TOP2B

Topoisomeraasi (DNA) II beeta 180 kDa

Ihmisen topoisomeraasi Iibeta kompleksissa DNA:n kanssa (kultapallo). ATE:n kohta 4j3n

Käytettävissä olevat rakenteet

Ortologinen haku: PDBe , RCSB

Luettelo ATE:n tunnuksista
3QX3 , 4G0U , 4G0V , 4G0W , 4J3N

Tunnisteet

Symboli

TOP2B ; TOPIIB; top2beta

Ulkoiset tunnukset

OMIM: 126431 MGI : 98791 Homologeeni : 134711 ChEMBL : 3396 GeneCards : TOP2B-geeni

EY-numero

5.99.1.3

Geeniontologia
Toiminto	• kromatiinin sitominen • DNA:n topoisomeraasityyppi II (ATP-hydrolysoiva) aktiivisuus • proteiinikinaasi C:n sitoutuminen • ATP:n sitoutuminen • proteiinin C-pään sitoutuminen • DNA:n sitoutuminen, taipuminen • entsyymien sitoutuminen • histonideasetylaasin sitoutuminen • metalli-ionien sitoutuminen • proteiinien heterodimerisaatioaktiivisuus
solukomponentti	• heterokromatiini • tuma • nukleoplasma • nukleolus • sytoplasma • sytosoli • nukleoidi • DNA topoisomeraasikompleksi (ATP-hydrolysoiva)
biologinen prosessi	• meioottisen rekombinaation välituotteiden erottelu • sisarkromatidisegregaatio • hermosolujen migraatio • ATP:n katabolinen prosessi • DNA-topologinen muutos • DNA:n replikaatiossa mukana oleva DNA:n purkautuminen • mitoottinen rekombinaatio • aksonogeneesi • etuaivojen kehitys • mitoottisen DNA:n eheyden tarkistuspiste
Lähteet: Amigo / QuickGO

RNA-ekspressioprofiili

Lisää tietoa

ortologit

Näytä

Ihmisen

Hiiri

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (proteiini)

Locus (UCSC)

Chr 3:
25,64 – 25,71 Mb

Chr 14:
16,37 – 16,43 Mb

Hae PubMedistä

[yksi]

[2]

DNA-topoisomeraasi 2-beeta on entsyymi , jota ihmisissä koodaa TOP2B - geeni [1] [2] .

Tämä geeni koodaa DNA topoisomeraasia , entsyymiä , joka säätelee ja muuttaa DNA:n topologisia tiloja transkription aikana . Tämä ydinentsyymi osallistuu prosesseihin, kuten kromosomien kondensaatioon , kromatidien erottumiseen ja vääntöjännityksen vähentämiseen, joita tapahtuu DNA:n transkription ja replikaation aikana . Se katalysoi kahden dupleksi-DNA-juosteen siirtymävaiheen hakkerointia ja yhdistymistä, jolloin säikeet voivat kulkea toistensa läpi ja muuttaa siten DNA:n topologiaa. Tämän entsyymin kaksi muotoa esiintyy todennäköisinä tuotteina geenin kaksinkertaistuessa. Beeta-muotoa koodaava geeni sijaitsee kromosomissa 3, kun taas alfa-muoto sijaitsee kromosomissa 17. Tätä entsyymiä koodaava geeni toimii kohteena useille antituumoriaineille, kuten mitoksantronille , ja monet tämän geenin mutaatiot liittyvät lääkeresistenssin kehittyminen. Tämän entsyymin vähentynyt aktiivisuus voi myös vaikuttaa ataksia-telangiektasiaan . Tämän geenin vaihtoehtoinen silmukointi johtaa kahteen transkriptimuunnelmaan; toista vaihtoehtoa ei kuitenkaan ole vielä täysin kuvattu [3] .

Vuorovaikutuksia

TOP2B:n on osoitettu olevan vuorovaikutuksessa BAZ1B :n [4] , HDAC1 :n [5] [6] , histonideasetylaasi 2 :n [5] , CD3E:n [7] , SUMO1 :n [8] ja P53 :n [9] kanssa .

