Histonideasetylaasi 6

Otettu käyttöön ATE 3C5K :n perusteella .

Käytettävissä olevat rakenteet

Ortologinen haku: PDBe , RCSB

Luettelo ATE:n tunnuksista
3C5K , 3GV4 , 3PHD

Tunnisteet

Symboli

HDAC6 ; CPBHM; HD6; PPP1R90

Ulkoiset tunnukset

OMIM: 300272 MGI : 1333752 Homologeeni : 31353 IUPHAR : ChEMBL : 1865 GeneCards : HDAC6 Gene

EY-numero

3.5.1.98

Geeniontologia
Toiminto	• aktiinin sitominen • histonideasetylaasiaktiivisuus • proteiineihin sitoutuminen • beeta-kateniinin sitoutuminen • mikrotubulusten sitoutuminen • sinkki-ionien sitoutuminen • entsyymin sitoutuminen • polyubikitiinin sitoutuminen • NAD-riippuvainen histonideasetylaasiaktiivisuus (H3-K14-spesifinen) • histonideasetylaasisitoutuminen • tubuliinideasetylaasiaktiivisuus • alfa-tubuliini sitoutuminen • NAD-riippuvainen histonideasetylaasiaktiivisuus (H3-K9-spesifinen) • NAD-riippuvainen histonideasetylaasiaktiivisuus (H4-K16-spesifinen) • tau-proteiinin sitoutuminen • beetatubuliinisitoutuminen • Hsp90-proteiinin sitoutuminen • dyneiinikompleksin sitoutuminen • NAD-riippuvainen histonideasetylaasiaktiivisuus (H3-K18-spesifinen)
solukomponentti	• histonideasetylaasikompleksi • tuma • sytoplasma • sytosoli • mikrotubulus • mikrotubuluksiin liittyvä kompleksi • sytoplasminen mikrotubulus • caveola • inkluusiokappale • aggressiivinen • dyneiinikompleksi • aksoni • dendriitti • solun etureuna • perikaryoni • sytoplasman perinukleaarinen alue
biologinen prosessi	• proteiinien polyubiquitinaatio • transkriptio, DNA-templaatti • proteiinin deasetylaatio • väärin laskostunut tai epätäydellisesti syntetisoitu proteiinikatabolinen prosessi • solunsisäinen proteiinin kuljetus • mikrotubulusten depolymeroinnin negatiivinen säätely • vaste myrkylliselle aineelle • signaalinsiirron positiivinen säätely • vaste orgaaniselle aineelle • reseptoriaktiivisuuden säätely • positiivinen epiteelisolujen migraation säätely • vetyperoksidin aineenvaihduntaprosessin negatiivinen säätely • reseptorin biosynteesiprosessin positiivinen säätely • makroautofagia • histonien deasetylaatio • lysosomien lokalisaatio • peptidyyli-lysiinin deasetylaatio • soluvaste topologisesti väärälle proteiinille • ubikvitiiniriippuvainen proteiinikatabolinen prosessi multivesikulaarisen prosessin kautta kehon lajittelureitti • proteiinikompleksin purkaminen • proteiinikompleksin purkamisen negatiivinen säätely • proteolyysin negatiivinen säätely • transkription negatiivinen säätely, DNA-templaatti • oksidoreduktaasiaktiivisuuden negatiivinen säätely • vaste mi laskostunut proteiini • mikrotubuluspohjaisen liikkeen säätely • androgeenireseptorin signaalireitin säätely • proteiinin lokalisoinnin säätely • soluvaste vetyperoksidille • aggressiivinen kokoonpano • polyubiquitinated väärin laskostunut proteiinikuljetus • Hsp90 deasetylaatio • vaste kasvutekijälle • histoni H3 deasetylaatio • histoni H4 deasetylaatio • soluvaste väärin laskostuneelle proteiinille • kaperonivälitteisen proteiinikompleksin muodostumisen positiivinen säätely • tubuliinin deasetylaatio • vetyperoksidivälitteisen ohjelmoidun solukuoleman positiivinen säätely
Lähteet: Amigo / QuickGO

RNA-ekspressioprofiili

Lisää tietoa

ortologit

Näytä

Ihmisen

Hiiri

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (proteiini)

Locus (UCSC)

Chr HG1436_HG1432_PATCH:
48,66 – 48,68 Mb

Chr X:
7,93 – 7,95 Mb

Hae PubMedistä

[yksi]

[2]

Histoni deasetylaasi 6 ( Histon deasetylaasi 6 ) on entsyymi , jota HDAC6 -geeni koodaa ihmisissä [1] [2] .

