ARHGAP29

ARHGAP29  on geeni , joka sijaitsee ihmisen ensimmäisessä kromosomissa kohdassa 1p22 ja joka koodaa Rho GTPaasi-aktivoitua proteiinia (GAP) 29, [1] proteiinia , joka välittää pienten, GTP :tä sitovien proteiinien, kuten RhoA: n, syklistä säätelyä [2] .

Toiminto

ARHGAP29 ilmentyy kehittyvissä kasvoissa ja voi vaikuttaa alavirtaan IRF6- proteiinista vaikuttaen kallon kasvojen kehitykseen [3] .

Rakenne

ARHGAP29 sisältää neljä domeenia, mukaan lukien kierrealueen, joka on vuorovaikutuksessa Rap2:n kanssa, [4] C1-domeenin, Rho-alueen, GTPaasidomeenin ja pienen C-terminaalisen alueen, joka on vuorovaikutuksessa PTPL1:n kanssa [2] .

Kliininen merkitys

Genomitutkimukset ja meta-analyysi [5] ovat osoittaneet ARHGAP29:n sisältävän 1p22-lokuksen yhteyden ei-syndroomiseen huuli-/suulakihalkioon [6] . Myöhemmät tutkimukset [3] tunnistivat harvinaisia ​​koodausvariantteja, mukaan lukien nonsense-mutaatiot ja kehyssiirtymät, potilailla, joilla oli ei-syndrominen huuli-/suulakihalkio . ARHGAP29:n rooli kallon kasvojen kehityksessä pääteltiin sen jälkeen, kun viereiseltä ABCA4-geeniltä puuttui toiminnallisia tai ilmentymistietoja, jotka tukisivat sitä ei-syndromisen huuli-/suulakihalkio etiologisena geeninä , vaikka tähän on liitetty yksi nukleotidipolymorfismi ABCA4-geenissä. sairaus.

Muistiinpanot

  1. ↑ Heasman SJ, Ridley AJ. 2008. Nisäkkään Rho GTPaasit: uusia näkemyksiä niiden toiminnoista in vivo -tutkimuksista. Nat Rev Mol Cell Biol 9(9) 690-701.
  2. ↑ 1 2 Saras J, Franzen P, Aspenstrom P, Hellman U, Gonez LJ, Heldin CH. 1997. Uusi GTPaasia aktivoiva proteiini Rho:lle on vuorovaikutuksessa proteiinityrosiinifosfataasi PTPL1" J Biol Chem 272(39) 24333-24338 PDZ-domeenin kanssa.
  3. ↑ 1 2 Leslie, EJ; Mansilla MA, Biggs LC, Schuette K., Bullard S., Cooper M., Dunnwald M., Lidral AC, Marazita ML, Beaty TH, Murray JC Ekspressio- ja mutaatioanalyysit osoittavat ARHGAP29:n etiologisena geeninä huulihalkealle joko kanssa tai ilman suulakilokus, joka tunnistettiin genominlaajuisella assosiaatiolla kromosomissa 1p22  //  Birth Dfects Research Osa A: Clinical and Molecular Teratology : Journal. - 2012. - Vol. 94 . - s. 934-942 . - doi : 10.1002/bdra.23076 . — PMID 23008150 .
  4. ↑ Myagmar BE, Umikawa M, Asato T, Taira K, Oshiro M, Hino A, Takei K, Uezato H, Kariya K. 2005. PARG1, proteiini-tyrosiinifosfataasiin liittyvä RhoGAP, oletettuna Rap2-efektorina" Biochem Biophys Res . Commun 329(3) 1046-1052.
  5. ↑ Ludwig, KU; Mangold E., Herms S., Nowak S., Reutter H., Paul A., Becker J., Herberz R., AlChawa T., Nasser E., Böhmer AC, Mattheisen M., Alblas MA, Barth S., Kluck N., Lauster C., Braumann B., Reich RH, Hemprich A., Pötzsch S., Blaumeiser B., Daratsianos N., Kreusch T., Murray JC, Marazita ML, Ruczinski I., Scott AF, Beaty TH , Kramer FJ, Wienker TF, Steegers-Theunissen RP, Rubini M., Mossey PA, Hoffmann P., Lange C., Cichon S., Propping P., Knapp M., Nöthen MM Genominlaajuiset meta-analyysit non-syndromic cleft huuli suulakihalkiolla tai ilman tunnistaa kuusi uutta riskilokusta  // Nature Genetics  : Journal  . - 2012. - Vol. 44 , no. 9 . - s. 968-971 . - doi : 10.1038/ng.22360 . — PMID 22863734 .
  6. ↑ Beaty, T.H.; Murray JC, Marazita ML, Munger RG, Ruczinski I., Hetmanski JB, Liang KY, Wu T., Murray T., Fallin MD, Redett RA, Raymond G., Schwender H., Jin SC, Cooper ME, Dunnwald M. , Mansilla MA, Leslie E., Bullard S., Lidral AC, Moreno LM, Menezes R., Vieira AR, Petrin A., Wilcox AJ, Lie RT, Jabs EW, Wu-Chou YH, Chen PK, Wang H., Ye X., Huang S., Yeow V., Chong SS, Jee SH, Shi B., Christensen K., Melbye M., Doheny KF, Pugh EW, Ling H., Castilla EE, Czeizel AE, Ma L., Field LL, Brody L., Pangilinan F., Mills JL, Molloy AM, Kirke PN, Scott JM, Arcos-Burgos M., Scott AF Genominlaajuinen assosiaatiotutkimus huulihalkeuksesta, jossa on ja ilman suulakihalkiota, tunnistaa riskimuunnelmia lähellä MAFB:tä ja ABCA4. (englanniksi)  // Nature Genetics  : Journal. - 2010. - Vol. 42 , nro. 6 . - s. 525-529 . - doi : 10.1038/ng.580 . — PMID 20436469 .