7SL RNA

7SL RNA
Tunnisteet
Symbolit RN7SL1 , 7L1a, 7SL, RN7SL, RNSRP1, signaalintunnistuspartikkelin RNA, RNA, 7SL, sytoplasma 1, signaalintunnistuspartikkelin 7SL1 RNA-komponentti
Ulkoiset tunnukset OMIM: 612177 GeneCards: 6029
ortologit
Erilaisia Ihmisen Hiiri
Entrez

6029

n/a

Yhtye

ENSG00000276168

n/a

UniProt

n/a

n/a

RefSeq (mRNA)

n/a

n/a

RefSeq (proteiini)

n/a

n/a

Locus (UCSC) Chr 14: 49,59 – 49,59 Mb n/a
PubMed- haku [yksi] n/a
Muokkaa (ihminen)

7SL RNA  on pitkä ei-koodaava RNA , joka on osa eukaryoottista signaalintunnistuspartikkelia ( signaalintunnistuspartikkeli , SRP ) .  SRP on pieni sytoplasminen riboproteiinikompleksi, jonka sedimentaatiotekijä on 11S ja joka osallistuu proteiinien yhteistranslaatioon . SRP-partikkeli tunnistaa vain ribosomista vapautuvan syntetisoidun proteiinin N-terminaalisen signaalisekvenssin , joka sitten sitoutuu ribosomin pieneen alayksikköön, hidastaa tilapäisesti translaatiota tässä ribosomissa ja varmistaa polypeptidi-ribosomin kiinnittymisen. kompleksi karkean endoplasmisen retikulumin kalvoon [1] . SRP osallistuu myös yhteen proteiinien translaation jälkeisen kuljetuksen mekanismeista [2]

Eukaryoottinen SRP sisältää yhdessä 7SL-RNA:n kanssa kuusi proteiinialayksikköä: SRP9 , SRP14 , SRP19 , SRP54 , SRP68 ja SRP72 [3] .

Ihmisen genomissa on ainakin kolme toiminnallista kopiota 7SL-RNA-geenistä: RN7SL1, RN7SL2 ja RN7SL3 . Nämä geenit transkriptoi RNA-polymeraasi III [4] .

Todennäköisesti 7SL-RNA:sta keskussekvenssin deleetion seurauksena syntyi Alu-toistoja , jotka ovat yleinen lyhyiden hajallaan olevien toistojen perhe ( eng.  SINEs ) [5] .

Rakenne

7SL-RNA:n pituus on noin 300 nukleotidia, SRP:stä eristetyn RNA-molekyylin sedimentaatiokerroin on 7S [6] . 7SL RNA:n sekundaarisessa rakenteessa on kahdeksan kierteistä elementtiä, jotka laskostuvat Alu-domeeniksi ja S-domeeniksi, jotka erottaa pitkä linkkerialue [7] . Alu-domeenin uskotaan välittävän peptidiketjun pidentymisen hidastamista [7] . Helix 8, joka on vuorovaikutuksessa SRP54-proteiinin M-domeenin kanssa, välittää signaalisekvenssin tunnistusta . Helix 8 -sekvenssillä on suuri samankaltaisuus bakteerien ja arkeaalisten homologisten RNA:iden kanssa. SRP19-helix 6 -kompleksin uskotaan osallistuvan SRP:n kokoamiseen ja stabiloivan heliksiä 8 sitoutumista varten SRP54:ään [8] .

Discovery

7SL-RNA havaittiin ensin lintujen ja hiirten onkogeenisistä viruspartikkeleista [9] . Myöhemmin 7SL-RNA:n havaittiin olevan stabiili osa infektoimattomissa HeLa-soluissa , missä se liittyy kalvoihin ja polysomifraktioihin. Vuonna 1980 solubiologit eristivät "signaalintunnistusproteiinin" (lyhennetty "SRP") koiran haimasta, joka helpotti eritysproteiinien siirtymistä endoplasmisen retikulumin kalvon läpi. Sitten SRP:n havaittiin sisältävän RNA-komponentin. 7SL RNA:n SRP-geenien vertailu eri lajeissa osoitti, että 8 7SL RNA:n heliksi on erittäin konservoitunut. Alueet, jotka sijaitsevat lähellä nisäkkään 7SL-RNA :n 5'- ja 3'-päitä, ovat samanlaisia ​​kuin hallitseva Alu -toistoperhe ihmisen genomissa. Nyt tiedetään, että Alu-DNA oli peräisin 7SL-RNA:sta keskusalueen deleetiolla, jota seurasi käänteinen transkriptio ja integraatio useille ihmisen kromosomien alueille. 7SL RNA:ta on tunnistettu myös joissakin organelleissa , kuten monien fotosynteettisten organismien plastideissa [10] .

Toiminnot

Lähetyskuljetus

7SL RNA on olennainen osa SRP:n pientä ja suurta domeenia. Pienen domeenin tehtävänä on viivyttää proteiinin translaatiota, kunnes ribosomiin sitoutunut SRP pystyy sitoutumaan kalvossa asuvaan SRP-reseptoriin (SR). Preseptorin sitoutuminen signaalipeptidillä täytettyyn SRP:hen edistää kahden guanosiinitrifosfaattimolekyylin (GTP) hydrolyysiä. Tämä reaktio vapauttaa SRP:tä SR-reseptorista ja ribosomista, mikä mahdollistaa translaation jatkumisen ja proteiinin pääsyn translokoniin [11] . Proteiini läpäisee kalvon yhdessä translaation aikana ja menee endoplasmisen retikulumin sisäpuolelle [12] .