Toiminto

Histoneilla on kriittinen rooli transkription , solusyklin ja kehitysprosessin säätelyssä. Histonin asetylaatio/deasetylaatio muuttaa kromatiinin rakennetta ja vaikuttaa transkriptioon. Histonideasetylaasi 6 kuuluu histonideasetylaasi/acuc/APHA-perheen luokkaan II. Se sisältää kaksi katalyyttistä domeenia , jotka toimivat toisistaan riippumatta. Proteiinilla on histonideasetylaasiaktiivisuutta ja se estää transkriptiota [3] .

Kliininen merkitys

Tämän geenin mutaatiot on yhdistetty Alzheimerin tautiin [4] .

Tämän proteiinin yli-ilmentyminen korreloi onkogeneesin ja solujen eloonjäämisen kanssa ja edistää myös syöpäsolujen etäpesäkkeitä [5] .

Toiminnot

Histonideasetylaasi 6 osallistuu solujen värekkojen purkamiseen, mikä on välttämätöntä mitoosin alkamiselle [6] . Se myös edistää solujen migraatiota ja katalysoi α-tubuliinin deasetylaatiota [7] , mikä voi edistää syövän etäpesäkkeitä [5] . Vaikuttaa transkriptioon ja translaatioon säätelemällä lämpösokkiproteiinia Hsp90 ja stressirakeita, vastaavasti [5] .

Tunnettu korkeasta affiniteetistaan ubikvitinoituja proteiineja kohtaan [8] . Histonideasetylaasi 6:lla on tärkeä rooli stressirakeiden muodostumisessa ; histonideasetylaasi 6:n synteesin farmakologisella estolla tai suppressiolla geneettisellä tasolla stressirakeiden muodostuminen pysähtyy.

Vuorovaikutuksia

HDAC6:n on osoitettu olevan vuorovaikutuksessa HDAC11 : n [9] ja ZBTB16:n [10] kanssa .

HDAC6 on myös vuorovaikutuksessa G3BP1 stressiraeproteiinin kanssa [8] .

Katso myös

Histonideasetylaasit

Muistiinpanot

↑ Grozinger CM, Hassig CA, Schreiber SL. Kolme proteiinia määrittelee luokan ihmisen histonideasetylaasit, jotka liittyvät hiivan Hda1p:hen // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal . - 1999. - Kesäkuu ( osa 96 , nro 9 ) . - P. 4868-4873 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.4868 . — PMID 10220385 .
↑ Nagase T., Ishikawa K., Suyama M., Kikuno R., Hirosawa M., Miyajima N., Tanaka A., Kotani H., Nomura N., Ohara O. Tuntemattomien ihmisen geenien koodaavien sekvenssien ennustaminen. XII. 100 uuden cDNA - kloonin täydelliset sekvenssit aivoista, jotka koodaavat suuria proteiineja in vitro // DNA Research : päiväkirja. - 1999. - toukokuu ( osa 5 , nro 6 ). - s. 355-364 . - doi : 10.1093/dnares/5.6.355 . — PMID 10048485 .
↑ Entrez-geeni: HDAC6-histonideasetylaasi 6 . (määrätön)
↑ Cook C., Gendron TF, Scheffel K., Carlomagno Y., Dunmore J., DeTure M., Petrucelli L. HDAC6 :n, uuden CHIP-substraatin, häviäminen lievittää epänormaalia tau:n kertymistä // Human Molecular Genetics : päiväkirja. - Oxford University Press , 2012. - 5. huhtikuuta. - doi : 10.1093/hmg/dds125 . — PMID 22492994 .
↑ 1 2 3 Aldana-Masangkay GI, Sakamoto KM HDAC6:n rooli syövässä // BioMed Research International : päiväkirja. - 2011. - Voi. 2011 . - P. 875824 . - doi : 10.1155/2011/875824 . — PMID 21076528 .
↑ Gradilone SA , Radtke BN , Bogert PS , Huang BQ , Gajdos GB , LaRusso NF HDAC6:n esto palauttaa siliaarisen ilmentymisen ja vähentää kasvaimen kasvua. (englanti) // Syöpätutkimus. - 2013. - Vol. 73, nro. 7 . - s. 2259-2270. - doi : 10.1158/0008-5472.CAN-12-2938 . — PMID 23370327 .
↑ Gao YS, Hubbert CC, Lu J., Lee YS, Lee JY, Yao TP Histonideasetylaasi 6 säätelee kasvutekijän aiheuttamaa aktiinin uudelleenmuodostumista ja endosytoosia // Molecular and Cellular Biology : päiväkirja. - 2007. - Voi. 27 , ei. 24 . - P. 8637-8647 . - doi : 10.1128/MCB.00393-07 . — PMID 17938201 .
↑ 1 2 Kwon S., Zhang Y., Matthias P. Deasetylaasi HDAC6 on stressivasteeseen osallistuvien stressirakeiden uusi kriittinen komponentti // Genes & Development : Journal . - 2007. - Joulukuu ( osa 21 , nro 24 ). - P. 3381-3394 . - doi : 10.1101/gad.461107 . — PMID 18079183 .
↑ Gao L., Cueto MA, Asselbergs F., Atadja P. HDAC11:n, ihmisen histonideasetylaasiperheen uuden jäsenen, kloonaus ja toiminnallinen karakterisointi // Journal of Biological Chemistry : Journal. - 2002. - Heinäkuu ( nide 277 , nro 28 ). - P. 25748-25755 . - doi : 10.1074/jbc.M111871200 . — PMID 11948178 .
↑ Chauchereau A., Mathieu M., de Saintignon J., Ferreira R., Pritchard LL, Mishal Z., Dejean A., Harel-Bellan A. HDAC4 välittää akuutin promyelosyyttisen leukemiaan liittyvän proteiinin PLZF transkription repressiota . ) / / Onkogeeni : päiväkirja. - 2004. - marraskuu ( osa 23 , nro 54 ). - P. 8777-8784 . - doi : 10.1038/sj.onc.1208128 . — PMID 15467736 .

