Burundin itsenäistymisen jälkeen vuonna 1962 maa on kokenut kaksi kansanmurhaa . Vuonna 1972 tutsien armeija teki hutujen joukkomurhia [1] ja vuonna 1993 hutut verilöylyt tutteja . Molemmat kansanmurhat on kuvattu Burundin kansainvälisen tutkintakomission loppuraportissa ja esitelty Yhdistyneiden Kansakuntien turvallisuusneuvostolle vuonna 2002 [2] .
Väestötilanne Burundissa vuosina 1960-1970 oli sellainen, että noin 86 % väestöstä oli hutuja , 13 % tutseja ja 1 % twaja [ 3] . Tutseilla oli kuitenkin monopoli korkeiden asemien hallinnassa ja armeijassa. Burundi itsenäistyi vuonna 1962 , ja toukokuussa 1965 pidettiin ensimmäiset itsenäisyyden jälkeiset vaalit. Hutuehdokkaat saivat ylivoimaisen voiton ja saivat 23 paikasta 33. Hutujen pääministerin sijasta kuningas Mwambutsa IV asetti tehtävään yhden tutsiystävänsä. Lokakuun 18. päivänä 1965 kuninkaan käytöksestä suuttuneet hutut yrittivät saada aikaan vallankaappauksen. Kuningas pakeni maasta, mutta vallankaappaus epäonnistui lopulta.
Vuonna 1966 kruununprinssi Charles Ndiziya, eversti Michel Michomberon johtaman armeijan tukemana , syrjäytti isänsä ja nousi valtaistuimelle nimellä Ntare V. Kuitenkin samana vuonna eversti kukisti hallitsijan. Michel Michombero julisti Burundin tasavallaksi ja itse sen ensimmäiseksi presidentiksi. Tutsimonarkistit eivät kuitenkaan luopuneet yrityksistään palata valtaan. 29. huhtikuuta 1972 Ntare V saapui maahan Ugandasta. Ugandan presidentti Idi Amin väitti saaneensa presidentti Michomberolta kirjallisen takuun, että kuningas voisi palata Burundiin ja asua siellä yksityisenä kansalaisena. Ntare V palasi ugandalaisella helikopterilla kotimaahansa, mutta muutaman tunnin kuluttua hänet asetettiin kotiarestiin entisessä palatsissaan Gitegassa . Pian sen jälkeen virallinen radio kertoi, että Ntare V yritti provosoida palkkasoturihyökkäyksen Burundiin ja palauttaa valtansa. Jotkut ministerit puolsivat hänen pitämistä vartioinnissa Gitegassa, kun taas toiset vaativat hänen teloitustaan. Tilanne ratkesi, kun Ntare V tapettiin illan 29. huhtikuuta ja seuraavan aamun välillä epäselvissä olosuhteissa [4] .
Hutukuun 27. päivänä 1972 puhkesi hutujen kapina joidenkin santarmijoukon jäsenten johdolla järvenrantakaupungeissa Rumongessa ja Nyanza Lakissa. Kapinalliset ilmoittivat "Marthiazon tasavallan" [5] [6] perustamisesta . Aseistetut hutukapinalliset tappoivat kaikki näkyvissä olleet tutsit sekä ne hutut, jotka kieltäytyivät liittymästä kapinaan [7] . Tässä ensimmäisessä väkivallanpurkauksessa uskotaan kuolleen 800–1 200 ihmistä [8] .
Presidentti Michel Michombero (Tutsi) julisti sotatilan ja määräsi armeijan tukahduttamaan kapinan hinnalla millä hyvänsä [9] . Hänen käskystään surmattiin älymystön ja hutujen sotilaseliitin edustajia. Tämä johti kansanmurhaan. Tutsi-armeija siirtyi tukahduttamaan kapinan keskuksia. Tämän aikana kuoli virallisten lukujen mukaan noin 15 000 ihmistä ja hutujen mukaan vähintään 300 000. Tähän mennessä kapinan uhrien määräksi arvioidaan 80 000 - 210 000 ihmistä [10] [11 ] . Useita satojatuhansia hutuja pakenivat Zaireen , Ruandaan ja Tansaniaan [11] [12] .
Virallisten tietojen mukaan 29.-30. huhtikuuta Zairen kanssa liittoutuneet aseelliset hutukapinalliset hyökkäsivät Burundiin ja hyökkäsivät Gitegan ja Bujumburan kaupunkeihin . He yrittivät perustaa hutu tasavallan ja karkottaa tutseja. Burundin hallitus ilmoitti kapinallisten lukumääräksi noin 50 000 ihmistä, mutta useimmat tarkkailijat uskovat, että Michomberon vastustajia oli noin 4-5 tuhatta [13] .
Burundi julistettiin humanitaariseksi katastrofialueeksi 1. toukokuuta. Käytettyään 25 000 dollaria World Disaster Relief Fundilta Burundi pyysi Yhdysvalloista vielä 75 000 dollaria . Rahat myönnettiin, ja suurin osa niistä käytettiin lääkkeisiin, peitoihin, ruokaan, vaatteisiin ja kuljetuksiin [14] .
Tulevaisuudessa maa koki vielä useita vallankaappausyrityksiä, joiden aikana maahan perustettiin sotilaallinen diktatuuri. Vuonna 1987 valtaan nousi majuri Pierre Buyoya , jonka hallituskaudella alkoivat vakavat etniset yhteenotot tutsien ja hutujen välillä.
Lokakuussa 1990 Ruandan tutsipakolaiset, jotka olivat palvelleet useita vuosia Ugandan armeijassa, hyökkäsivät Ruandaan. Seuraavat kolme vuotta hutuhallitus kävi sotaa tutsipakolaisten muodostamaa Ruandan isänmaallista rintamaa (RPF) vastaan. Vuonna 1993 Yhdistyneiden kansakuntien ja Afrikan yhtenäisyysjärjestön lähettiläät pakottivat osapuolet allekirjoittamaan rauhansopimuksen. Tulitaukosopimus oli voimassa 6. huhtikuuta asti. 6. huhtikuuta 1994 Burundin ja Ruandan presidentit olivat palaamassa Ruandan pääkaupunkiin Kigaliin rauhanneuvotteluista Tansaniasta . Laskeutumisen yhteydessä kone, jossa presidentit olivat kyydissä, ammuttiin alas ja kahden maan johtajat saivat surmansa . Etninen puhdistus alkoi Ruandassa [15] .
Kesäkuussa 1993 Burundin Demokratianrintama (FRODEBU) hutupuolue ja sen presidenttiehdokas Melchior Ndadaye voittivat vaalit ja muodostivat ensimmäisen hutuhallituksen Burundissa. Jännitteet tutsien ja hutujen välillä alkoivat kasvaa. Pienet heimojen edustajista koostuvat jengit aloittivat yhteenotot silloisessa pääkaupungissa Bujumburassa . Pian nämä yhteenotot kärjistyivät taisteluiksi viidakkoveitseillä aseistautuneiden ryhmien välillä. Jännitteet kärjistyivät 21. lokakuuta 1993, kun presidentti Ndadaye murhattiin. Maa aloitti sisällissodan. Jotkut FRODEBUn [16] rakenteet syyttivät tutsijohtajaansa murhasta ja julistivat kostavansa julman koston. Heidän kutsunsa mukaan yli 25 000 tutsea tapettiin [17] . Vuonna 2002 YK:n kansainvälinen tutkintakomissio Burundissa kutsui vuoden 1993 tutsien joukkomurhaa kansanmurhaksi [18] .