RCOR1

REST-ydinpressori 1

ATE :tä edustaa esimerkkinä 2iw5.

Käytettävissä olevat rakenteet

Ortologinen haku: PDBe , RCSB

Luettelo ATE:n tunnuksista
2IW5 , 2UXN , 2UXX , 2V1D , 2X0L , 2XAF , 2XAG , 2XAH , 2XAJ , 2XAQ , 2XAS , 2Y48 , 3ZMS , 3ZMT , 3ZMS , 3ZMT , 3ZMN ,,, 3ZMM ___ _ _ _

Tunnisteet

Symboli

RCOR1 ; COREST; RCOR

Ulkoiset tunnukset

OMIM: 607675 MGI : 106340 Homologeeni : 32246 GeneCards : RCOR1 Gene

Geeniontologia
Toiminto	• RNA-polymeraasi II -ydinpromoottorin proksimaalisen alueen sekvenssispesifinen DNA:ta sitova transkriptiotekijäaktiivisuus, joka liittyy transkription negatiiviseen säätelyyn • kromatiinin sitoutuminen • proteiinin sitoutuminen • transkription säätelyalueen DNA:n sitoutuminen
solukomponentti	• ydin • nukleoplasma • nukleolus • transkription repressorikompleksi
biologinen prosessi	• RNA-polymeraasi II -promoottorin transkription negatiivinen säätely • transkriptio, DNA-templaatti • veren hyytyminen • virusprosessi • transkription negatiivinen säätely, DNA-templaatti • histoni H4 -deasetylaatio
Lähteet: Amigo / QuickGO

ortologit

Näytä

Ihmisen

Hiiri

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (proteiini)

Locus (UCSC)

Chr 14:
103,06 – 103,2 Mb

Chr 12:
111,04 – 111,12 Mb

Hae PubMedistä

[yksi]

[2]

Korepressori REST 1 , joka tunnetaan myös nimellä CoREST , on proteiini , jota ihmisissä koodaa RCOR1 - geeni . [1] [2]

Toiminto

Tämä geeni koodaa proteiinia , joka on hyvin konservoitunut, repressoitu syntyessään ja jolla on erityinen rooli hermosolujen erilaistumisen määrittämisessä. Koodattu proteiini sitoutuu REST:n C-terminaaliseen domeeniin ( repressor element-1 silenceing transkriptiotekijä ). [ 2]

Vuorovaikutuksia

RCOR1:n on osoitettu olevan vuorovaikutuksessa seuraavien kanssa:

HDAC1 , [3] [4]
HDAC2 , [3] [4]
HMG20B , [3]
REST (biologia) [5] ja
PHF21A . [3] [6]

Muistiinpanot

↑ Andrés ME, Burger C., Peral-Rubio MJ, Battaglioli E., Anderson ME, Grimes J., Dallman J., Ballas N., Mandel G. CoREST: funktionaalinen korepressori, jota tarvitaan hermospesifisen geeniekspression säätelyyn ( englanti) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal. - 1999. - syyskuu ( osa 96 , nro 17 ). - P. 9873-9878 . - doi : 10.1073/pnas.96.17.9873 . — PMID 10449787 .
↑ 1 2 Entrez Gene: RCOR1 REST corepressor 1 . Arkistoitu alkuperäisestä 5. joulukuuta 2010. (määrätön)
↑ 1 2 3 4 Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J., Lane WS, Mandel G., Shiekhattar R. Histonideasetylaasi sisältävä ydin-BRAF35-kompleksi välittää hermosoluspesifisten geenien repressiota (englanti) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States : Journal. - 2002. - Toukokuu ( osa 99 , nro 11 ). - P. 7420-7425 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
↑ 1 2 You A., Tong JK, Grozinger CM, Schreiber SL. CoREST on olennainen osa CoREST-ihmisen histonideasetylaasikompleksia // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal . - 2001. - Helmikuu ( osa 98 , nro 4 ). - s. 1454-1458 . - doi : 10.1073/pnas.98.4.1454 . — PMID 11171972 .
↑ Andrés ME, Burger C., Peral-Rubio MJ, Battaglioli E., Anderson ME, Grimes J., Dallman J., Ballas N., Mandel G. CoREST: funktionaalinen korepressori, jota tarvitaan hermospesifisen geeniekspression säätelyyn ( englanti) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal. - 1999. - elokuu ( osa 96 , nro 17 ). - P. 9873-9878 . - doi : 10.1073/pnas.96.17.9873 . — PMID 10449787 .
↑ Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. BHC80:n karakterisointi BRAF-HDAC-kompleksissa, mukana hermosoluspesifisessä geenirepressiossa // Biokemialliset ja biofysikaaliset tutkimukset Viestintä : päiväkirja. - 2004. - syyskuu ( osa 322 , nro 2 ) . - s. 601-608 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .

Kirjallisuus

Nomura N., Nagase T., Miyajima N., Sazuka T., Tanaka A., Sato S., Seki N., Kawarabayasi Y., Ishikawa K., Tabata S. Tuntemattomien ihmisen geenien koodaavien sekvenssien ennustaminen. II. 40 uuden geenin ( KIAA0041 -KIAA0080) koodaavat sekvenssit, jotka pääteltiin analysoimalla ihmisen solulinjan KG-1 cDNA-kloonit // DNA Research : päiväkirja. - 1994. - Voi. 1 , ei. 5 . - s. 223-229 . - doi : 10.1093/dnares/1.5.223 . — PMID 7584044 .
Andersson B., Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W., Gibbs RA " Kaksoissovittimen " menetelmä parannetun haulikkokirjaston rakentamiseen // Analytical Biochemistry : päiväkirja. - 1996. - Voi. 236 , nro. 1 . - s. 107-113 . - doi : 10.1006/abio.1996.0138 . — PMID 8619474 .
Yu W., Andersson B., Worley KC, Muzny DM, Ding Y., Liu W., Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G., Gibbs RA Large-scale concatenation cDNA-sekvensointi // Genome Research : päiväkirja. - 1997. - Voi. 7 , ei. 4 . - s. 353-358 . - doi : 10.1101/gr.7.4.353 . — PMID 9110174 .
Grimes JA, Nielsen SJ, Battaglioli E., Miska EA, Speh JC, Berry DL, Atouf F., Holdener BC, Mandel G., Kouzarides T. Apurepressori mSin3A on toiminnallinen komponentti REST-CoREST-repressorikompleksissa ( englanti) // Journal of Biological Chemistry : Journal. - 2000. - Voi. 275 , nro. 13 . - P. 9461-9467 . doi : 10.1074 / jbc.275.13.9461 . — PMID 10734093 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA DNA-kloonaus käyttäen in vitro -paikkaspesifistä rekombinaatiota // Genomitutkimus : päiväkirja. - 2000. - Voi. 10 , ei. 11 . - P. 1788-1795 . - doi : 10.1101/gr.143000 . — PMID 11076863 .
Humphrey GW, Wang Y., Russanova VR, Hirai T., Qin J., Nakatani Y., Howard BH Stabiilit histonideasetylaasikompleksit, jotka erottuvat SANT-domeeniproteiinien CoREST/kiaa0071 ja Mta-L1 läsnäolosta (englanniksi) // Journal of Biological Chemistry : lehti. - 2001. - Voi. 276 , nro. 9 . - P. 6817-6824 . - doi : 10.1074/jbc.M007372200 . — PMID 11102443 .
You A., Tong JK, Grozinger CM, Schreiber SL. CoREST on olennainen osa CoREST-ihmisen histonideasetylaasikompleksia (englanniksi) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal. - 2001. - Voi. 98 , ei. 4 . - s. 1454-1458 . - doi : 10.1073/pnas.98.4.1454 . — PMID 11171972 .
Ballas N., Battaglioli E., Atouf F., Andres ME, Chenoweth J., Anderson ME, Burger C., Moniwa M., Davie JR, Bowers WJ, Federoff HJ, Rose DW, Rosenfeld MG, Brehm P., Mandel G. Hermosolujen ominaisuuksien säätely uudella transkriptiokompleksilla // Neuron : päiväkirja. - Cell Press , 2001. - Voi. 31 , ei. 3 . - s. 353-365 . - doi : 10.1016/S0896-6273(01)00371-3 . — PMID 11516394 .
Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J., Lane WS, Mandel G., Shiekhattar R. Histonideasetylaasia sisältävä ydin-BRAF35-kompleksi välittää hermosoluspesifisten geenien repressiota (englanti) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United Amerikan osavaltiot : lehti. - 2002. - Voi. 99 , ei. 11 . - P. 7420-7425 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
Battaglioli E., Andrés ME, Rose DW, Chenoweth JG, Rosenfeld MG, Anderson ME, Mandel G. Hermosolujen geenien REST-repressio vaatii hSWI.SNF-kompleksin komponentteja // Journal of Biological Chemistry : Journal. - 2002. - Voi. 277 , no. 43 . - P. 41038-41045 . - doi : 10.1074/jbc.M205691200 . — PMID 12192000 .
Lunyak VV, Burgess R., Prefontaine GG, Nelson C., Sze SH, Chenoweth J., Schwartz P., Pevzner PA, Glass C., Mandel G., Rosenfeld MG Korepressorista riippuvainen hermosolujen geenejä koodaavien kromosomialueiden hiljentäminen.) // Tiede: lehti. - 2002. - Voi. 298 , nro. 5599 . - P. 1747-1752 . - doi : 10.1126/tiede.1076469 . — PMID 12399542 .
Hakimi MA, Dong Y., Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R. Ehdokas X-kytketty henkinen jälkeenjääneisyysgeeni on osa histonideasetylaasipitoisten kompleksien uutta perhettä (englanniksi) // Journal of Biological Chemistry : Journal. - 2003. - Voi. 278 , nro. 9 . - P. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. BHC80:n karakterisointi BRAF-HDAC-kompleksissa, mukana hermosoluspesifisessä geenirepressiossa (englanti) // Biokemialliset ja Biofysiikan tutkimusviestintä : päiväkirja. - 2004. - Voi. 322 , no. 2 . - s. 601-608 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .
Gu H., Liang Y., Mandel G., Roizman B. REST/CoREST/histoni-deasetylaasirepressorikompleksin komponentit hajoavat, modifioidaan ja siirretään HSV-1-infektoituneisiin soluihin (englanniksi) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States : Journal. - 2005. - Voi. 102 , no. 21 . - P. 7571-7576 . - doi : 10.1073/pnas.0502658102 . — PMID 15897453 .
Lee MG, Wynder C., Cooch N., Shiekhattar R. Corestin olennainen rooli nukleosomaalisessa histoni 3 lysiini 4 demetylaatiossa // Nature : Journal. - 2005. - Voi. 437 , no. 7057 . - s. 432-435 . - doi : 10.1038/luonto04021 . — PMID 16079794 .
Shi YJ, Matson C., Lan F., Iwase S., Baba T., Shi Y. LSD1-histonidemetylaasiaktiivisuuden säätely siihen liittyvillä tekijöillä // Molecular Cell : päiväkirja. - 2005. - Voi. 19 , ei. 6 . - s. 857-864 . - doi : 10.1016/j.molcel.2005.08.027 . — PMID 16140033 .
Nousiainen M., Silljé HH, Sauer G., Nigg EA, Körner R. Fosphoproteome analysis of the human mitotic spindle (englanniksi) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal. - 2006. - Voi. 103 , no. 14 . - P. 5391-5396 . - doi : 10.1073/pnas.0507066103 . — PMID 16565220 .