RpoN

RpoN -geeni ( P NK -polymeraasi, typpeä rajoittava N ) koodaa sigmatekijää sigma -54 (σ 54 , sigma N tai RpoN), Escherichia colin ja muiden bakteerilajien proteiinia . RpoN torjuu RpoS:n sigmatekijät. [yksi]

Biologinen rooli

E. coli σ 54 :llä , joka alun perin tunnistettiin typen aineenvaihduntaan ja assimilaatioon osallistuvien geenien säätelijäksi typen rajoittamisen olosuhteissa, [2] on osoitettu olevan tärkeä säätelyrooli monissa muissa soluprosesseissa. Samoin σ54 - homologit muissa lajeissa säätelevät monenlaisia ​​prosesseja, mukaan lukien flagellarisynteesiä ja virulenssia. [3]

Sekvenssispesifisyys ja vaikutusmekanismi

σ54 - promoottorielementit koostuvat konservoituneista nukleotideista, jotka sijaitsevat -12:ssa ja -24:ssä transkription aloituskohdasta. [4] Tämä on toisin kuin σ70-perheen jäsenet , jotka tunnistavat konservoituneita promoottorielementtejä, jotka sijaitsevat noin -10 ja -35 transkription aloituskohdasta . [5] Toisin kuin σ 70 -perheen jäsenet, σ 54 -proteiinien on osoitettu sitovan promoottori-DNA:ta RNAP-ytimestä riippumatta in vitro. [6] Toinen σ 54 -proteiinien erottuva ominaisuus on niiden ehdoton tarve aktivaattoriproteiineille, jotka tunnetaan bakteerien tehostaja-sitoutumisproteiineina (bEBP), jotta ne käynnistävät transkription. [4] [7] Siten RNAP:n: σ 54 :n sekä aktiiviset että inaktiiviset muodot liittyvät promoottoreihin. [kahdeksan]

RpoN-säädellyillä promoottorielementeillä on seuraava konsensussekvenssi: TTGGCACGGTTTTTGCT. [9]

Muistiinpanot

1. ↑ Dong, T; Yu, R; Schellhorn, H. Antagonistinen säätely liikkuvuuden ja transkription ilmentymisen RpoN ja RpoS Escherichia colissa. (englanniksi)  // Molecular Microbiology: Journal. - 2011. - Voi. 79 , ei. 2 . - s. 375-386 . - doi : 10.1111/j.1365-2958.2010.07449.x . — PMID 21219458 .
2. ↑ Hunt, T.P.; Magasanik, B. glnA:n transkriptio eliminoiduilla Escherichia coli -komponenteilla: ydin-RNA-polymeraasi ja glnF:n, glnG:n ja glnL:n tuotteet  //  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America  : Journal. - 1985. - Voi. 82 . - P. 8453-8457 . - doi : 10.1073/pnas.82.24.8453 . — PMID 2867543 .
3. ↑ Tsang, J; Hoover, TR Teemat ja muunnelmat: RpoN-riippuvaisten lippugeenien säätely eri bakteerilajeissa  //  Scientifica : Journal. - 2014. - Vol. 2014 . — P. 681754 . - doi : 10.1155/2014/681754 . — PMID 24672734 .
4. ↑ 1 2 Wigneshweraraj, S; Bose, D; Burrows, PC; Joly, N; Schumacher, J; et ai. Sigma54-promoottorispesifisyystekijän sisältävän bakteeri-RNA-polymeraasin  toimintatapa //  Mikrobiologia : päiväkirja. — Mikrobiologian seura, 2008. - Voi. 38 . - s. 538-546 . - doi : 10.1111/j.1365-2958.2008.06181.x .
5. ↑ Gruber, T; Gross, CA Multiple Sigma -alayksiköt ja bakteerien transkriptioavaruuden jakaminen  (englanniksi)  // Annu Rev Microbiol  : Journal. - 2003. - Voi. 57 . - s. 441-466 . - doi : 10.1146/annurev.micro.57.030502.090913 . — PMID 14527287 .
6. ↑ Buck, M; Cannon, W. Sigma-54:n transkriptiotekijän spesifinen sitoutuminen DNA-promoottoriin  //  Nature : Journal. - 1992. - Voi. 358 . - s. 422-424 . - doi : 10.1038/358422a0 . — PMID 1641025 .
7. ↑ Shingler, V. Signaalisensoriset järjestelmät, jotka vaikuttavat σ54-riippuvaiseen transkriptioon  //  FEMS Microbiol Rev : Journal. - 2011. - Voi. 35 . - s. 425-440 . - doi : 10.1111/j.1574-6976.2010.00255.x . — PMID 21054445 .
8. ↑ Bonocora, R.P.; Smith, C; Lapierre, P; Wade, JT Escherichia coli σ54:n genomimittakaavakartoitus paljastaa laajalle levinneen, konservoituneen intrageenisen sitoutumisen   // PLoS - geeni : päiväkirja. - 2015. - Vol. 11 , ei. 10 . — P.e1005552 . - doi : 10.1371/journal.pgen.1005552 .
9. ↑ Leang, C; Krushkal, J; Ueki, T; Puljic, M; Sun, J; Juarez, K; Núñez, C; Reguera, G; DiDonato, R; Postier, B; Adkins, R.M.; Lovley, D.R. Geobacter sulfurreducensin RpoN-regulonin genominlaajuinen analyysi. (englanniksi)  // BMC Genomics : päiväkirja. - 2009. - Vol. 10 . - s. 331 . - doi : 10.1186/1471-2164-10-331 . — PMID 19624843 .