SERBP1

SERPIN1 mRNA:ta sitova proteiini 1

Käytettävissä olevat rakenteet

Ortologinen haku: PDBe , RCSB

Luettelo ATE:n tunnuksista
3J3A

Tunnisteet

Symboli

SERBP1 ; CHD3IP; HABP4L; PAI-RBP1; PAIRBP1

Ulkoiset tunnukset

OMIM: 607378 MGI : 1914120 Homologeeni : 134277 GeneCards : SERBP1-geeni

Geeniontologia
Toiminto	• mRNA:n 3'-UTR:n sitoutuminen • proteiineihin sitoutuminen • poly(A)-RNA:n sitoutuminen
solukomponentti	• ydin • sytoplasma • plasmakalvo • kalvo • sytoplasman perinukleaarinen alue • ekstrasellulaarinen vesikulaarinen eksosomi
biologinen prosessi	• apoptoottisen prosessin säätely • mRNA:n stabiilisuuden säätely
Lähteet: Amigo / QuickGO

RNA-ekspressioprofiili

Lisää tietoa

ortologit

Näytä

Ihmisen

Hiiri

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (proteiini)

Locus (UCSC)

Chr 1:
67,87 – 67,9 Mb

Chr 6:
67,27 – 67,29 Mb

Hae PubMedistä

[yksi]

[2]

Plasminogeenin aktivaattorin estäjä 1 RNA:ta sitova proteiini SERBP1 (ei pidä sekoittaa srebp1:een) on proteiini , jota ihmisillä koodaa SERBP1 -geeni . [1] [2] [3]

Vuorovaikutuksia

SERBP1:n on osoitettu olevan vuorovaikutuksessa CHD3 :n kanssa . [4] [5]

Muistiinpanot

↑ Heaton JH, Dlakic WM, Dlakic M., Gelehrter TD Sellaisen uuden RNA:ta sitovan proteiinin tunnistaminen ja cDNA-kloonaus, joka on vuorovaikutuksessa tyypin 1 plasminogeeniaktivaattori-inhibiittorin mRNA:n syklisen nukleotidiherkän sekvenssin kanssa // J Biol : Journal. - 2001. - toukokuu ( nide 276 , nro 5 ). - P. 3341-3347 . - doi : 10.1074/jbc.M006538200 . — PMID 11001948 .
↑ Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY, Liu CS, Lin W. Caenorhabditis elegansissa evolutionaarisesti konservoituneiden uusien ihmisgeenien tunnistaminen vertailevan proteomiikan avulla // Genome Res : päiväkirja. - 2000. - elokuu ( osa 10 , nro 5 ) - s. 703-713 . - doi : 10.1101/gr.10.5.703 . — PMID 10810093 .
↑ Entrez-geeni: SERBP1 SERPINE1 mRNA:ta sitova proteiini 1 . Arkistoitu alkuperäisestä 5. joulukuuta 2010. (määrätön)
↑ Lemos, Taila A; Passos Dario O; Nery Flavia C; Kobarg Jörg. Uuden proteiiniperheen karakterisointi, joka on vuorovaikutuksessa kromatiiniremodeling-tekijän CHD-3 C-terminaalisen alueen kanssa // FEBS Lett . : päiväkirja. - Alankomaat, 2003. - Tammikuu ( nide 533 , nro 1-3 ). - s. 14-20 . — ISSN 0014-5793 . - doi : 10.1016/S0014-5793(02)03737-7 . — PMID 12505151 .
↑ Stelzl, Ulrich; Worm Uwe, Lalowski Maciej, Haenig Christian, Brembeck Felix H., Goehler Heike, Stroedicke Martin, Zenkner Martina, Schoenherr Anke, Koeppen Susanne, Timm Jan, Mintzlaff Sascha, Abraham Claudia, Bock Nicole, Kietzmann Silvia, Goedde A Enst, Droege Anja, Krobitsch Sylvia, Korn Bernhard, Birchmeier Walter, Lehrach Hans, Wanker Erich E. Ihmisen proteiini-proteiini-vuorovaikutusverkosto: resurssi proteomin annotointiin // Cell : Journal. - Yhdysvallat: Cell Press , 2005. - syyskuu ( osa 122 , nro 6 ). - s. 957-968 . — ISSN 0092-8674 . - doi : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . — PMID 16169070 .

