Käännöksen venymätekijät

Translaation elongaatiotekijät (EF, elongation factor) ovat proteiineja , jotka edistävät peptidisynteesiä ribosomissa translaation elongaatiovaiheessa . Pidentymistekijät varmistavat jatkuvan proteiinipolymeroinnin siitä hetkestä lähtien, kun initiaattori - tRNA saapuu ribosomin P-kohtaan. Eukaryootti- , eubakteeri- ja arkeaaliset elongaatiotekijät ovat eniten samankaltaisia ​​verrattuna translaation aloitustekijöihin ja translaation lopetustekijöihin [1] [2] . Prokaryoottien venymätekijöitä ovat EF-Tu , EF-Ts , EF-G , EF-P [3] . Eukaryoottien mitokondrioilla ja plastideilla on omat venymätekijät, jotka ovat samanlaisia ​​kuin bakteereiden [4] [5] .

Homologisten venymätekijöiden nimikkeistö

Arkealainen Bakteeri eukaryoottinen Toiminnot
Sytoplasminen Mitokondrio
aEF1A EF Tu eEF1A mtEFTu Se välittää varautuneen aminoasyyli-tRNA:n pääsyä ribosomin vapaaseen A-kohtaan [6]
aEF1B EF-Ts eEF1B mtEFTs Toimii EF-Tu:n guanyylinukleotidin vaihtotekijänä katalysoimalla bruttokansantuotteen vapautumista EF-Tu:sta [2]
aEF2 EF-G eEF2 mtEFG1 Katalysoi peptidyyli-tRNA:n ja mRNA:n translokaatiota kunkin peptidin elongaatiosyklin lopussa, samalla kun ribosomissa tapahtuu merkittäviä konformaatiomuutoksia [7]
aIF5A* EF-P eIF5A* - Stimuloi peptidisidoksen muodostumista ja jatkaa translaatiota ribosomin pakotetun pysähtymisen jälkeen mRNA-alueilla, jotka koodaavat kahta tai useampaa proliinia sekvenssissä [8] [9] .
* — On huomattava, että eukaryoottinen tekijä eIF5A ja arkeaalinen tekijä aIF5A, jotka ovat bakteeritekijän EF-P homologeja, nimettiin aloitustekijöiksi, mutta nämä proteiinit tunnustetaan nyt elongaatiotekijöiksi [8]

Muistiinpanot

  1. ↑ Nukleiinihapot: A - Z / B. Appel [et ai.]. - M. : Binom: Knowledge Laboratory, 2013. - 413 s. -700 kappaletta.  - ISBN 978-5-9963-0376-2 .
  2. ↑ 1 2 Sasikumar, Arjun N.; Perez, Winder B.; Kinzy, Terri Goss (heinäkuu 2012). "Eukaryoottisen venymätekijä 1 -kompleksin monet roolit" . Wiley monitieteiset arvostelut. RNA . 3 (4): 543-555. DOI : 10.1002/wrna.1118 . ISSN  1757-7004 . PMC  3374885 . PMID22555874  _ _
  3. ↑ Parker, J. (2001), Elongation Factors; Käännös , Encyclopedia of Genetics , s. 610–611, ISBN 9780122270802 , DOI 10.1006/rwgn.2001.0402 . 
  4. ↑ Manuell, Andrea L; Quispe, Joel; Mayfield, Stephen P; Petsko, Gregory A (7. elokuuta 2007). "Kloroplastiribosomin rakenne: Käännössääntelyn uudet alueet" . PLoS-biologia . 5 (8): e209. doi : 10.1371/journal.pbio.0050209 . PMC  1939882 . PMID  17683199 .
  5. ↑ G.C. Atkinson; S. L. Baldauf (2011). "Pidentymätekijän G evoluutio ja mitokondrio- ja kloroplastimuotojen alkuperä" . Molekyylibiologia ja evoluutio . 28 (3): 1281-92. doi : 10.1093/molbev/ msq316 . PMID 21097998 . 
  6. ↑ Weijland A, Harmark K, Cool RH, Anborgh PH, Parmeggiani A (maaliskuu 1992). "Pidentymätekijä Tu: molekyylin kytkin proteiinien biosynteesissä" . Molekyylimikrobiologia . 6 (6): 683-8. DOI : 10.1111/j.1365-2958.1992.tb01516.x . PMID  1573997 .
  7. ↑ Jørgensen, R; Ortiz, P.A.; Carr-Schmid, A; Nissen, P; Kinzy, T. G.; Andersen, G.R. (toukokuu 2003). "Kaksi kiderakennetta osoittavat suuria konformaatiomuutoksia eukaryoottisessa ribosomaalisessa translokaasissa." Luonnon rakennebiologia . 10 (5): 379-85. DOI : 10.1038/nsb923 . PMID  12692531 .
  8. ↑ 12 Rossi , D; Kuroshu, R; Zanelli, C.F.; Valentini, S. R. (2013). "eIF5A ja EF-P: kaksi ainutlaatuista käännöstekijää kulkevat nyt samaa tietä". Wiley monitieteiset arvostelut. RNA . 5 (2): 209-22. DOI : 10.1002/wrna.1211 . PMID  24402910 .
  9. ↑ Doerfel LK et ai. EF-P on välttämätön peräkkäisiä proliinijäämiä sisältävien proteiinien nopealle synteesille   // Tiede . - 2013. - Vol. 339 , no. 6115 . - s. 85-88 . - doi : 10.1126/tiede.1229017 .