SPI1

Spi1 proto-onkogeeni

ATE yhdessä 1puen kanssa.

Käytettävissä olevat rakenteet

Ortologinen haku: PDBe , RCSB

Luettelo ATE:n tunnuksista
1 pue

Tunnisteet

Symboli

SPI1 ; OF; PU.1; SFPI1; SPI-1; SPI-A

Ulkoiset tunnukset

OMIM: 165170 MGI : 98282 Homologeeni : 2346 GeneCards : SPI1-geeni

Geeniontologia
Toiminto	• RNA-polymeraasi II:n distaalinen tehostajasekvenssispesifinen DNA-sitoutuminen • sekvenssispesifinen DNA:ta sitova RNA-polymeraasi II -transkriptiotekijän aktiivisuus • ydinpromoottorin sitoutuminen • RNA-polymeraasi II:n transkriptiotekijän sitoutuminen • RNA-polymeraasi II:n distaalisen tehostajan sekvenssispesifinen DNA:ta sitova transkriptiotekijän aktiivisuus, joka osallistuu transkription positiiviseen säätelyyn • sekvenssispesifinen DNA:ta sitova transkriptio tekijän aktiivisuus • RNA-polymeraasi II:n distaalinen tehostajasekvenssispesifinen DNA:ta sitova transkriptiotekijäaktiivisuus • RNA:n sitoutuminen • proteiinisitoutuminen • NFAT-proteiinin sitoutuminen
solukomponentti	• ydinkromatiini
biologinen prosessi	• RNA-polymeraasi II -promoottorin transkription negatiivinen säätely • lymfaattisten esisolujen erilaistuminen • transkription säätely RNA-polymeraasi II -promoottorista • transkriptio RNA-polymeraasi II -promoottorista • lymfosyyttien erilaistuminen • erytrosyyttien erilaistuminen • makrofagien erilaistuminen • granulosyyttien erilaistuminen • somaattisten kantasolujen ylläpito • myeloidisten dendriittisolujen erilaistuminen • hypermetyyliasetylaatiohistonin H3 CpG-saari • MHC-luokan II biosynteesiprosessin negatiivinen säätely • erytrosyyttien erilaistumisen säätely • geeniekspression negatiivinen säätely, epigeneettinen • transkription negatiivinen säätely, DNA-templaatti • transkription positiivinen säätely, DNA-templaatti • RNA-polymeraasin transkription positiivinen säätely II promoottori • anatomisen rakenteen regressio • histoni H4 asetylaation negatiivinen säätely • apoptoottinen prosessi, joka liittyy verisuonten kuvioimiseen
Lähteet: Amigo / QuickGO

RNA-ekspressioprofiili

Lisää tietoa

ortologit

Näytä

Ihmisen

Hiiri

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (proteiini)

Locus (UCSC)

Chr 11:
47,38 – 47,4 Mb

Chr 2:
91,08 – 91,12 Mb

Hae PubMedistä

[yksi]

[2]

Transkriptiotekijä PU.1 on proteiini , jota ihmisillä koodaa SPI1 -geeni [1] .

Toiminto

Tämä geeni koodaa ETS-domeenin transkriptiotekijää, joka aktivoi geenin ilmentymisen myeloidisten ja B-lymfoidisten solujen kehityksen aikana. Tumassa lokalisoitu proteiini sitoutuu puriinirikkaisiin sekvensseihin, jotka tunnetaan PU-laatikoina, se sijaitsee lähellä kohdegeenien promoottoreita ja säätelee niiden ilmentymistä yhdessä muiden transkriptiotekijöiden ja kofaktorien kanssa . Proteiini voi myös säädellä kohdegeenien vaihtoehtoista silmukointia . Tämän geenin eri isoformeja koodaavista transkripteistä on useita muunnelmia [2] .

