Biologinen turvallisuus on elävien organismien suorittamaa biologisen olemuksensa, biologisten ominaisuuksiensa, järjestelmää muodostavien suhteiden ja ominaisuuksien säilyttämistä, biologisen eheyden laajamittaisen menettämisen estämistä, joka voi aiheutua seuraavista syistä:
Työskenneltäessä tartunnanaiheuttajien kanssa tulee noudattaa käytännön ohjeita, jotka kuvaavat asianmukaiset välineet biologisen materiaalin turvalliseen varastointiin sekä tarvittavat laitteet ja toiminnot, jotka laboratoriohenkilöstön on suoritettava. Näitä ohjeita kutsutaan bioturvallisuustasoksi (BSL). Tällaisia tasoja on neljä.
Bioteknologia on uusi tieteenala, ja siksi geneettisesti muunnettujen organismien (GMO) vuorovaikutusta eri ekosysteemien kanssa ei vielä täysin ymmärretä. GMO:illa voi olla ominaisuuksia, joita niiden kehittäjät eivät ole ajatelleet. Esimerkiksi aluksi vaarattomat mikro-organismit voivat olla tarttuvia ja kasvit voivat olla kilpailukykyisempiä kuin normaalit saman tai muun lajin kasvit. Tältä osin on mahdollista korvata tavanomaiset lajit geneettisesti muunnetuilla, risteyttää GMO:t saman tai sukulaislajin tavallisten organismien kanssa. On myös olemassa riski rikkakasvien ja hyönteisten vastustuskykyisten rikkakasvien ilmaantumisesta , koska muunnetut geenit voivat siirtyä luonnonvaraisiin kasveihin ja tuholaisresistentit kasvit voivat aiheuttaa riskin hyödyllisille hyönteisille.
Vuonna 1999 Kolumbiassa Cartagena de Indiasin kaupungissa pidetyssä konferenssissa hyväksyttiin kansainvälinen Cartagenan bioturvallisuuspöytäkirja ., jossa määritellään toimenpiteet ja menettelyt, jotka ovat tarpeen GMO:ien turvallisen siirtämisen, käsittelyn ja käytön kannalta kansallisten rajojen yli.