Proteoforms ( englanniksi proteoforms ) - proteiiniryhmät tai proteiinilajit , jotka syntyvät proteiinien modifikaatioiden seurauksena: aminohapposubstituutiot (yhden aminohapon polymorfismi) (SAP), vaihtoehtoinen silmukointi (AS) ja translaation jälkeiset modifikaatiot (PTM), kuten fosforylaatio . Termi "proteiinilaji" tai "proteoformi" viittaa proteomin pienimpään yksikköön, toisin sanoen polypeptidiin , jolla on ainutlaatuinen sekvenssi ja joka sisältää ainutlaatuisen sarjan translaation jälkeisiä modifikaatioita [1] .
Human Proteome -projektin päävaiheen tavoitteena oli täydentää master- proteomia tiedolla erilaisista modifikaatioista, kuten ei-synonyymien yhden nukleotidin polymorfismien esiintymisestä genomissa, vaihtoehtoisista silmukointiprosesseista ja translaation jälkeisistä modifikaatioista. Tämän seurauksena pilottivaiheessa saadun pääproteomin sijaan, kun yhtä geeniä vastasi vain yksi (master)proteiini, analysoitiin projektin päävaiheessa koko valikoima yhden geenin koodaamia mahdollisia proteomuotoja. Yksi geeni voi koodata jopa 100 proteiinia (eli useita miljoonia proteomuotoja organismin mittakaavassa) tai useita kymmeniä tuhansia ihmisen kromosomissa 18 . Human Proteome -projektin päävaihe mahdollistaa olemassa olevien bioinformaattisten ennustusalgoritmien kriittisen arvioinnin ja mahdollisesti uusien kokeelliseen tietoon perustuvien algoritmien kehittämisen ei-kanonisten proteomuotojen havaitsemiseen [2] .