Oletetaan, että Pu.1-synteesin moninkertainen lisääntyminen joissakin ihonalaisissa rasvasoluissa ikääntymisen aikana edistää adipogeneesin estämistä ja ihonalaisen rasvakudoksen ohenemista vanhuksilla. [3]

Vuorovaikutuksia

SPI1:n on osoitettu olevan vuorovaikutuksessa seuraavien kanssa:

FUS , [4]
GATA2 , [5]
IRF4 , [6] [7]
EI . [kahdeksan]

Muistiinpanot

↑ Ray D., Culine S., Tavitain A., Moreau-Gachelin F. Oletetun protoonkogeenin Spi-1 ihmisen homologi: karakterisointi ja ilmentyminen kasvaimissa // Onkogeeni : päiväkirja. - 1990. - Heinäkuu ( osa 5 , nro 5 ) . - s. 663-668 . — PMID 1693183 .
↑ Entrez-geeni: SPI1:n pernakohtaa muodostavan viruksen (SFFV) proviraalisen integraation onkogeeni spi1 . (määrätön)
↑ Hai P. Nguyen, Frances Lin, Danielle Yi, Ying Xie, Jennie Dinh, Pengya Xue, Hei Sook Sul, (2021). Ikääntymisestä riippuvaisia säätelysoluja syntyy ihonalaisessa rasvassa estämään adipogeneesiä . Developmental Cell doi : 10.1016/j.devcel.2021.03.026
↑ Hallier M., Lerga A., Barnache S., Tavitian A., Moreau-Gachelin F. Transkriptiotekijä Spi-1/PU.1 on vuorovaikutuksessa mahdollisen silmukointitekijän TLS kanssa // Journal of Biological Chemistry : Journal. - 1998. - Helmikuu ( nide 273 , nro 9 ). - P. 4838-4842 . — PMID 9478924 .
↑ Zhang P., Behre G., Pan J., Iwama A., Wara-Aswapati N., Radomska HS, Auron PE, Tenen DG, Sun Z. Negatiivinen ristipuhelu hematopoieettisten säätelyaineiden välillä: GATA-proteiinit tukahduttavat PU.1:tä ( englanti) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal. - 1999. - Heinäkuu ( osa 96 , nro 15 ). - P. 8705-8710 . — PMID 10411939 .
↑ Brass AL, Zhu AQ, Singh H. PU.1-Pip (IRF-4) aktivaattorikompleksien kokoonpanovaatimukset: toiminnan estäminen in vivo käyttämällä fuusioituja dimeerejä // The EMBO Journal : päiväkirja. - 1999. - Helmikuu ( osa 18 , nro 4 ). - s. 977-991 . doi : 10.1093 / emboj/18.4.977 . — PMID 10022840 .
↑ Escalante CR, Shen L., Escalante MC, Brass AL, Edwards TA, Singh H., Aggarwal AK PU.1/IRF-4/DNA-kolmiokompleksin kiteytyminen ja karakterisointi // Journal of Structural Biology : päiväkirja. - 2002. - Heinäkuu ( nide 139 , nro 1 ). - s. 55-9 . — PMID 12372320 .
↑ Hallier M., Tavitian A., Moreau-Gachelin F. Transkriptiotekijä Spi-1/PU.1 sitoo RNA:ta ja häiritsee RNA:ta sitovaa proteiinia p54nrb // Journal of Biological Chemistry : Journal. - 1996. - toukokuu ( nide 271 , nro 19 ). - P. 11177-11181 . — PMID 8626664 .

