LINJAA

LINE:t ( Long interspersed ydinelement ,  Long Dispersed Repeats [1] ) ovat pitkiä (useita tuhansia emäspareja [ 2] ) DNA-sekvenssejä eukaryoottigenomissa , jotka ovat retrotransposoneja , jotka eivät sisällä pitkiä terminaalisia toistoja .

Ensimmäinen kuvaus LINE-sekvenssistä, noin 6400 emäsparia pitkä, julkaistiin vuonna 1980. [3]

Rakennus

3'-päässä LINE:t sisältävät joko poly( A )-hännän, runsaasti adeniinia sisältävän sekvenssin tai tandem-toistosekvenssit. LINES sisältää yhden tai kaksi avointa lukukehystä [4] .

Linjoilla on 5 superperhettä [4] :

• R2 . Ne sisältävät yhden avoimen lukukehyksen, joka koodaa käänteistranskriptaasia ja endonukleaasia . Uskotaan, että tämä on vanhin retroposoniperhe, joka ei sisällä pitkiä terminaalitoistoja .
• R.T.E. _ Ne sisältävät myös yhden avoimen lukukehyksen, joka koodaa apuriini-apurimidiiniendonukleaasia ja käänteistranskriptaasia.

Kolme muuta superperhettä sisältää kaksi avointa lukukehystä. Ensimmäisen tuote (ORF1), joka koodaa proteiinia, joka on ominaisuuksiltaan samanlainen kuin retrovirusten gag -geenin tuote.

• jockey . Toinen avoin lukukehys (ORF2) koodaa apuriini-apurimidiiniendonukleaasia ja käänteistranskriptaasia.
• L1 . ORF2 koodaa samat elementit kuin Jockey -superperhe . Tämän superperheen LINE-solut ovat parhaiten tutkittuja ja runsaimpia nisäkäsgenomissa. Siten ihmisen genomi sisältää yli 500 tuhatta kopiota LINE-1 retroposoneista , mikä on noin 17% genomista.
• minä. _ ORF2 koodaa apuriini-apurimidiiniendonukleaasin ja käänteistranskriptaasin lisäksi myös RNaasi H :ta.

Katso myös

• Retrotransposonit
• SINEs

Muistiinpanot

1. ↑ Singer MF SINEt ja LINE:t: erittäin toistuvat lyhyet ja pitkät välissä olevat sekvenssit nisäkäsgenomeissa.  (englanniksi)  // Solu. - 1982. - Voi. 28, nro. 3 . - s. 433-434. — PMID 6280868 .
2. ↑ Antonio Lima de Faria. Ylistys kromosomin "tyhmyydestä": vastahakoisen molekyylin tunnustus. - Moskova: Binom. Knowledge Laboratory, 2012. - S. 275. - 312 s. - ISBN 978-5-9963-0974-0 .
3. ↑ Adams, JW , Kaufman, RE , Kretschmer, PJ , Harrison, M. , Nienhuis, AW Perhe pitkiä toistuvia DNA-sekvenssejä, joista yksi kopio on ihmisen beetaglobiinigeenin vieressä // Nucleic Acids Research: Journal. - 1980. - V. 8 , nro 24 . - S. 6113 . doi : 10.1093 / nar/8.24.6113 .
4. ↑ 1 2 López-Flores I., Garrido-Ramos MA Eukaryoottisten genomien toistuva DNA-sisältö // Garrido-Ramos MA Genome Dynamics. - 2012. - T. 7 . - S. 1-28 . — ISBN 978-3-318-02149-3 . - doi : 10.1159/isbn.978-3-318-02150-9 .