Muistiinpanot

↑ Tan KB, Dorman TE, Falls KM, Chung TD, Mirabelli CK, Crooke ST, Mao J. Topoisomeraasi II alfa- ja topoisomeraasi II beetageenit: karakterisointi ja kartoitus ihmisen kromosomeihin 17 ja 3 // Cancer Research : päiväkirja. - 1992. - tammikuu ( osa 52 , nro 1 ) . - s. 231-234 . — PMID 1309226 .
↑ Jenkins JR, Ayton P., Jones T., Davies SL, Simmons DL, Harris AL, Sheer D., Hickson ID Ihmisen DNA-topoisomeraasi II:n beeta-isotsyymiä koodaavien cDNA-kloonien eristäminen ja geenin lokalisointi kromosomiin 3p24 .) // Nucleic Acids Research : päiväkirja. - 1993. - tammikuu ( osa 20 , nro 21 ). - P. 5587-5592 . doi : 10.1093 / nar/20.21.5587 . — PMID 1333583 .
↑ Entrez-geeni: TOP2B topoisomeraasi (DNA) II beeta 180 kDa . (määrätön)
↑ Kitagawa, Hirochika; Fujiki Ryoji, Yoshimura Kimihiro, Mezaki Yoshihiro, Uematsu Yoshikatsu, Matsui Daisuke, Ogawa Satoko, Unno Kiyoe, Okubo Mataichi, Tokita Akifumi, Nakagawa Takeya, Ito Takashi, Ishimi Yukio, Nagasawa Yamo Togi, Matsa Yaumo, Kato Toki Kromatiinia uudistava kompleksi WINAC kohdistaa tumareseptorin promoottoriin ja on heikentynyt Williamsin oireyhtymässä // Cell : Journal. — Yhdysvallat: Cell Press , 2003. — Kesäkuu ( osa 113 , nro 7 ). - s. 905-917 . — ISSN 0092-8674 . - doi : 10.1016/S0092-8674(03)00436-7 . — PMID 12837248 .
↑ 1 2 Tsai, SC; Valkov N; Yang W.M.; Gump J; Sullivan D; Seto E. Histonideasetylaasi on suoraan vuorovaikutuksessa DNA topoisomeraasi II :n kanssa // Nature Genetics : Journal . - YHDYSVALLAT, 2000. - marraskuu ( osa 26 , no. 3 ). - s. 349-353 . — ISSN 1061-4036 . - doi : 10.1038/81671 . — PMID 11062478 .
↑ Johnson, CA; PadgetK; Austin CA; Turner B M. Deasetylaasiaktiivisuus liittyy topoisomeraasi II:een ja on välttämätön etoposidin indusoimalle apoptoosille // Journal of Biological Chemistry : Journal. - Yhdysvallat, 2001. - Helmikuu ( nide 276 , no. 7 ). - P. 4539-4542 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.C000824200 . — PMID 11136718 .
↑ Nakano, H; Yamazaki T; Miyatake S; Nozaki N; Kikuchi A; Saito T. Topoisomeraasi II beetan ja T-solureseptorikompleksin CD3-epsilon-ketjun spesifinen vuorovaikutus (englanniksi) // Journal of Biological Chemistry : Journal. - YHDYSVALLAT, 1996. - maaliskuu ( osa 271 , nro 11 ). - P. 6483-6489 . — ISSN 0021-9258 . doi : 10.1074 / jbc.271.11.6483 . — PMID 8626450 .
↑ Mao, Y; Desai SD; Liu L F. SUMO-1-konjugaatio ihmisen DNA:n topoisomerase II -isotsyymeihin (englanniksi) // Journal of Biological Chemistry : Journal. - YHDYSVALLAT, 2000. - elokuu ( osa 275 , no. 34 ). - P. 26066-26073 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M001831200 . — PMID 10862613 .
↑ Cowell, I.G.; Okorokov A.L.; Cutts SA; PadgetK; Bell M; Milner J; Austin C A. Ihmisen topoisomeraasi IIalfa ja IIbeta ovat vuorovaikutuksessa p53:n C-terminaalisen alueen kanssa // Experimental Cell Research : päiväkirja. - YHDYSVALLAT, 2000. - Helmikuu ( osa 255 , nro 1 ). - s. 86-94 . — ISSN 0014-4827 . - doi : 10.1006 / erillinen 1999.4772 . — PMID 10666337 .

