien luovan replikantin, epäilee nyt hänen olemuksensa olevan ihminen. Vieraillessaan tohtori Kingin vaimon luona Scarlet ja Blue törmäävät Dan Lloydiin, Danan poikaystävään, ammattitoimittajaan. Dana pakenee moottoripyörällä, Scarlet jahtaa häntä Cheetahilla; pian hän saa hänet kiinni, Dana onnistui pakenemaan takaa-ajoaan ja hän katoaa läheisen kaupungin kaduille. Blue Laken rannalla sijaitsevassa majassa King onnistuu välttämään tappavan kontaktin ja vangitsee Mysteronin - replikantti putoaa kotan kellariin. King viedään tukikohtaan, jossa Scarlet ja White kysyvät häneltä, missä Dana on. mutta Mysteronit käyttävät Kingiä viestintävälineenä ja julistettuaan sodan Maan päälle vastauksena ihmiskunnan hyökkäykseen heidän tukikohtaansa vastaan, he pakottavat Kingin kuolemaan - ruumis hajoaa atomeiksi. Dana vierailee Lloydin luona ja tappaa hänet suudelmalla, jolloin Mysteronit voivat herättää toimittajan henkiin toiseksi viruksia kantavaksi agentiksi. Tukikohdassa kapteeni Scarlet toteuttaa Mysteronien todellisen suunnitelman: käyttämällä Danaa poikaystävänsä hankkimiseen, heillä on täydellinen tapa salamurhaan: toimittajan piti haastatella Amerikan yhdysvaltojen presidenttiä...
Saatuaan tarkastuksensa Spectrum Base -tukikohdassa Yhdysvaltain ulkoministeri palaa toimistoonsa New Yorkiin enkelien saattajana, joiden kimppuun hyökkäävät pian matkalla kolme vihollisen Vampire-suihkukonetta. Vaikka enkelit tuhosivat nopeasti vastustajansa, Destiny pakeni niukasti kuolemalta, kun hänen koneensa vaurioitui ja syöksyi mereen. Destiny tuotiin tukikohtaan, tohtori Gold tutki ja kertoi, että Destinyn täytyisi viettää kolmekymmentäkuusi tuntia sairaalassa toipuakseen. Sillä välin Yhdysvaltain erityisturvallisuusneuvoston jäsen Miguel Fernandez työskenteli merenrantakodissaan Espanjassa ja sai salaperäisen postin. Kun Fernandez luki sen, jokin sai hänet menemään transsiin, menemään mereen ja hukkumaan. Jäljitettyään yhteyden Fernandezin itsemurhan ja toisen turvallisuusneuvoston jäsenen välillä eversti White lähetti kapteeni Scarletin ja kapteeni Bluen tutkimaan asiaa. Kun kapteeni Blue tarkasti Fernandezin tietokoneen, hänkin luki postin ja sai viruksia. Kapteeni Scarlet, tietämättä mitä on tapahtunut, Scarlet pyytää Bluea siirtämään tietokoneen sisällön tukikohtaan tutkittavaksi, jolloin virus voi tartuttaa koko Spectrumin henkilöstön tietokoneen näyttöjen kautta. Kapteeni Scarlett ja kapteeni Blue olivat palaamassa takaisin Cheetahilla, mutta viruksen vaikutuksen alainen Blue ajoi auton kallion reunalle...
Spectrum havaitsee valtavan tuntemattoman avaruusaluksen Marsista törmäyskurssilla Maahan. Eversti White käskee Angelia pysäyttämään hänet. Sieppausohjushyökkäykset ovat tehottomia. Se on hyvin samanlainen kuin Mysterons. Laiva suuntaa kohti tukikohtaa, mutta muuttaa kurssia viime hetkellä ja lähtee Pohjois-Australiaan. Kapteeni Scarlet, kapteeni Blue, Ocher ja Gray menevät alukselle ja saapuvat pian paikkaan, jossa avaruusalus on laskeutunut. Kun Spectrum-miehistö lähestyy laivaa, heidät teleportoidaan yhtäkkiä sisälle, ja he pääsevät täysin surrealistiseen ja fantasiaympäristöön, jota kukaan ihminen ei ole koskaan nähnyt. Kuitenkin, kun agentit alkavat tutkia salaperäisiä ilmiöitä lentävän lautasen sisällä, heistä tulee tahattomasti mysteronien heille valmistamien mielipelien uhreja...
Kapteeni Black ajaa kuorma-autoa Jäämeren yli Venäjällä. Kapteeni Scarlet jahtaa häntä Rhynolla. Musta tapaa ryhmän Venäjän laivastodivisioonan miehiä ja ottaa vastaan orgaanisen magneettimiinan. Mysteron-agentti kieltäytyy maksamasta tavaroita ja tappaa venäläiset. Arktinen myrsky lähestyy ja Black kiirehtii pois, mutta Scarlet katkaisee hänet räjäyttämällä sillan Rhynon raketteilla. Black yrittää juosta karkuun, mutta hänen rekkansa kaatuu kiireessä. Mysteron pettää Scarletin, ja kapteenin myötätunto entistä ystäväänsä kohtaan antaa Blackin voittaa Spectrum-agentin. Mustan kuorma-auto uppoaa jään alle kylmään veteen. Mysteron ottaa Rhynon ja haluaa jättää Scarletin jäätymään ja kuolemaan. Kuitenkin käy ilmi, että Scarlet on asentanut Rhynon tietokoneeseen Operation Restriction Systemin estääkseen ulkopuolisia käyttämästä ajoneuvoa. Scarlet tulee tajuihinsa, tunkeutuu Rhynoon hätäuloskäynnin kautta, mutta jää murtuu ja rover putoaa jäisen meren syvyyksiin kapteenin ja Blackin sisällä ...
Mysteron hyökkäsi tohtori Phil Bogartin kimppuun kiipeäessään Arizonassa kallioisen vuoren puolelle kotkan muodossa. Tohtori putosi kalliolta ja kaatui kuoliaaksi. Mysteronina eloon palautettu Phil palaa tutkimuskeskukseen, jossa hän varastaa "tuhoavan pulssin" pommin, ääniaseen, joka jakaa aineen ja tuhoaa keskuksen. Saatuaan tietää tutkimuskeskuksen täydellisestä katoamisesta eversti White ja agentit päättävät, että Mysteronit ovat vangiksineet Bogartin ja aikovat käyttää pommia suuren kaupungin tuhoamiseen. Philillä on psyykkinen yhteys kaksoisveljeensä Frankin kanssa. Kapteeni Scarlet ja kapteeni Blue vierailevat vankilassa, jossa Frank oli vangittu, koska hän käytti tietojaan rikoksiin. Suostuessaan auttamaan hän kuitenkin leikkii vain Spectrum-agenttien kanssa päästäkseen pakoon ensimmäisen tilaisuuden tullen. Kerran yksin veljensä asunnossa 43. kerroksessa Frank kiipeää ulos ikkunasta ja istuu alas laskeutuvan ulkohissin katolle. Mutta Scarlet ja Blue jahtaavat pakolaista Rhynoa ja saavat pian hänet kiinni. Saatuaan Frankin kiinni, agentit vievät hänet tukikohtaan ja pakottavat hänet ottamaan yhteyttä veljeensä. Kun Frank kuitenkin otti yhteyttä, hän oli Mysteronin hallussa, joka lähetettiin tappamaan eversti Whiten...