Malaattidehydrogenaasi

Kokeneet kirjoittajat eivät ole vielä tarkistaneet sivun nykyistä versiota, ja se voi poiketa merkittävästi 23. heinäkuuta 2018 tarkistetusta versiosta . tarkastukset vaativat 4 muokkausta .

Omenahappodehydrogenaasi (omenahappodehydrogenaasi, englanti  MDH , EC 1.1.1.37)  on entsyymi , joka katalysoi S-malaatin (L- omenahappo ) hapettumista oksaloasetaatiksi (oksaloetikkahapoksi).

(S)-malaatti + NAD(+) <=> oksaaliasetaatti + NADH

Sytoplasmista malaattidehydrogenaasia MDH1 (1.1.1.37) koodaa geeni, joka sijaitsee kromosomissa 2, ilmentyy hepatosyyteissä ja nefrosyyteissä, ja se osallistuu glukoneogeneesiin. Tämän reaktion koentsyymi on NAD .

Mitokondriaalinen malaattidehydrogenaasi MDH2 (1.1.1.37) on 7. kromosomissa sijaitsevan geenin koodaama, ekspressoituu kaikissa kudoksissa ja osallistuu Krebsin kiertoon (trikarboksyylihapposykli , sitruunahapposykli). Tämän reaktion koentsyymi on NAD .

Malaattidehydrogenaasi (NADP) (NADP-omenaentsyymi, 1.1.1.82) EC 1.1.1.82:ta koodaa EGO-geeni [1] , ekspressoituu niiden kudosten solujen sytoplasmassa, jotka osallistuvat rasvahappojen biosynteesiin: hepatosyytit , rintasolut jne . Tämän reaktion koentsyymi on NADP . Pentoosifosfaattisyklin [2] ohella se on NADPH:n toimittaja rasvahapposyntaasiin sekä kolesterolin biosynteesiin .
Entsyymin vaikutusmekanismi sisältää kahden substraatin peräkkäisen, koordinoidun kiinnittymisen vaiheet. Alussa MDH2:n aktiiviseen keskukseen liittyy dikarboksyylihappo (omenahappo (anioni - malaatti) tai oksaloetikkahappo (anioni - oksaloasetaatti). Sitten NAD+ tai NADH, vastaavasti, kiinnittyy adenylaattiosan kautta, joka sitoutuu siten, että nikotiiniamidiosa hyökkää dikarboksyylihapon hydroksyyli- tai karbonyylihiileen [1,2].


Monet malaattidehydrogenaasit ovat dekarboksyloivia entsyymejä ja osallistuvat sekä NADPH:n tuotantoon että solujen hiilidioksiditasojen säätelyyn. Malaattidehydrogenaasi (NADP) (NADP-omenaentsyymi, 1.1.1.40) EC 1.1.1.40 Dekarboksylaatioentsyymi, joka ilmentyy eri elimissä ja kudoksissa, jotka osallistuvat fosfolipidien biosynteesiin. Se ilmentyy laajasti hepatosyyteissä sekä mitokondrioiden matriisissa että sytoplasmassa. Tämä isoentsyymi eristetään levistä ja kasveista ja ekspressoituu kloroplasteissa ja sytoplasmassa. Ihmisen hepatosyyttien sytoplasmasta peräisin olevan entsyymin kiteisiä muotoja kuvataan melko laajasti 2AW5.pdb

(S)-malaatti + NADP(+) <=> pyruvaatti + CO(2) + NADPH


Malaattidehydrogenaasi (NAD) (NAD-omenaentsyymi, 1.1.1.38) EC 1.1.1.38 Bakteereista ja hyönteisistä eristetty dekarboksylaatioentsyymi. Malaattidehydrogenaasi (NAD) (NAD-omenaentsyymi, 1.1.1.39) EC 1.1.1.39 Dekarboksylaatioentsyymi, joka on eristetty kasvin mitokondriomatriisista.

(S)-malaatti + NAD(+) <=> pyruvaatti + CO(2) + NADH

MDH2-entsyymin maksimiaktiivisuus havaitaan omenahapon konsentraatiolla, joka on 0,03 M, puolimaksimista - 0,01 M:lla. Malaattidehydrogenaasin spesifinen substraatti on luonnollinen L-omenahappo. Entsyymi ei vaikuta D-omenahappoon, se ei katalysoi maleiini- ja dioksimaleiinihappojen hapettumista. Malaattidehydrogenaasilääkkeillä MDH1 ja MDH2 on kyky katalysoida omenahapon hapettumista NAD:n, metyleenisinisen ja syanidin läsnä ollessa . Metyleenisininen voidaan korvata epinefriinillä , laktoflaviinilla tai pyosyaniinilla . Malaattidehydrogenaasi MDH2 ilmentyy eläinten aivojen, sydämen, maksan, lihasten, munuaisten ja muiden elinten kudoksissa sekä hiivassa, korkeammissa kasveissa ja joissakin bakteereissa, mukaan lukien Mycobacterium tuberculosis PDB 5KVV . Isoentsyymin aktiivisuussuhteet eivät ole samat eri elimissä. Entsyymin optimaalinen pH on 7,2.

[1] [2]


Muistiinpanot

  1. MDHall, DGLevitt, LJBanaszak. Escherichia colin malaattidehydrogenaasin kiderakenne: Apoentsyymin ja sitraatin kompleksi resoluutiolla 1 87 Å. Journal of Molecular Biology. Volume 226, Issue 3, 5. elokuuta 1992, sivut 867-882. https://doi.org/10.1016/0022-2836(92)90637-Y
  2. Y. Yin ja JF Kirsch. Toiminnallisten paralogisiirtomutaatioiden tunnistaminen: Escherichia colin malaattidehydrogenaasin muuntaminen laktaattidehydrogenaasiksi. PNAS 30. lokakuuta 2007 104 (44) 17353-17357; https://doi.org/10.1073/pnas.0708265104