Kirjallisuus

Klemsz MJ, McKercher SR, Celada A., Van Beveren C., Maki RA Makrofagi- ja B-soluspesifinen transkriptiotekijä PU.1 liittyy ets-onkogeeniin. (englanniksi) // Solu : päiväkirja. - Cell Press , 1990. - Voi. 61 , nro. 1 . - s. 113-124 . - doi : 10.1016/0092-8674(90)90219-5 . — PMID 2180582 .
Nguyen VC, Ray D., Gross MS, de Tand MF, Frézal J., Moreau-Gachelin F. Ihmisen onkogeenin SPI1 lokalisaatio kromosomissa 11, alue p11.22. (englanniksi) // Human Genetics : Journal. - 1990. - Voi. 84 , nro. 6 . - s. 542-546 . - doi : 10.1007/bf00210807 . — PMID 2338340 .
Chen H., Ray-Gallet D., Zhang P., Hetherington CJ, Gonzalez DA, Zhang DE, Moreau-Gachelin F., Tenen DG PU.1 (Spi-1) säätelee ilmentymistään automaattisesti myeloidisoluissa. (englanniksi) // Onkogeeni. - 1995. - Voi. 11 , ei. 8 . - P. 1549-1560 . — PMID 7478579 .
Nagulapalli S., Pongubala JM, Atchison ML Useat proteiinit ovat fyysisesti vuorovaikutuksessa PU.1:n kanssa. Transkription synergia NF-IL6 beetan kanssa (C/EBP delta, CRP3). (Englanti) // Journal of Immunology : päiväkirja. - 1995. - Voi. 155 , nro. 9 . - P. 4330-4338 . — PMID 7594592 .
Pongubala JM, Atchison ML Aktivoiva transkriptiotekijä 1 ja syklinen AMP-vasteelementtimodulaattori voivat moduloida immunoglobuliinikappa 3' -tehostajan aktiivisuutta. (englanti) // Journal of Biological Chemistry : Journal. - 1995. - Voi. 270 , no. 17 . - P. 10304-10313 . doi : 10.1074/ jbc.270.17.10304 . — PMID 7730336 .
Hromas R., Orazi A., Neiman RS, Maki R., Van Beveran C., Moore J., Klemsz M. Hematopoietic lineage- and stage-restricted expression of the ETS oncogene family member PU.1. (englanniksi) // Veri : päiväkirja. - American Society of Hematology, 1993. - Voi. 82 , no. 10 . - s. 2998-3004 . — PMID 8219191 .
Hagemeier C., Bannister AJ, Cook A., Kouzarides T. Transkriptiotekijän PU.1 aktivaatiodomeeni sitoo retinoblastooma (RB) proteiinin ja transkriptiotekijä TFIID in vitro: RB osoittaa sekvenssin samankaltaisuutta TFIID:n ja TFIIB:n kanssa. (englanti) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal. - 1993. - Voi. 90 , ei. 4 . - s. 1580-1584 . - doi : 10.1073/pnas.90.4.1580 . — PMID 8434021 .
Hallier M., Tavitian A., Moreau-Gachelin F. Transkriptiotekijä Spi-1/PU.1 sitoo RNA:ta ja häiritsee RNA:ta sitovaa proteiinia p54nrb. (englanti) // Journal of Biological Chemistry : Journal. - 1996. - Voi. 271 , nro. 19 . - P. 11177-11181 . doi : 10.1074 / jbc.271.19.11177 . — PMID 8626664 .
Bassuk AG, Anandappa RT, Leiden JM Fysikaalisilla vuorovaikutuksilla Ets- ja NF-kappaB/NFAT-proteiinien välillä on tärkeä rooli ihmisen immuunikatoviruksen tehostajan yhteistoiminnassa T-soluissa. (Englanti) // Journal of Virology : päiväkirja. - 1997. - Voi. 71 , no. 5 . - P. 3563-3573 . — PMID 9094628 .
Li SL, Valente AJ, Zhao SJ, Clark RA PU.1 on välttämätön p47(phox)-promoottoriaktiivisuudelle myeloidisoluissa. (englanti) // Journal of Biological Chemistry : Journal. - 1997. - Voi. 272 , nro. 28 . - P. 17802-17809 . doi : 10.1074 / jbc.272.28.17802 . — PMID 9211934 .
