Lintujen enkefalomyeliittivirus

Lintujen enkefalomyeliittivirus
tieteellinen luokittelu
Ryhmä:Virukset [1]Valtakunta:RiboviriaKuningaskunta:OrthornaviraeTyyppi:PisuviricotaLuokka:PisoniviricetesTilaus:PicornaviralesPerhe:pikornaviruksetSuku:TremovirusNäytä:Lintujen enkefalomyeliittivirus
Kansainvälinen tieteellinen nimi
Tremovirus A
Synonyymit
  • Lintujen enkefalomyeliittivirus
Baltimore Group
IV: (+)ssRNA-virukset

Lintujen enkefalomyeliittivirus ( Tremovirus A )  on eräs virustyyppi picornavirusperheestä . Vuonna 2014 alkuperäinen lajinimi ( Avian encephalomyelitis virus ) muutettiin samoin kuin useat muut pikornaviruslajit [2] .

Genomi

Lintujen enkefalomyeliittiviruksen genomi sekvensoitiin vuonna 1999 [3] . Viruksen genomi oli ensimmäinen linnun pikornaviruksen genomi, joka sekvensoitiin. Genomi koostuu 7032 nukleotidista ja on lyhyempi kuin mikään nisäkkään pikornavirus.

Avoin lukukehys näyttää koodaavan 2134 aminohapon polyproteiinia . Polyproteiinin sekvenssi on 39 % samanlainen kuin hepatiitti A -viruksen genomin sekvenssi [4] . Ennustettiin 11 polyproteiinin pilkkoutumistuotetta. Lintujen enkefalomyeliittivirus 5'-UTR on lyhin kaikista sekvensoiduista pikornavirusgenomeista, ja toisin kuin hepatiitti A -virus, se ei sisällä pitkiä polypyrimidiinialueita.

Muistiinpanot

  1. ↑ Virusten taksonomia  Kansainvälisen virustaksonomian komitean (ICTV) verkkosivustolla .
  2. ↑ Knowles, Nick. Nimeä 12 picornaviruslajia uudelleen  : [ fin. ] // ICTV. — Annettu koodi: 2014.016aV. - 2014. - 3 s.
  3. ↑ Marvil, P., Knowles, NJ, Mockett, AMA, Britton, P., Brown, TDK ja Cavanagh, D. (1999). Lintujen enkefalomyeliittivirus on pikornavirus ja on läheisimmin sukua hepatiitti A -virukselle. Journal of General Virology 80 : 653-662. doi : 10.1099/0022-1317-80-3-653 .
  4. ↑ Bakhshesh M. , Groppelli E. , Willcocks MM , Royall E. , Belsham GJ , Roberts LO . Pikornaviruksen lintujen enkefalomyeliittiviruksella on C-hepatiittiviruksen kaltainen sisäinen ribosomin sisääntulokohtaelementti.  (Englanti)  // Virologian lehti. - 2008. - Voi. 82, nro. 4 . - s. 1993-2003. - doi : 10.1128/JVI.01957-07 . — PMID 18077729 .