Kirjallisuus

Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: yksinkertainen menetelmä korvata eukaryoottisten mRNA:iden cap-rakenne oligoribonukleotideilla. (englanniksi) // Gene : päiväkirja. - Elsevier , 1994. - Voi. 138 , nro. 1-2 . - s. 171-174 . - doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . — PMID 8125298 .
Andersson B., Wentland MA, Ricafrente JY, et ai. "Kaksoissovittimen" menetelmä haulikkokirjaston rakentamisen parantamiseksi. (englanniksi) // Anal. Biochem. : päiväkirja. - 1996. - Voi. 236 , nro. 1 . - s. 107-113 . - doi : 10.1006/abio.1996.0138 . — PMID 8619474 .
Yu W., Andersson B., Worley KC, et ai. Laajamittainen konkatenaatio-cDNA-sekvensointi. (englanniksi) // Genome Res. : päiväkirja. - 1997. - Voi. 7 , ei. 4 . - s. 353-358 . - doi : 10.1101/gr.7.4.353 . — PMID 9110174 .
Suzuki Y., Yoshitomo-Nakagawa K., Maruyama K. et ai. Täyspituudella rikastetun ja 5'-päästä rikastetun cDNA-kirjaston rakentaminen ja karakterisointi. (englanniksi) // Gene : päiväkirja. - Elsevier , 1997. - Voi. 200 , ei. 1-2 . - s. 149-156 . - doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . — PMID 9373149 .
Wiemann S., Weil B., Wellenreuther R., et ai. Kohti ihmisen geenien ja proteiinien luetteloa: 500 uuden täydellisen proteiinia koodaavan ihmisen cDNA:n sekvensointi ja analyysi. (englanniksi) // Genome Res. : päiväkirja. - 2001. - Voi. 11 , ei. 3 . - s. 422-435 . - doi : 10.1101/gr.GR1547R . — PMID 11230166 .
Bucková D., Izakovicová Hollá L., Vácha J. Polymorfismi 4G/5G plasminogeeniaktivaattori-inhibiittori-1 (PAI-1) -geenissä liittyy IgE-välitteisiin allergisiin sairauksiin ja astmaan Tšekin väestössä. (englanniksi) // Allergia : päiväkirja. - 2002. - Voi. 57 , no. 5 . - s. 446-448 . - doi : 10.1034/j.1398-9995.2002.03582.x . — PMID 11972486 .
Jones K., Powell J., Brown L., et ai. 4G/5G-polymorfismin vaikutus plasminogeeniaktivaattori-inhibiittori-1-geenin promoottorissa vatsa-aortan aneurysman ilmaantuvuuteen, kasvuun ja operatiiviseen riskiin. (Englanti) // European Journal of Vascular and Endovascular Surgery : päiväkirja. - 2002. - Voi. 23 , ei. 5 . - s. 421-425 . doi : 10.1053 / ejvs.2002.1633 . — PMID 12027469 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et ai. Yli 15 000 täyspitkän ihmisen ja hiiren cDNA-sekvenssin luominen ja alkuanalyysi. (englanti) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal. - 2003. - Voi. 99 , ei. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Lemos TA, Passos DO, Nery FC, Kobarg J. Uuden proteiiniperheen karakterisointi, joka on vuorovaikutuksessa kromatiini-remodeling-tekijän CHD-3 C-terminaalisen alueen kanssa. (englanti) // FEBS Lett. : päiväkirja. - 2003. - Voi. 533 , no. 1-3 . - s. 14-20 . - doi : 10.1016/S0014-5793(02)03737-7 . — PMID 12505151 .
Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., et ai. 21 243 täyspitkän ihmisen cDNA:n täydellinen sekvensointi ja karakterisointi. (englanniksi) // Nat. Genet. : päiväkirja. - 2004. - Voi. 36 , ei. 1 . - s. 40-5 . - doi : 10.1038/ng1285 . — PMID 14702039 .
Gerhard DS, Wagner L., Feingold EA, et ai. NIH:n täyspitkän cDNA-projektin tila, laatu ja laajennus: Mammalian Gene Collection (MGC). (englanniksi) // Genome Res. : päiväkirja. - 2004. - Voi. 14 , ei. 10B . - s. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
Otsuki T., Ota T., Nishikawa T. et ai. Signaalisekvenssi ja avainsanaloukku in silico täyspitkien ihmisen cDNA:iden valintaa varten, jotka koodaavat eritystä tai kalvoproteiineja oligopäällysteisistä cDNA-kirjastoista. (englanniksi) // DNA Res. : päiväkirja. - 2007. - Voi. 12 , ei. 2 . - s. 117-126 . - doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . — PMID 16303743 .
Lemos TA, Kobarg J. CGI-55 on vuorovaikutuksessa tuman proteiinien kanssa ja lokalisoituu p80-coilin positiivisesti kierretyiksi kappaleiksi tumassa. (englanniksi) // Cell Biochem. Biophys. : päiväkirja. - 2006. - Voi. 44 , no. 3 . - s. 463-474 . - doi : 10.1385/CBB:44:3:463 . — PMID 16679534 .
Passos DO, Bressan GC, Nery FC, Kobarg J. Ki-1/57 on vuorovaikutuksessa PRMT1:n kanssa ja on substraatti arginiinin metylaatiolle. (englanniksi) // FEBS J. : päiväkirja. - 2006. - Voi. 273 , nro. 17 . - P. 3946-3961 . - doi : 10.1111/j.1742-4658.2006.05399.x . — PMID 16879614 .
Dalmaz CA, Santos KG, Botton MR, et ai. Trombofiilisten geenien polymorfismien ja preeklampsian välinen suhde brasilialaisessa populaatiossa. (englanniksi) // Blood Cells Mol. Dis. : päiväkirja. - 2006. - Voi. 37 , no. 2 . - s. 107-110 . - doi : 10.1016/j.bcmd.2006.07.005 . — PMID 16963292 .
Beausoleil SA, Villén J., Gerber SA, et ai. Todennäköisyyksiin perustuva lähestymistapa korkean suorituskyvyn proteiinien fosforylaatioanalyysiin ja paikannukseen. (englanniksi) // Nat. Biotechnol. : päiväkirja. - 2006. - Voi. 24 , ei. 10 . - s. 1285-1292 . - doi : 10.1038/nbt1240 . — PMID 16964243 .
Olsen JV, Blagoev B., Gnad F., et ai. Globaali, in vivo ja paikkakohtainen fosforylaatiodynamiikka signalointiverkoissa. (englanniksi) // Solu : päiväkirja. - Cell Press , 2006. - Voi. 127 , nro. 3 . - s. 635-648 . - doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . — PMID 17081983 .