Korarkeootit

Korarkeootit
tieteellinen luokittelu
Verkkotunnus:ArchaeaTyyppi:Korarkeootit
Kansainvälinen tieteellinen nimi
Korarchaeota Barns et ai. 1996
Synonyymit

Korarkeotit [2] ( lat.  Korarchaeota ) ovat eräänlainen arkea [3] .

Niiden 16s rRNA :n geenisekvenssien analyysi osoitti, että korarkeootit ovat pitkään eronneet muusta arkeista eivätkä kuulu pääryhmiinsä crenarchaeota ( Crenarchaeota ) ja euryarchaeotes ( Euryarchaeota ) [4] . Yhden sekakulttuurissa kasvatetun korarkeootin genomin analyysi paljasti useita piirteitä, jotka ovat samanlaisia ​​kuin krenarkeootit ja euryarkeootit, mikä vahvisti hypoteesin näiden ryhmien muinaisen yhteisen esi-isän olemassaolosta [5] .

Ekologia

Korarkeootteja on löydetty vain korkean lämpötilan hydrotermisistä aukoista . Eri yksilöillä on eroja eri fylogeneettisilla tasoilla, jotka liittyvät olosuhteisiin, joissa he elävät: lämpötila, veden suolaisuus (tuore tai meri) ja/tai paikan maantiede [6] . Luonnosta on löydetty vain pieniä määriä [6] [7] [8] .

Luokitus

Kesäkuussa 2017 taksoni sisältää vain 1 kuvatun suvun ja lajin [3] , jota ei ole vielä viljelty puhdasviljelmässä [2] :

Ympäristöstä on löydetty useita genomeja, jotka kuuluvat edellä mainittuun tyyppiin, mutta eivät sukuun ja lajeihin.

Muistiinpanot

  1. 1 2 Korarchaeota  (englanniksi) National Center for Biotechnology Information (NCBI)  verkkosivuilla . (Käytetty: 28. heinäkuuta 2017) .
  2. 1 2 Vorobyova L. I. Archei: oppikirja yliopistoille. - M .  : ICC "Akademkniga", 2007. - S. 361. - 447 s. : sairas. - ISBN 978-5-94628-277-2 .
  3. 1 2 Taksonomiaselain: Korarchaeota  : [ eng. ]  // NCBI.  (Käytetty: 28. heinäkuuta 2017) .
  4. Barns SM, Delwiche CF, Palmer JD, Pace NR  Perspectives on archaeal diversity, termofiilia ja monofylia ympäristön rRNA-sekvensseistä  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America  : Journal. - 1996. - elokuu ( osa 93 , nro 17 ). - P. 9188-9193 . - doi : 10.1073/pnas.93.17.9188 . - . — PMID 8799176 .
  5. Elkins JG, Podar M., Graham DE, Makarova KS, Wolf Y., Randau L., Hedlund BP, Brochier-Armanet C., Kunin V., Anderson I., Lapidus A., Goltsman E., Barry K. , Koonin EV, Hugenholtz P., Kyrpides N., Wanner G., Richardson P., Keller M., Stetter KO Korarkeaalinen genomi paljastaa näkemyksiä arkean kehityksestä   // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States Amerikka  : lehti. - 2008. - Heinäkuu ( osa 105 , nro 1 ) - P. 8805-8806 . - doi : 10.1073/pnas.0801980105 . - . — PMID 18535141 .
  6. 1 2 Auchtung TA, Shyndriayeva G., Cavanaugh CM 16S rRNA:n fylogeneettinen analyysi ja kvantifiointi Korarchaeotasta, joka on kotoperäinen Kamtšatkan kuumista lähteistä, Venäjä  (englanniksi)  // Extremophiles : Journal. - 2011. - Vol. 15 , ei. 1 . - s. 105-116 . - doi : 10.1007/s00792-010-0340-5 . — PMID 21153671 .
  7. Reigstad LJ, Jorgensen SL, Schleper C. Korarchaeotan monimuotoisuus ja runsaus Islannin ja Kamtšatkan kuuman maan lähteissä  // ISME  J. : päiväkirja. - 2010. - Vol. 4 , ei. 3 . - s. 346-356 . - doi : 10.1038/ismej.2009.126 . — PMID 19956276 .
  8. Auchtung Thomas A. (2007). Hydrotermisen ehdokasarkeaalisen divisioonan ekologia, Korarchaeota . Väitöskirja, Harvardin yliopisto.