Tsukada J., Misago M., Serino Y., Ogawa R., Murakami S., Nakanishi M., Tonai S., Kominato Y., Morimoto I., Auron PE, Eto S. Human T-cell leukemia virus type I Tax transaktivoi ihmisen prointerleukiini-1-beeta-geenin promoottorin yhdistämällä kaksi transkriptiotekijää, ydintekijä-interleukiini-6 ja Spi-1. (englanniksi) // Veri : päiväkirja. - American Society of Hematology, 1997. - Voi. 90 , ei. 8 . - s. 3142-3153 . — PMID 9376596 .
Hallier M., Lerga A., Barnache S., Tavitian A., Moreau-Gachelin F. Transkriptiotekijä Spi-1/PU.1 on vuorovaikutuksessa mahdollisen silmukointitekijän TLS kanssa. (englanti) // Journal of Biological Chemistry : Journal. - 1998. - Voi. 273 , nro. 9 . - P. 4838-4842 . doi : 10.1074/ jbc.273.9.4838 . — PMID 9478924 .
Suzuki S., Kumatori A., Haagen IA, Fujii Y., Sadat MA, Jun HL, Tsuji Y., Roos D., Nakamura M. PU.1 välttämättömänä aktivaattorina gp91(phox)-geenin ilmentymiselle ihmisessä perifeeriset neutrofiilit, monosyytit ja B-lymfosyytit. (englanti) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal. - 1998. - Voi. 95 , ei. 11 . - P. 6085-6090 . - doi : 10.1073/pnas.95.11.6085 . — PMID 9600921 .
Carrère S., Verger A., Flourens A., Stehelin D., Duterque-Coquillaud M. Erg-proteiinit, Ets-perheen transkriptiotekijät, muodostavat homo-, heterodimeerejä ja ternaarisia komplekseja kahden erillisen domeenin kautta. (englanniksi) // Onkogeeni : päiväkirja. - 1998. - Voi. 16 , ei. 25 . - P. 3261-3268 . - doi : 10.1038/sj.onc.1201868 . — PMID 9681824 .
Sato M., Morii E., Takebayashi-Suzuki K., Yasui N., Ochi T., Kitamura Y., Nomura S. Microphthalmia-assosioitunut transkriptiotekijä vuorovaikutuksessa PU.1:n ja c-Fosin kanssa: niiden subsellulaarisen lokalisoinnin määrittäminen. (englanti) // Biokemiallisen ja biofysikaalisen tutkimuksen viestintä : päiväkirja. - 1999. - Voi. 254 , nro. 2 . - s. 384-387 . - doi : 10.1006/bbrc.1998.9918 . — PMID 9918847 .
Messinki AL, Zhu AQ, Singh H. PU.1-Pip (IRF-4) -aktivaattorikompleksien kokoonpanovaatimukset: toiminnan estäminen in vivo käyttämällä fuusioituja dimeerejä. (englanniksi) // The EMBO Journal : päiväkirja. - 1999. - Voi. 18 , ei. 4 . - s. 977-991 . doi : 10.1093 / emboj/18.4.977 . — PMID 10022840 .
Yamamoto H., Kihara-Negishi F., Yamada T., Hashimoto Y., Oikawa T. Fyysiset ja toiminnalliset vuorovaikutukset transkriptiotekijän PU.1 ja koaktivaattorin CBP välillä. (englanniksi) // Onkogeeni : päiväkirja. - 1999. - Voi. 18 , ei. 7 . - s. 1495-1501 . - doi : 10.1038/sj.onc.1202427 . — PMID 10050886 .
Rao S., Matsumura A., Yoon J., Simon MC SPI-B aktivoi transkription ainutlaatuisen proliini-, seriini- ja treoniinidomeenin kautta ja osoittaa DNA:n sitoutumisaffiniteettieroja PU.1:stä. (englanti) // Journal of Biological Chemistry : Journal. - 1999. - Voi. 274 , nro. 16 . - P. 11115-11124 . doi : 10.1074 / jbc.274.16.11115 . — PMID 10196196 .
Mao S., Frank RC, Zhang J., Miyazaki Y., Nimer SD Funktionaaliset ja fyysiset vuorovaikutukset AML1-proteiinien ja ETS-proteiinin välillä, MEF: vaikutukset t(8;21)-positiivisten leukemioiden patogeneesiin. (englanti) // Molecular and Cellular Biology : päiväkirja. - 1999. - Voi. 19 , ei. 5 . - P. 3635-3644 . — PMID 10207087 .