PELIT (USA)

Kokeneet kirjoittajat eivät ole vielä tarkistaneet sivun nykyistä versiota, ja se voi poiketa merkittävästi 4. joulukuuta 2019 tarkistetusta versiosta . tarkastukset vaativat 3 muokkausta .
PELIT
Tyyppi Laskennallisen kemian ohjelmisto
Kehittäjä Iowan osavaltion yliopiston kvanttikemian ryhmä
Sisään kirjoitettu Fortran
Käyttöjärjestelmä Linux , FreeBSD , Unix ja UNIXin kaltaiset käyttöjärjestelmät, Microsoft Windows , Mac OS X
uusin versio 20130501.1 ( 1. toukokuuta 2013 )
Lisenssi maksuton lisenssi
Verkkosivusto msg.chem.iastate.edu/gam…

GAMESS (USA) on laskennallisen kvanttikemian paketin ohjelma. [1] [2] [3] Lyhenne sanoista G eneral A tomic and M molecular Electronic S Structure S stem . Alkuperäisen koodin kehittäminen aloitettiin vuonna 1977 osana National Resources for Computations in Chemistry -projektia [4] . Vuonna 1981 ilmestyi kaksi GAMESSin vakaata haaraa: GAMESS (USA) ja GAMESS (UK) , siitä lähtien ne ovat kehittyneet itsenäisesti ja nykyään nämä kaksi ohjelmaa eroavat toisistaan ​​melkoisesti. GAMESS-projektia tukevat Iowan osavaltion yliopiston Gordon Research Groupin jäsenet.

Ominaisuudet

Yhteenvetotaulukko useista GAMESSin perusominaisuuksista
(C - integraalien tallennus, D - AO -integraalien suora laskenta , p - rinnakkaissuoritus, F - pirstoutuneiden MO:iden käyttö)
SCFTYP= RHF ROHF UHF GVB MCSCF
Energiaa CDpF CDp CDp CDp CDpF
Analyyttinen gradientti CDpF CDp CDp CDp CDpF
Numeerinen Hessen CDpF CDp CDp CDp CDp
Analyyttinen Hessian CDp CDp - CDp CDp
MP2 energiaa CDpF CDp CDp - CDp
MP2 gradientti CDpF Dp CDp - -
CI-energiaa CDp CDp - CDp CDp
CI-gradientti CD - - - -
CC energiaa CDpF - - - -
EOM-energiaa CD - - - -
DFT energia CDpF CDp CDp - -
dft gradientti CDpF CDp CDp - -
MOPAC-energiaa Joo Joo Joo Joo -
MOPAC-gradientti Joo Joo Joo - -

GAMESS (USA) pystyy suorittamaan MO-laskelmia käyttämällä monia laskennallisia kvanttikemian menetelmiä, mukaan lukien Hartree-Fock-menetelmä , tiheysfunktionaalinen teoria (DFT), valenssisidosteoria (GVB) ja monikonfiguraatio itsekonsistenttikenttä (MCSCF). Elektronien korrelaatioenergian korjaus itsekonsistenssimenettelyn jälkeen voidaan suorittaa käyttämällä konfiguraatiovuorovaikutusta (CI), toisen asteen Möller-Plessetin häiriöteoriaa. Liuotinvaikutus voidaan ottaa huomioon SCRF-, PCM-malleissa tai mallintaa ns. "tehokkaita fragmentteja". Relativistiset korjaukset voidaan ottaa huomioon myös erilaisilla menetelmillä, kuten kolmannen asteen Douglas-Kroll approksimaatiolla.

Koska ohjelmassa ei ole toteutettu molekyylimekaniikkaa , yhdistetyt laskelmat käyttävät TINKER -pakettia mekaanisen osan laskemiseen. Fragmentaarista MO-menetelmää voidaan käyttää suurten järjestelmien laskemiseen jakamalla ne "fragmenteiksi".

Suhde muihin ohjelmiin

GAMESS tallentaa laskutoimituksen erityismuotoiseen tekstitiedostoon. Tähän tiedostoon tallennetut koordinaatit voidaan muuntaa OpenBabel - ohjelmalla . Molekyyliorbitaalit voidaan visualisoida ohjelmilla, kuten Molekel tai wxMacMolPlt . 

Yhteensopivuus ja saatavuus

US GAMESS toimii kaikissa POSIX -yhteensopivissa käyttöjärjestelmissä, OS X:ssä ja Windowsissa. Binaaripaketit Mac OS X :lle , MacOS 7-9:lle ja Microsoft Windowsille ovat saatavilla viralliselta sivustolta . Sun Solaris UltraSPARC / x86 / x86-64 , IBM BlueGene , AIX POWER / PowerPC , Linux x86/x86-64 , Cray X1/XT Unicos , Fujitsu PrimePower Solaris , HP PA-RISC /x86 HP-UX ja NEC SUPER alustat ovat myös tuettu -UX [5] .

US GAMESSin lähdekoodia jaetaan ilmaiseksi ohjelman ei-kaupallisen käytön ehdoilla.

Katso myös

Muistiinpanot

  1. Computational Chemistry , David Young, Wiley-Interscience, 2001. Liite AA2.3 s. 334, GAMESS
  2. M. W. Schmidt et ai. General Atomic and Molecular Electronic Structure System  (englanniksi)  // J. Comput. Chem. : päiväkirja. - 1993. - Voi. 14 . - s. 1347-1363 . - doi : 10.1002/jcc.540141112 .
  3. MS Gordon ja MW Schmidt, Elektronisen rakenneteorian edistysaskel: GAMESS kymmenen vuotta myöhemmin , teoksessa Theory and Applications of Computational Chemistry, ensimmäiset 40 vuotta , CE Dykstra, G. Frenking. KS Lim ja GE Scusaria, Elsevier, Amsterdam, 2005.
  4. Gordon-tutkimusryhmä. GAMESS-opas (Johdanto) . Haettu 15. marraskuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 29. maaliskuuta 2012.
  5. GAMESS-rekisteröinti: lataa . Haettu 14. helmikuuta 2010. Arkistoitu alkuperäisestä 27. helmikuuta 2010.

Ulkoiset linkit