Kirjallisuus

Pazin MJ, Kadonaga JT Mitä ylös ja alas histonin deasetylaatiossa ja transkriptiossa? (englanniksi) // Solu : päiväkirja. - Cell Press , 1997. - Voi. 89 , ei. 3 . - s. 325-328 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80211-1 . — PMID 9150131 .
Wolffe AP Transkription ohjaus. Syntinen sorto (englanniksi) // Luonto. - 1997. - Voi. 387 , no. 6628 . - s. 16-7 . - doi : 10.1038/387016a0 . — PMID 9139815 .
Huynh KD, Fischle W., Verdin E., Bardwell VJ BCoR, uusi ydinpressori, joka osallistuu BCL-6:n tukahduttamiseen // Genes & Development : Journal . - 2000. - Voi. 14 , ei. 14 . - P. 1810-1823 . - doi : 10.1101/gad.14.14.1810 . — PMID 10898795 .
Mahlknecht U., Schnittger S., Landgraf F., Schoch C., Ottmann OG, Hiddemann W., Hoelzer D. Ihmisen histonideasetylaasi 6 -geenin (HDAC6) kohdistaminen X-kromosomiin p11.23 in situ -hybridisaatiolla (eng. ) // Sytogenetiikka ja genomitutkimus : päiväkirja. - 2001. - Voi. 93 , ei. 1-2 . - s. 135-136 . - doi : 10.1159/000056967 . — PMID 11474198 .
Kao HY, Lee CH, Komarov A., Han CC, Evans RM Isolation and characterization of nisäkäs HDAC10, a new histon deasetylase (englanti) // Journal of Biological Chemistry : Journal. - 2002. - Voi. 277 , no. 1 . - s. 187-193 . - doi : 10.1074/jbc.M108931200 . — PMID 11677242 .
Seigneurin-Berny D., Verdel A., Curtet S., Lemercier C., Garin J., Rousseaux S., Khochbin S. Hiiren histonideasetylaasi 6 -kompleksin komponenttien tunnistaminen: asetylaation ja ubikvitinoinnin signaalipolkujen välinen yhteys ) // Molekyyli- ja solubiologia : päiväkirja. - 2001. - Voi. 21 , ei. 23 . - P. 8035-8044 . - doi : 10.1128/MCB.21.23.8035-8044.2001 . — PMID 11689694 .
Tong JJ, Liu J., Bertos NR, Yang XJ HDAC10:n, uuden luokan II ihmisen histonideasetylaasin, joka sisältää runsaasti leusiinia sisältävän domeenin, tunnistaminen // Nucleic Acids Research : päiväkirja. - 2002. - Voi. 30 , ei. 5 . - s. 1114-1123 . doi : 10.1093/nar/ 30.5.1114 . — PMID 11861901 .
Gao L., Cueto MA, Asselbergs F., Atadja P. HDAC11:n, ihmisen histonideasetylaasiperheen uuden jäsenen, kloonaus ja toiminnallinen karakterisointi // Journal of Biological Chemistry : Journal. - 2002. - Voi. 277 , no. 28 . - P. 25748-25755 . - doi : 10.1074/jbc.M111871200 . — PMID 11948178 .
Hubbert C., Guardiola A., Shao R., Kawaguchi Y., Ito A., Nixon A., Yoshida M., Wang XF, Yao TP HDAC6 on mikrotubuluksiin liittyvä deasetylaasi // Nature . - 2002. - Voi. 417 , no. 6887 . - s. 455-458 . - doi : 10.1038/417455a . — PMID 12024216 .
