HMG20B

Korkean liikkuvuuden ryhmä 20B

ATE perustuu 2crj.

Käytettävissä olevat rakenteet

Ortologinen haku: PDBe , RCSB

Luettelo ATE:n tunnuksista
2krj

Tunnisteet

Symboli

HMG20B ; BRAF25; BRAF35; HMGX2; HMXB2; PP7706; SMARCE1r; SOXL; s. 8857

Ulkoiset tunnukset

OMIM: 605535 MGI : 1341190 Homologeeni : 74949 GeneCards : HMG20B-geeni

Geeniontologia
Toiminto	• DNA:n sitoutuminen • proteiineihin sitoutuminen • proteiinien heterodimerisaatioaktiivisuus
solukomponentti	• ydin • nukleoplasma • kromosomi • nucleolus
biologinen prosessi	• transkriptio, DNA-templaatti • transkription säätely, DNA-templaatti • solusykli • veren hyytyminen • kromatiinin modifikaatio • proteiinin sumoylaation negatiivinen säätely • luustolihassolujen erilaistuminen • neuronien erilaistumisen positiivinen säätely
Lähteet: Amigo / QuickGO

RNA-ekspressioprofiili

Lisää tietoa

ortologit

Näytä

Ihmisen

Hiiri

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (proteiini)

Locus (UCSC)

Chr 19:
3,57 – 3,58 Mb

Chr 10:
81,35 – 81,35 Mb

Hae PubMedistä

[yksi]

[2]

SWI/SNF-assosioitunut, templaattiin liittyvä aktiinista riippuvainen kromatiiniregulaattori, 1-riippuvainen E-alaperheen jäsen , on proteiini , jota ihmisissä koodaa HMG20B - geeni [1] [2] .

Vuorovaikutuksia

HMG20B:n on osoitettu olevan vuorovaikutuksessa KIF4A : n [3] , HDAC1 :n [4] , histonideasetylaasin 2 [4] [5] , PHF21A:n [4] [6] , RCOR1:n [4] ja BRCA2 :n [4] [7] kanssa .

Muistiinpanot

↑ Sumoy L., Carim L., Escarceller M., Nadal M., Gratacos M., Pujana MA, Estivill X., Peral B. HMG20A ja HMG20B kartoittuvat ihmisen kromosomeihin 15q24 ja 19p13.3 ja muodostavat erillisen HMG-luokan -box-geenit, joilla on kaikkialla esiintyvä ilmentymä // Sytogenetics and Genome Research : päiväkirja. - 2000. - Kesäkuu ( nide 88 , nro 1-2 ). - s. 62-7 . - doi : 10.1159/000015486 . — PMID 10773667 .
↑ Entrez Gene: HMG20B korkean liikkuvuuden ryhmä 20B . Arkistoitu alkuperäisestä 5. joulukuuta 2010. (määrätön)
↑ Lee, Young Mi; Kim Wankee. Ihmisen kinesiini-superperheen proteiinin jäsenen 4 yhdistäminen BRCA2:een liittyvään tekijään 35 // Biochemical Journal : päiväkirja. — Englanti, 2003. — Syyskuu ( osa 374 , no. Pt 2 ). - s. 497-503 . - doi : 10.1042/BJ20030452 . — PMID 12809554 .
↑ 1 2 3 4 5 Hakimi, Mohamed-Ali; Bochar Daniel A; Chenoweth Josh; Lane William S; Mandel Gail; Shiekhattar Ramin. Histonideasetylaasia sisältävä ydin-BRAF35-kompleksi välittää neuronispesifisten geenien tukahduttamista (englanniksi) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal. - Yhdysvallat, 2002. - toukokuu ( vol. 99 , no. 11 ). - P. 7420-7425 . — ISSN 0027-8424 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
↑ Hakimi, Mohamed-Ali; Dong Yuanshu; Lane William S; Speicher David W; Shiekhattar Ramin. Ehdokas X-kytketty kehitysvammaisuusgeeni on osa histonideasetylaasia sisältävien kompleksien uutta perhettä (englanniksi) // Journal of Biological Chemistry : Journal. - Yhdysvallat, 2003. - Helmikuu ( nide 278 , no. 9 ). - P. 7234-7239 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
↑ Iwase, Shigeki; Januma Aya; Miyamoto Kiyoko; Shono Naomi Honda Arata; Yanagisawa Junn; Baba Tadashi. BHC80:n karakterisointi BRAF-HDAC-kompleksissa, joka osallistuu neuronispesifiseen geenien repressioon // Biokemiallisen ja biofysikaalisen tutkimuksen viestintä : päiväkirja. - Yhdysvallat, 2004. - syyskuu ( osa 322 , no. 2 ). - s. 601-608 . — ISSN 0006-291X . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .
↑ Marmorstein, LY; Kinev A.V.; Chan GK; Bochar D.A.; Beniya H; Epstein JA; jeni TJ; Shiekhattar R. Ihmisen BRCA2-kompleksi, joka sisältää rakenteellisen DNA:ta sitovan komponentin, vaikuttaa solusyklin etenemiseen // Cell : Journal. - Yhdysvallat: Cell Press , 2001. - tammikuu ( osa 104 , nro 2 ). - s. 247-257 . — ISSN 0092-8674 . - doi : 10.1016/S0092-8674(01)00209-4 . — PMID 11207365 .

