MMP12

Käytettävissä olevat rakenteet

Ortologinen haku: PDBe RCSB

Luettelo ATE:n tunnuksista

- _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ 2WO9 , 2WOO9, 2WOO9, 2WOO9, 2WOO9, 2WOO9, 2WOO9, 2WOO9, 2WOO9 , 2WOO9 , 2WOO9 , 2WOO9 , 2WOO9 , 2WOO9 , 2WOO9 , 2WOO9 , 2WOO9 , 2WOo , 2wo9 , 2WOOOL 2WOA , 2Z2D , 3BA0 , 3EHX , 3EHY , 3F15 , 3F16 , 3F17 , 3F18 , 3F19 , 3F1A , 3LIK , 3LIL , 3LIR , 3LJG , 3LK8 , 3LKA , 3N2U , 3N2V , 3NX7 , 3RTS , 3RTT , 3TS4 , 3TSK , 3UVC , 4GLY , 4GQL , 4GR0 , 4GR3 , 4GR8 _ _ , 4H30 , 4H49 , 4H76 , 4H84 , 4I03 , 4IJO , 2N8R , 5I4O , 5I0L , 5I2Z , 5I3M , 5I43

Tunnisteet

Symbolit

MMP12 , HME, ME, MME, MMP-12, matriisin metallopeptidaasi 12

Ulkoiset tunnukset

OMIM: 601046 MGI: 97005 Homologi: 20547 GeneCards: 4321

Geeniontologia
Toiminnot	• GO:0070122 peptidaasiaktiivisuus • endopeptidaasiaktiivisuus • hydrolaasiaktiivisuus • metallopeptidaasiaktiivisuus • metalli-ionien sitoutuminen • seriinityyppinen endopeptidaasiaktiivisuus • metalloendopeptidaasiaktiivisuus • kalsiumionien sitoutuminen • kollageenin sitoutuminen • sinkki-ionien sitoutuminen • sekvenssispesifinen DNA-sitoutuminen
solukomponentti	• GO:0005578 solunulkoinen matriisi • solunulkoinen alue • solunulkoinen tila • solun ydin • sytoplasma
biologinen prosessi	• kollageenin katabolinen prosessi • haavan paraneminen, epidermaalisten solujen leviäminen • solunulkoisen matriisin hajoaminen • haavan paranemiseen osallistuvan epiteelisolujen lisääntymisen positiivinen säätely • haavan paraneminen • GO:1901227 negatiivinen RNA-polymeraasi II:n transkription säätely • proteolyysi • proteiinin tuonti tumaan • GO:1901313 geeniekspression positiivinen säätely • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 RNA-transkription positiivinen säätely polymeraasi II -promoottorilla • viruksen puolustusvasteen säätely isännän toimesta • negatiivinen säätely tyypin I interferonivälitteinen signaalireitti • tyypin I interferonivälitteisen signaalireitin positiivinen säätely • soluvaste virukselle • vaste hypoksialle • elastiinin katabolinen prosessi • endoteelisolu-matriisiadheesion negatiivinen säätely fibronektiinin kautta • solunulkoinen matriisiorganisaatio • vaste amyloidille -beeta
Lähteet: Amigo / QuickGO

RNA-ekspressioprofiili

Lisää tietoa

ortologit

Erilaisia

Ihmisen

Hiiri

Entrez


4321


17381

Yhtye


ENSG00000262406


ENSMUSG00000049723

UniProt


P39900


P34960

RefSeq (mRNA)


NM_002426


NM_008605 NM_001320076 NM_001320077

RefSeq (proteiini)


NP_002417


NP_001307005 NP_001307006 NP_032631

Locus (UCSC)

Chr 11: 102,86 – 102,87 Mb

Chr 9: 7,34 – 7,37 Mb

PubMed- haku

[yksi]

[2]

Muokkaa (ihminen)

Muokkaa (hiiri)

MMP12 on geeni , joka koodaa MMP12 -proteiinia (Macrophage Metalloelastase, HME). Ihmisen genomissa geeni sijaitsee kromosomin 11 lyhyessä haarassa . MMP12:n koodaaman polypeptidin pituus on 470 aminohappoa ja sen molekyylipaino on 54 002 Da.

Sinkkiä sisältävänä kalsiumista riippuvaisena endopeptidaasina MMP12 pystyy hydrolysoimaan proteiineja. MMP12-substraattiproteiineja ovat elastiini (proteiini, sidekudos) sekä koko joukko ekstrasellulaarisia matriksiproteiineja , mukaan lukien tyypin IV kollageeni , gelatiini , fibronektiini , laminiini-1 , entaktiini , vitronektiini . Lisäksi MMP12 hydrolysoi proteoglykaanien proteiinikomponentteja ja aktivoi matriisin metalloproteinaaseja (metalloproteaaseja) MMP2 ja MMP3.

Ihmiskehossa MMP12:n biosynteesi (tuotanto) tapahtuu pääasiassa makrofageissa, jotka vaativat MMP12:n tunkeutumista vahingoittuneen kudoksen solunulkoiseen matriisiin. Näin ollen tämä toiminto on heikentynyt hiirillä, joilla on MMP12-puutos. MMP12:n yli-ilmentyminen hidastaa angiogeneesiä (verisuonten muodostumista), ja MMP12:n liiallinen ilmentyminen ihossa johtaa tyvikalvon eheyden häiriintymiseen.