Syndekan 4

Syndekan 4

ATE on laadittu 1ejp:n perusteella.
Käytettävissä olevat rakenteet
ATE Ortologinen haku: PDBe , RCSB
Tunnisteet
SymboliSDC4  ; SYND4
Ulkoiset tunnuksetOMIM:  600017 MGI :  1349164 Homologi :  31121 GeneCards : SDC4 Gene
RNA-ekspressioprofiili
Lisää tietoa
ortologit
NäytäIhmisenHiiri
Entrez638520971
YhtyeENSG00000124145ENSMUSG00000017009
UniProtP31431O35988
RefSeq (mRNA)NM_002999NM_011521
RefSeq (proteiini)NP_002990NP_035651
Locus (UCSC)Chr 20:
43,95 – 43,98 Mb
Chr 2:
164,42 - 164,44 Mb
Hae PubMedistä[yksi][2]

Syndecan 4 ( englanniksi  syndecan 4 ) on kalvoproteiini , syndekaanien perheen proteoglykaani tai transmembraaniset heparaanisulfaattiproteoglykaanit. Ihmisen geenituote SDC4 . Kuten syndekaani 2 , sen pinnalla on heparaanisulfaattiketjuja .

Toiminnot

Proteiini on transmembraaninen heparaanisulfaattiproteoglykaani, joka kuuluu syndekaanien perheeseen. Syndekaanit välittävät solujen sitoutumista, solusignalointia ja sytoskeleton organisointia . Ne ovat HIV - viruksen Tat -proteiinin reseptoreita . Syndekaani 4 sisältää syndekaani 2 :n tavoin heparaanisulfaattiketjuja , jotka muodostavat yhteyden sytoskeleton ja solunulkoisen matriisin välillä.

Vuorovaikuttaa GIPC-, NUDT16L1-, CDCP1- ja SDCBP-proteiinien kanssa. [yksi]

Rakenne

Kypsä proteiini koostuu 180 aminohaposta, proteiiniosan molekyylipaino on 21,6 kDa. Sisältää N-terminaalisen ekstrasellulaarisen domeenin (127 aminohappoa), yhden kierteisen transmembraanifragmentin ja pienen sytosolisen alueen. Solunulkoisella domeenilla on 3 kiinnityskohtaa O -heparaanisulfaattiketjuille.

Kudosspesifisyys

Ilmenee epiteelisoluissa ja fibroblasteissa .

Nivelrikko

Syndecan 4 - tasot ovat kohonneet nivelrikossa . Hiiren mallikokeissa tämän proteiinin eston on osoitettu vähentävän nivelrikon aiheuttamaa ruston tuhoa. [2]

Katso myös

Muistiinpanot

  1. Uniprot P31431 . Haettu 14. marraskuuta 2012. Arkistoitu alkuperäisestä 10. elokuuta 2017.
  2. Hass MJ SDC4: OA yhteinen ponnistus  (määrittämätön)  // SciBX. - 2009. - syyskuu ( osa 2 , nro 34 ). - doi : 10.1038/scibx.2009.1297 .

Kirjallisuus

Linkit