Kirjallisuus

Wattler F., Wattler S., Kelly M., et ai. Hiiren Smarce1-sukuisen, suuren liikkuvuuden 365-ryhmän geeniperheen uuden jäsenen, kloonaus, kromosomien sijainti ja ekspressioanalyysi // Genomics : Journal. - 1999. - Voi. 60 , ei. 2 . - s. 172-178 . - doi : 10.1006/geno.1999.5913 . — PMID 10486208 .
Marmorstein LY, Kinev AV, Chan GK, et ai. Ihmisen BRCA2-kompleksi, joka sisältää rakenteellisen DNA:ta sitovan komponentin, vaikuttaa solusyklin etenemiseen // Cell : Journal. - Cell Press , 2001. - Voi. 104 , no. 2 . - s. 247-257 . - doi : 10.1016/S0092-8674(01)00209-4 . — PMID 11207365 .
Lee YM, Shin H., Choi W. et ai. Ihmisen korkean liikkuvuuden ryhmän SMARCE1r-proteiinin karakterisointi (englanniksi) // Biochimica et Biophysica Acta : päiväkirja. - 2002. - Voi. 1574 , no. 3 . - s. 269-276 . - doi : 10.1016/s0167-4781(01)00373-6 . — PMID 11997092 .
Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J. et ai. Histonideasetylaasia sisältävä ydin-BRAF35-kompleksi välittää neuronispesifisten geenien tukahduttamista (englanniksi) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal. - 2002. - Voi. 99 , ei. 11 . - P. 7420-7425 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
Wang C., McCarty IM, Balazs L. et ai. BRCA2:een liittyvän tekijän 35 vaihtoehtoisesti silmukoitunutta proteiinia koodaavan cDNA:n kloonaus // Biochemical and Biophysical Research Communications : päiväkirja. - 2002. - Voi. 295 , nro. 1 . - s. 129-135 . - doi : 10.1016/S0006-291X(02)00624-1 . — PMID 12083779 .
Wang C., McCarty IM, Balazs L. et ai. BRAF25:n immunohistologinen havaitseminen ihmisen eturauhaskasvain- ja syöpänäytteistä // Biokemiallisen ja biofysikaalisen tutkimuksen viestintä : päiväkirja. - 2002. - Voi. 295 , nro. 1 . - s. 136-141 . - doi : 10.1016/S0006-291X(02)00625-3 . — PMID 12083780 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et ai. Yli 15 000 täyspitkän ihmisen ja hiiren cDNA-sekvenssin luominen ja ensimmäinen analyysi // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal . - 2003. - Voi. 99 , ei. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Hakimi MA, Dong Y., Lane WS, et ai. Ehdokas X-kytketty kehitysvammaisuusgeeni on osa histonideasetylaasia sisältävien kompleksien uutta perhettä (englanniksi) // Journal of Biological Chemistry : Journal. - 2003. - Voi. 278 , nro. 9 . - P. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
Lee YM, Kim W. Ihmisen kinesiinin superperheen proteiinin 4 yhdistäminen BRCA2:een liittyvän tekijän 35 kanssa // Biochemical Journal : päiväkirja. - 2003. - Voi. 374 , no. Pt 2 . - s. 497-503 . - doi : 10.1042/BJ20030452 . — PMID 12809554 .
Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., et ai. 21 243 täyspitkän ihmisen cDNA:n täydellinen sekvensointi ja karakterisointi // Nature Genetics : Journal . - 2004. - Voi. 36 , ei. 1 . - s. 40-5 . - doi : 10.1038/ng1285 . — PMID 14702039 .
Grimwood J., Gordon LA, Olsen A., et ai. Ihmisen kromosomin 19 DNA-sekvenssi ja biologia (englanniksi) // Nature : Journal. - 2004. - Voi. 428 , no. 6982 . - s. 529-535 . - doi : 10.1038/luonto02399 . — PMID 15057824 .
Iwase S., Januma A., Miyamoto K., et ai. BHC80:n karakterisointi BRAF-HDAC-kompleksissa, joka osallistuu neuronispesifiseen geenien repressioon // Biokemiallisen ja biofysikaalisen tutkimuksen viestintä : päiväkirja. - 2004. - Voi. 322 , no. 2 . - s. 601-608 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .
Gerhard DS, Wagner L., Feingold EA, et ai. NIH:n täyspitkän cDNA-projektin tila, laatu ja laajennus: Mammalian Gene Collection (MGC ) // Genomitutkimus : päiväkirja. - 2004. - Voi. 14 , ei. 10B . - s. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
Rual JF, Venkatesan K., Hao T. et ai. Kohti ihmisen proteiini-proteiini-vuorovaikutusverkoston proteomimittakaavaista karttaa (englanniksi) // Nature : Journal. - 2005. - Voi. 437 , no. 7062 . - s. 1173-1178 . - doi : 10.1038/luonto04209 . — PMID 16189514 .