Fragmentteja Okazakista

Okazaki - fragmentit ovat suhteellisen lyhyitä DNA -fragmentteja ( RNA  - alukkeella 5' - päässä ), jotka muodostuvat jäljessä olevalle juosteelle DNA:n replikaation aikana . Okazaki-fragmenttien pituus E. colissa on noin 1000-2000 nukleotidia , kun taas eukaryooteissa  se on yleensä 100-200 nukleotidia.

Okazaki-fragmentteja kuvasivat vuonna 1968 Reiji Okazaki , Tsuneko Okazaki ja muut kirjoittajat tutkiessaan bakteriofagin DNA:n replikaatiota E. colissa [1] [2] .

Mekanismi

Jokainen Okazaki-fragmentti muodostuu replikaatiohaarukan viereen primaasin muodostaman RNA- alukkeen jälkeen ja edelleen DNA-polymeraasi III :lla prokaryoottien tapauksessa. Eukaryooteissa DNA-polymeraasi α syntetisoi jäljessä olevan juosteen . Alukkeen poistaa myöhemmin entsyymi, jolla on endonukleaasiaktiivisuutta, kuten RNaasi H , flap-endonukleaasi ja DNA2L-helikaasi /nukleaasi [ en .

Muistiinpanot

1. ↑ Okazaki R, Okazaki T, Sakabe K, Sugimoto K. DNA-replikaation mekanismi DNA-ketjun kasvun mahdollinen katkonaisuus. Jpn J Med Sci Biol. 1967 Jun;20(3):255-260. PMID 4861623
2. ↑ Ogawa T, Okazaki T, Epäjatkuva DNA:n replikaatio. Annu. Rev. Biochem. 49:421-457, 1980. doi : 10.1146/annurev.bi.49.070180.002225

Kirjallisuus

1. Inman RB, Schnos M. Haarapisteiden rakenne replikoituvassa DNA:ssa: Yksijuosteisten yhteyksien esiintyminen lambda-DNA:n haarapisteissä. J. Mol Biol. 56:319-325, 1971. doi : 10.1016/0022-2836(71)90467-0 . PMID 4927949
2. Thommes P, Hubscher U. Eukaryoottinen DNA:n replikaatio. Haarukalla vaikuttavat entsyymit ja proteiinit. euroa J Biochem. 194(3):699-712, 1990. doi : 10.1111/j.1432-1033.1990.tb19460.x . PMID 2269294