Translokaasit ovat erillinen entsyymiluokka , joka katalysoi ionien tai molekyylien siirtymistä kalvojen läpi tai niiden erottumista kalvoissa. Tämä entsyymiluokka muodostettiin aiemmin kuuluneista muihin entsyymiluokkiin. [yksi]
ATP-syntaasi - aiemmin entsyymi kuului kolmanteen luokkaan ja nimettiin nimikkeistön mukaan - ATP-fosfohydrolaasi, mutta nimi ei vastaa entsyymin luonnetta, koska ATP-hydrolyysiä ei käytännössä tapahdu.
Translokaasien luokkaan siirretyille entsyymeille on säilytetty entiset systemaattiset nimet.
7. luokan entsyymit katalysoivat molekyylien tai ionien siirtymistä kalvojen läpi yhdistettynä muihin reaktioihin.
Esimerkiksi, kun protonit siirretään mitokondriomatriisista kalvojen väliseen tilaan elektroninkuljetusketjun kompleksin I kautta (7.1.1.2), ubikinoni pelkistyy ubikinoliksi ja reaktio kuvataan seuraavalla kaaviolla [2] :
NADH + CoQ + 6H + [ puoli 1 ] = NAD + + CoQH 2 + 7H + [puoli 2 ]Toinen esimerkki on ATP-syntaasi , joka katalysoi protonien siirtoreaktiota mitokondrion membraanien välisestä tilasta matriisiin ATP-molekyylin muodostuessa ADP:stä ja epäorgaanisesta fosfaatista, reaktio kuvataan kaaviolla [3] :
ADP + Phn + 4 H + [ puoli 1] → ATP + H 2 O + 4 H + [puoli 2]Entsyymit ovat säilyttäneet systemaattiset nimet, jotka osoittavat niiden entisen luokan.
Seitsemännen luokan kuljetetuista ioneista tai molekyyleistä riippuen erotetaan kuusi alaluokkaa.
EC 7.1 - entsyymit, jotka katalysoivat vetyprotonien H + translokaatiota ;
EC 7.2 - entsyymit, jotka katalysoivat epäorgaanisten kationien ja niiden kelaattien translokaatiota;
EC 7.3 - entsyymit, jotka katalysoivat epäorgaanisten anionien translokaatiota;
EC 7.4 - entsyymit, jotka katalysoivat aminohappojen ja peptidien translokaatiota;
EC 7.5 - entsyymit, jotka katalysoivat hiilihydraattien ja niiden johdannaisten translokaatiota;
EC 7.6 - entsyymit, jotka katalysoivat muiden yhdisteiden translokaatiota.
Jako alaluokkiin perustuu reaktioihin, jotka tarjoavat liikkeelle panevan voiman:
EC 7._.1 - entsyymit, jotka katalysoivat redox-reaktioihin liittyviä translokaatioreaktioita;
EC 7._.2 - entsyymit, jotka katalysoivat nukleosiditrifosfaatin hydrolyysiin liittyviä translokaatioreaktioita;
EC 7._.3 - entsyymit, jotka katalysoivat difosfaattihydrolyysiin liittyviä translokaatioreaktioita;
EC 7._.4 - entsyymit, jotka katalysoivat dekarboksylaatioreaktioon liittyviä translokaatioreaktioita.
Tämän luokan entsyymeihin ei sisälly kanavia (huokosia), jotka muuttavat konformaatiota avoimen ja suljetun tilan välillä vasteena mille tahansa toiminnalle, eikä kuljettajia, jotka eivät ole riippuvaisia entsyymikatalysoimista reaktioista.
Jo kuvatun ATP-syntaasin ja NADH-dehydrogenaasikompleksin lisäksi seitsemäs entsyymiluokka sisältää:
Kinoli: ferrisytokromi- c - oksidoreduktaasi (EC 7.1.1.8 ), entsyymi, jota usein kutsutaan sytokromi bc 1 -kompleksiksi tai kompleksiksi III, on elektroninkuljetusketjun kolmas kompleksi. Sitä esiintyy kaikkien aerobisten eukaryoottien mitokondrioissa ja useimpien bakteerien sisäkalvoissa.
Sytokromi c -oksidaasi (EC 7.1.1.9 ) tai elektroninkuljetusketjun kompleksi IV on aerobisen hengityselektronin kuljetusketjun terminaalinen oksidaasi , joka katalysoi elektronien siirtymistä sytokromi c : stä happeen muodostaen vettä .
Na + /K + -vaihto-ATPaasi (EC 7.2.2.13 ) on plasmamembraanientsyymi, joka esiintyy kaikkialla eläinsoluissa ja joka katalysoi kolmen Na + :n ulosvirtausta ja kahden K + :n sisäänvirtausta hydrolysoituneeseen ATP:hen. Se osallistuu plasmakalvon sähköpotentiaalin muodostukseen.
H + / K + -vaihto-ATPaasi (EC 7.2.2.19 ) on mahalaukun limakalvon entsyymi, joka katalysoi yhden H + :n ulosvirtausta ja yhden K + :n sisäänvirtausta ATP-hydrolyysin seurauksena.
Polaaristen aminohappojen (EC 7.4.2.1 ), ei-polaaristen aminohappojen (EC 7.4.2.2 ), mitokondrioproteiinin (EC 7.4.2.3 ) kuljettajat, jotka käyttävät ATP-hydrolyysiä kuljetukseen.
Ksenobioottinen kantaja (EC 7.6.2.2 ) - grampositiivisten bakteerien ja eukaryoottisolujen entsyymit vievät joukkoon epätavallisen spesifisyyden omaavia lääkkeitä, jotka kattavat eri ryhmiä toisiinsa liittymättömiä aineita jättäen huomiotta jotkin rakenteeltaan läheisesti sukua olevat aineet. Yhdessä eukaryoottisolussa voi olla useita erilaisia entsyymejä. Monet niistä kuljettavat myös glutationi-lääkekonjugaatteja (katso EC 7.6.2.3 , ABC-tyyppinen glutationi- S -konjugaattikuljettaja ), kun taas toisilla on myös jonkin verran "flipaasi"-aktiivisuutta.
Asyyli-CoA-kuljettaja (EC 7.6.2.4 ) on eläin- ja hiivaentsyymi, joka kuljettaa rasvahappoasyyli-CoA:ta peroksisomeihin ja niistä pois. Ihmisillä se liittyy Zellwegerin oireyhtymään .