Käännöksen jälkeinen lajittelu

SRP osallistuu myös proteiinien lajitteluun niiden synteesin päätyttyä (posttranslationaalinen proteiinien lajittelu). Eukaryooteissa häntäankkuroituja proteiineja, joiden C-päässä on hydrofobinen inserttisekvenssi, kuljetetaan endoplasmiseen retikulumiin SRP:n avulla [13] . Samoin SRP edistää nukleaaristen proteiinien translaation jälkeistä tuontia kloroplastien tylakoidikalvoon.

Muistiinpanot

  1. ↑ Appel B., Beneke B.-I., Muller S. Nucleic acids: from A to Z / toim. S. Muller. - M. : Binom: Knowledge Laboratory, 2013. - 413 s. -700 kappaletta.  - ISBN 978-5-9963-0376-2 .
  2. ↑ Johnson, N., K. Powis, S. High,. Posttranslationaalinen translokaatio endoplasmiseen retikulumiin  (englanniksi)  // Biochimica et Biophysica Acta - Molecular Cell Research. - 2013. - Vol. 1833 , no. 11 . - P. 2403-2409. - doi : 10.1016/j.bbamcr.2012.12.008 .
  3. ↑ Birse DEA et ai. Signaalintunnistuspartikkelin Alu RNA:ta sitovan heterodimeerin kiderakenne, SRP9/14  //  The EMBO Journal. - 1997. - Voi. 16 , ei. 13 . - P. 3757-3766 . - doi : 10.1093/emboj/16.13.3757 .
  4. ↑ Englert M. et ai. Uudet ylävirran ja intrageeniset ohjauselementit ihmisen 7SL-RNA-geenin RNA-polymeraasi III -riippuvaiselle transkriptiolle   // Biochimie . - 2004. - Voi. 86 , no. 12 . - s. 867-874 . - doi : 10.1016/j.biochi.2004.10.012 .
  5. ↑ Ullu E., Tschudi C. Alu-sekvenssit käsitellään 7SL RNA -geenejä   // Nature . - 1984. - Voi. 312 , nro. 5990 . - s. 171-172 . - doi : 10.1038/312171a0 . — PMID 6209580 .
  6. ↑ Kovalskaya O. N. et al. Signaalin tunnistavan partikkelin rakenteellinen ja toiminnallinen anatomia: bakteereista ihmisiin  // Usp. biol. kemia. - 2007. - T. 47 . - S. 129 .
  7. ↑ 1 2 Kohti nisäkkään signaalintunnistuspartikkelin rakennetta  //  Current Opinion in Structural Biology. - 2002-02-01. — Voi. 12 , iss. 1 . - s. 72-81 . — ISSN 0959-440X . - doi : 10.1016/S0959-440X(02)00292-0 . Arkistoitu alkuperäisestä 3. kesäkuuta 2021.
  8. ↑ Robert T. Batey, Robert P. Rambo, Louise Lucast, Brian Rha, Jennifer A. Doudna. Signaalintunnistushiukkasen ribonukleoproteiiniytimen kristallirakenne  (englanti)  // Tiede. - 18.2.2000. — Voi. 287 , iss. 5456 . - s. 1232-1239 . — ISSN 1095-9203 0036-8075, 1095-9203 . - doi : 10.1126/tiede.287.5456.1232 . Arkistoitu alkuperäisestä 3. kesäkuuta 2021.
  9. ↑ Rousin sarkoomaviruksen alhaisen molekyylipainon RNA:t: II. 7S RNA  (englanniksi)  // Virologia. - 12.12.1970. — Voi. 42 , iss. 4 . - s. 927-937 . — ISSN 0042-6822 . - doi : 10.1016/0042-6822(70)90341-7 . Arkistoitu alkuperäisestä 3. kesäkuuta 2021.
  10. ↑ Magnus Alm Rosenblad, Tore Samuelsson. Kloroplastin signaalintunnistushiukkasten RNA-geenien tunnistaminen  // Kasvien ja solujen fysiologia. – 15.11.2004. - T. 45 , no. 11 . - S. 1633-1639 . — ISSN 0032-0781 1471-9053, 0032-0781 . - doi : 10.1093/pcp/pch185 .
  11. ↑ Shu-ou Shan, Peter Walter. Kotranslationaalinen proteiinikohdistus signaalintunnistushiukkasella  (englanniksi)  // FEBS Letters. - 2005. - Voi. 579 , iss. 4 . - s. 921-926 . — ISSN 1873-3468 . - doi : 10.1016/j.febslet.2004.11.049 . Arkistoitu alkuperäisestä 3. kesäkuuta 2021.
  12. ↑ Lewinin / L. Cassimeriksen [ja muiden] mukaiset solut. - M . : Knowledge Laboratory, 2021. - S. 306-308. — 1056 s. - ISBN 978-5-00101-342-6 .
  13. ↑ Benjamin M Abell, Martin R Pool, Oliver Schlenker, Irmgard Sinning, Stephen High. Signaalintunnistuspartikkeli välittää translaation jälkeistä kohdistusta eukaryooteissa  // The EMBO Journal. - 21.7.2004. - T. 23 , no. 14 . - S. 2755-2764 . — ISSN 0261-4189 . - doi : 10.1038/sj.emboj.7600281 . Arkistoitu alkuperäisestä 3. kesäkuuta 2021.

Kirjallisuus

  1. Kovalskaya ON et al. Signaalin tunnistavan partikkelin rakenteellinen ja toiminnallinen anatomia: bakteereista ihmisiin  // Usp. biol. kemia. - 2007. - T. 47 . - S. 129 .