Kirsh O., Seeler JS, Pichler A., Gast A., Müller S., Miska E., Mathieu M., Harel-Bellan A., Kouzarides T., Melchior F., Dejean A. SUMO E3 ligaasi RanBP2 edistää HDAC4-deasetylaasin muuntamista // The EMBO Journal : päiväkirja. - 2002. - Voi. 21 , ei. 11 . - P. 2682-2691 . - doi : 10.1093/emboj/21.11.2682 . — PMID 12032081 .
Hook SS, Orian A., Cowley SM, Eisenman RN Histonideasetylaasi 6 sitoo polyubikvitiinia sinkkisormensa (PAZ-domeeni) kautta ja puhdistuu yhdessä deubikitiinientsyymien kanssa // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : Journal. - 2002. - Voi. 99 , ei. 21 . - P. 13425-13430 . - doi : 10.1073/pnas.172511699 . — PMID 12354939 .
Westendorf JJ, Zaidi SK, Cascino JE, Kahler R., van Wijnen AJ, Lian JB, Yoshida M., Stein GS, Li X. Runx2 (Cbfa1, AML-3) on vuorovaikutuksessa histonideasetylaasi 6:n kanssa ja tukahduttaa p21CIP1/WAF1-promoottorin (englanti) // Molecular and Cellular Biology : päiväkirja. - 2002. - Voi. 22 , ei. 22 . - P. 7982-7992 . - doi : 10.1128/MCB.22.22.7982-7992.2002 . — PMID 12391164 .
North BJ, Marshall BL, Borra MT, Denu JM, Verdin E. Ihmisen Sir2-ortologi, SIRT2, on NAD+-riippuvainen tubuliinideasetylaasi // Molecular Cell : päiväkirja. - 2003. - Voi. 11 , ei. 2 . - s. 437-444 . - doi : 10.1016/S1097-2765(03)00038-8 . — PMID 12620231 .
Voelter-Mahlknecht S., Mahlknecht U. Ihmisen histonideasetylaasi 6 -geenin kloonaus ja rakenteellinen karakterisointi // International Journal of Molecular Medicine : päiväkirja. - 2004. - Voi. 12 , ei. 1 . - s. 87-93 . - doi : 10.3892/ijmm.12.1.87 . — PMID 12792815 .
Brush MH, Guardiola A., Connor JH, Yao TP, Shenolikar S. Deaktylaasin estäjät häiritsevät proteiinifosfataaseja ja deasetylaaseja sisältäviä solukomplekseja // Journal of Biological Chemistry : Journal. - 2004. - Voi. 279 , nro. 9 . - P. 7685-7691 . - doi : 10.1074/jbc.M310997200 . — PMID 14670976 .
Pandey UB, Batlevi Y., Baehrecke EH, Taylor JP HDAC6 autofagian, ubikitiini-proteasomijärjestelmän ja neurodegeneraation risteyksessä (englanniksi) // Autofagia : Journal. — Voi. 3 , ei. 6 . - s. 643-645 . - doi : 10.4161/auto.5050 . — PMID 17912024 . (Epub 2007, 10. syyskuuta)
Pandey UB, Nie Z., Batlevi Y., McCray BA, Ritson GP, Nedelsky NB, Schwartz SL, DiProspero NA, Knight MA, Schuldiner O., Padmanabhan R., Hild M., Berry DL, Garza D., Hubbert CC, Yao TP, Baehrecke EH, Taylor JP HDAC6 pelastaa hermoston rappeutumisen ja tarjoaa olennaisen yhteyden autofagian ja UPS:n välillä // Nature : Journal. - 2007. - 14. kesäkuuta ( nide 447 , nro 7146 ). - s. 859-863 . - doi : 10.1038/luonto05853 . — PMID 17568747 .