Kimeerinen geeni

Kimeeriset geenit (merkitsee kirjaimellisesti nukleotidisekvenssejä, jotka koostuvat eri lähteistä peräisin olevien polynukleotidien fragmenteista ) muodostetaan yhdistämällä osia kahdesta tai useammasta koodaavasta tai ei-koodaavasta sekvenssistä uusien geenien tuottamiseksi, joilla on spesifinen toiminto. Nämä mutaatiot eroavat fuusiogeeneistä , jotka yhdistävät kokonaisia ​​geenisekvenssejä tai niiden laajennettuja koodaavia alueita yhdeksi avoimeksi lukukehykseksi ja säilyttävät usein alkuperäisten toimintojensa yhdistelmän.

Muodostelu

Kimeerisiä geenejä voidaan muodostaa useilla eri tavoilla. Monet kimeeriset geenit muodostuvat DNA-replikaatio- tai DNA-korjausvirheistä johtuen, jolloin osat kahdesta eri geenistä yhdistyvät tahattomasti [1] . Kimeeriset geenit voivat muodostua myös retrotranspositiolla , kun retrotransposoni kopioi vahingossa geenitranskriptin ja lisää sen genomiin uuteen paikkaan. Riippuen siitä, missä uusi retrogeeni ilmestyy , se voi värvätä uusia eksoneja luomaan kimeerisen geenin. Ja lopuksi, kohdunulkoinen rekombinaatio voi tuottaa kimeerisiä geenejä  - kun tapahtuu vaihtoa genomin osien välillä, jotka eivät ole todellisuudessa sukua. Tämä prosessi tapahtuu usein ihmisen genomeissa. Tästä prosessista muodostuvien poikkeavien kimeerojen tiedetään aiheuttavan värisokeutta .

Kimeeristen proteiinien evoluution merkitys

Kimeerisillä geeneillä on tärkeä rooli geneettisen monimuotoisuuden kehittymisessä. Kuten geenien päällekkäisyydet , ne tarjoavat uusien geenien lähteen, jonka avulla organismit voivat kehittää uusia fenotyyppejä ja sopeutua ympäristöönsä. Toisin kuin kaksoisgeenit, kimeeriset proteiinit eroavat välittömästi alkuperäisgeeneistään ja siksi ne suorittavat todennäköisemmin täysin uusia toimintoja.

Kimeerisiä fuusioproteiineja muodostuu usein genomeissa [1] , ja monet niistä ovat todennäköisesti toimintahäiriöitä ja katoavat luonnollisen valinnan seurauksena . Joissakin tapauksissa nämä uudet peptidit voivat kuitenkin muodostaa täysin toimivia geenituotteita, joita suositaan selektiivisesti ja jotka lisääntyvät nopeasti populaatioissa.

Toiminnot

Yksi tunnetuimmista kimeerisistä geeneistä tunnistettiin Drosophilassa ja nimettiin Jingwei (jgw) [2] . Tämä geeni muodostuu alkoholidehydrogenaasin retrotransposoidusta kopiosta , joka yhdistyy keltaisen keisarigeenin (ymp, keltakeisari) [3] kanssa uuden proteiinin tuottamiseksi [2] . Keltaisen keisarigeenin uudet aminohappotähteet mahdollistavat uuden proteiinin vaikutuksen pitkäketjuisiin alkoholeihin ja dioleihin, mukaan lukien kasvuhormonit ja feromonit [4] , ja siten vaikuttaa kärpästen kehitykseen. Tässä tapauksessa eri proteiinidomeenien yhdistelmä johti geeniin, joka oli täysin toimiva ja luonnonvalinnan suosima.

Monien kimeeristen geenien toimintoja ei vielä tunneta. Joissakin tapauksissa nämä geenituotteet eivät ole hyödyllisiä ja voivat jopa aiheuttaa sairauksia, kuten syöpää [5] .

Muistiinpanot

  1. 1 2 Rogers, RL, Bedford, T ja Hartl DL. "Kimeeristen ja kaksoisgeenien muodostuminen ja pitkäikäisyys Drosphilassa ". Genetiikka . 181:313-322.
  2. 1 2 Long, M., CH Langley 1993. "Luonnollinen valinta ja jingwein alkuperä , kimeerinen prosessoitu toiminnallinen geeni Drosophilassa ." Science 260: 91-95.
  3. Ymp kelta-keisari [Drosophila melanogaster (hedelmäkärpäs) ] . Kansallinen lääketieteen kirjasto. Haettu: 10.7.2022.
  4. Zhang J, Dean AM, Brunet F, Long M. 2004. "Proteiinien toiminnallisen monimuotoisuuden kehittyminen Drosophilan uusissa geeneissä ." Proc Natl Acad Sci USA 101: 16246-50.
  5. Shi, X.; Singh, S.; Lin, E.; Li, H. (2021). "Kimeeriset RNA:t syövässä". Kliinisen kemian edistysaskel . 100 :1-35. DOI : 10.1016/bs.acc.2020.04.001 . PMID  33453863 .