SNARE ( englanninkielisestä sanasta soluble NSF kiinnitysreseptori ) on suuri joukko proteiineja , jotka yhdistävät solunsisäisiä kuljetusrakkuloita solukalvon ( eksosytoosi ) tai kohdeorganellin, kuten lysosomin , kanssa . SNARE- proteiinia on noin 60. Ryhmäproteiinit jakautuvat kahteen toiminnalliseen luokkaan: vesikulaariproteiinit ( v-SNARE ) ja isäntäorganelliproteiinit ( t-SNARE ). Uusi rakenneluokitus jakaa ryhmän R-SNARE- ja Q-SNARE- ryhmiin . Eniten tutkittuja proteiineja ovat ne, jotka suorittavat synaptisten rakkuloiden kuljettamisen presynaptiselle kalvolle ja niiden fuusion. Nämä proteiinit ovat botulismin jatetanuksenvaarallisten bakteerimyrkkyjen kohteita .
SNARE- proteiinit ovat pieniä, mutta laajalle levinneitä kalvoproteiineja . Huolimatta suuresta rakenteen ja koon eroista, näitä proteiineja yhdistää sama 60–70 aminohapon sytosolinen domeeni , nimeltään SNARE-motiivi (tai SNARE -domeeni), joka pystyy muodostamaan palautuvan, mutta vahvan nelijuosteisen sidoksen. Tällainen metastabiili trans - SNARE - kompleksi sisältää syntaksiini 1 :n ja SNAP-25 :n, jotka sijaitsevat solukalvolla, ja synaptobreviinin toimitetun presynaptisen vesikkelin pinnalla. Syntaksiini ja synaptobreviin on liitetty kalvoon C - terminaalisen fragmentin avulla ja tarjoavat kumpikin yhden alfaheliksin kompleksin neljän heliksin sidokselle. SNAP-25 on ankkuroitu kalvoon palmitoyyliasyyliketjujen avulla ja tarjoaa kaksi jäljellä olevaa alfaheliksiä.
| Kalvoproteiinit : vesikulaariset kuljetusproteiinit | |
|---|---|