Retrotransposonit

Retrotransposonit ( ensimmäisen tyypin liikkuvat geneettiset elementit tai transposonit , jotka liikkuvat RNA - välituotteiden kautta) ovat geneettisiä elementtejä, jotka voivat lisääntyä genomissa ja ovat monien eukaryoottisten organismien DNA: n kaikkialla esiintyviä komponentteja .

Retrotransposonit ovat transposonien alaluokka . Retrotransposonit ovat laajalti levinneitä kasveissa, joissa ne ovat usein olennainen osa ydin- DNA :ta . Maissilla 49–78 % genomista koostuu retrotransposoneista, [ 1] vehnässä noin 90 % genomista on toistuvia sekvenssejä, joista 68 % on transposoituvia elementtejä. [2] Nisäkkäillä lähes puolet genomista (45-48 %) koostuu transposoneista tai transposonien jäänteistä. Noin 42 % ihmisen genomista koostuu retrotransposoneista ja noin 2-3 % DNA-transposoneista . [3]

Luokitus

Retrotransposonit tai ensimmäisen tyypin liikkuvat geneettiset elementit koostuvat kahdesta alatyypistä - retrotransposoneista, joissa on pitkiä terminaalitoistoja ( eng.  LTR , long terminaalitoistoja ), ja retrotransposoneista, joissa ei ole pitkiä terminaalitoistoja.

Jälkimmäiset puolestaan ​​jaetaan pitkiin hajautetuihin toistoihin ( englanniksi  LINEs , long interspersed elements ) ja lyhyisiin hajautetuihin toistoihin ( englanniksi  SINE , short interspersed elements ).

Muistiinpanot

1. ↑ SanMiguel P., Bennetzen JL Todisteet siitä, että maissin genomin koon äskettäinen kasvu johtui geenien välisten retrotranposonien massiivisesta lisääntymisestä  //  Annals of Botany  : Journal. - 1998. - Voi. 82 , nro. Supple A. - s. 37-44 . - doi : 10.1006/anbo.1998.0746 .
2. ↑ Li W., Zhang P., Fellers JP, Friebe B., Gill BS [www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1365-313X.2004.02228.x Triticeae-genomi]  (englanti)  // Kasvi J. : päiväkirja. - 2004. - marraskuu ( osa 40 , nro 4 ) - s. 500-511 . - doi : 10.1111/j.1365-313X.2004.02228.x . — PMID 15500466 .  (linkki ei saatavilla)
3. ↑ Lander ES, Linton LM, Birren B. et ai. Ihmisen genomin ensimmäinen sekvensointi ja analyysi  //  Nature : Journal. - 2001. - Helmikuu ( nide 409 , nro 6822 ). - s. 860-921 . - doi : 10.1038/35057062 . — PMID 11237011 .

Kirjallisuus

• Zhimulev I. F. Yleinen ja molekyyligenetiikka. - 1. - Novosibirsk: Novosibirsk University Publishing House, 2002. - 459 s. - 2000 kappaletta.  — ISBN 5761505096 .
• Liu, J., Gao, M., He, J., Wu, K., Lin, S., Jin, L., ... & Chen, J. (2021). RNA m6 A -lukija YTHDC1 vaimentaa retrotransposonit ja suojelee ES-soluiden identiteettiä. Nature, 591 (7849), 322-326. PMID 33658714 doi : 10.1038/s41586-021-03313-9
• Billon, V. ja Cristofari, G. (2021). Syntyvä RNA m 6 Modifikaatio geenin ja retrotransposonin konfliktin ytimessä. Cell Research, 1-3. doi : 10.1038/s41422-021-00518-5
• Xu, Z., Ma, A. & Ma, YC (2021). RNA-metylaatio säilyttää ES-soluiden identiteetin retrotransposonien kromatiinihiljentämällä. Sig Transduct Target Ther 6, 258 . doi : 10.1038/s41392-021-00683-4

Katso myös

• transposonit
• DNA-transposonit

Sanakirjat ja tietosanakirjat	Britannica (verkossa)