Kirjallisuus

Champoux JJ DNA topoisomeraasit: rakenne, toiminta ja mekanismi. (englanniksi) // Annual Review of Biochemistry : päiväkirja. - 2002. - Voi. 70 . - s. 369-413 . - doi : 10.1146/annurev.biochem.70.1.369 . — PMID 11395412 .
Austin CA, Fisher LM Uutta DNA-topoisomeraasi II -homologia koodaavan ihmisen cDNA-kloonin eristäminen ja karakterisointi HeLa-soluista. (englanniksi) // FEBS Letters : päiväkirja. - 1990. - Voi. 266 , no. 1-2 . - s. 115-117 . - doi : 10.1016/0014-5793(90)81520-X . — PMID 2163884 .
Chung TD, Drake FH, Tan KB, et ai. Kahta ihmisen DNA-topoisomeraasi II -isotsyymiä koodaavien cDNA-kloonien karakterisointi ja immunologinen tunnistaminen (englanniksi) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal. - 1990. - Voi. 86 , no. 23 . - P. 9431-9435 . - doi : 10.1073/pnas.86.23.9431 . — PMID 2556712 .
Austin CA, Sng JH, Patel S., Fisher LM Novel HeLa topoisomeraasi II on II beeta-isoformi: täydellinen koodaussekvenssi ja homologia muiden tyypin II topoisomeraasien kanssa // Biochimica et Biophysica Acta : päiväkirja. - 1993. - Voi. 1172 , no. 3 . - s. 283-291 . - doi : 10.1016/0167-4781(93)90215-Y . — PMID 8383537 .
Davies SL, Jenkins JR, Hickson ID Ihmissolut ilmentävät kahta erilaisesti silmukoitua topoisomeraasi II beeta-mRNA:n muotoa // Nucleic Acids Research : päiväkirja. - 1993. - Voi. 21 , ei. 16 . - P. 3719-3723 . doi : 10.1093 / nar/21.16.3719 . — PMID 8396237 .
Nakano H., Yamazaki T., Miyatake S., et ai. Topoisomeraasi II beetan ja T-solureseptorikompleksin CD3-epsilon-ketjun spesifinen vuorovaikutus (englanniksi) // Journal of Biological Chemistry : Journal. - 1996. - Voi. 271 , nro. 11 . - P. 6483-6489 . doi : 10.1074 / jbc.271.11.6483 . — PMID 8626450 .
Biersack H., Jensen S., Gromova I. et ai. Aktiiviset heterodimeerit muodostuvat ihmisen DNA:n topoisomeraasi II alfa- ja II beeta-isoformeista (englanniksi) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America : Journal. - 1996. - Voi. 93 , ei. 16 . - P. 8288-8293 . - doi : 10.1073/pnas.93.16.8288 . — PMID 8710863 .
Meyer KN, Kjeldsen E., Straub T., et ai. Tyypin I ja II topoisomeraasien solusykliin kytketty uudelleensijoittaminen ja katalyyttisen entsyymiaktiivisuuden modulaatio // Journal of Cell Biology : päiväkirja. - 1997. - Voi. 136 , nro. 4 . - s. 775-788 . doi : 10.1083/ jcb.136.4.775 . — PMID 9049244 .
Fukunaga R., Hunter T. MNK1, uusi MAP-kinaasiaktivoitu proteiinikinaasi, eristetty uudella ekspressioseulontamenetelmällä proteiinikinaasisubstraattien tunnistamiseksi // The EMBO Journal : päiväkirja. - 1997. - Voi. 16 , ei. 8 . - P. 1921-1933 . - doi : 10.1093/emboj/16.8.1921 . — PMID 9155018 .
Ng SW, Liu Y., Schnipper LE Ihmisen DNA:n topoisomeraasi II -beetageenin 5'-reunustavan sekvenssin kloonaus ja karakterisointi (englanniksi) // Gene : Journal. - 1998. - Voi. 203 , no. 2 . - s. 113-119 . - doi : 10.1016/S0378-1119(97)00500-3 . — PMID 9426241 .
Yamane K., Kawabata M., Tsuruo T. DNA-topoisomeraasi II:ta sitova proteiini, jossa on kahdeksan toistuvaa aluetta, jotka ovat samanlaisia kuin DNA-korjausentsyymejä ja solusyklin säätelijä // FEBS Journal : päiväkirja. - 1998. - Voi. 250 , ei. 3 . - s. 794-799 . - doi : 10.1111/j.1432-1033.1997.00794.x . — PMID 9461304 .
Cowell IG, Willmore E., Chalton D., et ai. Ihmisen DNA:n topoisomeraasi IIbetan ydinjakauma: tumaan kohdistuva signaali sijaitsee 116-tähteisessä C-pään hännässä // Experimental Cell Research : päiväkirja. - 1998. - Voi. 243 , no. 2 . - s. 232-240 . - doi : 10.1006 / erillinen 1998.4150 . — PMID 9743583 .
Lang AJ, Mirski SE, Cummings HJ, et ai. Ihmisen TOP2A- ja TOP2B-geenien rakenneorganisaatio (englanniksi) // Gene : Journal. - 1998. - Voi. 221 , nro. 2 . - s. 255-266 . - doi : 10.1016/S0378-1119(98)00468-5 . — PMID 9795238 .
Sng JH, Heaton VJ, Bell M. et ai. Ihmisen topoisomeraasi IIalfa- ja IIbeta-geenien molekyylikloonaus ja karakterisointi: todisteita isoformien evoluutiosta geenin päällekkäisyyden kautta // Biochimica et Biophysica Acta : päiväkirja. - 1999. - Voi. 1444 , no. 3 . - s. 395-406 . - doi : 10.1016/S0167-4781(99)00020-2 . — PMID 10095062 .
Bjergbaek L., Jensen S., Westergaard O., Andersen AH. Käyttämällä biokemiallista lähestymistapaa ihmisen DNA:n topoisomeraasi IIalphan primääristen dimerisaatioalueiden tunnistamiseen // Journal of Biological Chemistry : Journal. - 1999. - Voi. 274 , nro. 37 . - P. 26529-26536 . doi : 10.1074 / jbc.274.37.26529 . — PMID 10473615 .
Cowell IG, Okorokov AL, Cutts SA, et ai. Ihmisen topoisomeraasi IIalfa ja IIbeta ovat vuorovaikutuksessa p53:n C-terminaalisen alueen kanssa // Experimental Cell Research : päiväkirja. - 2000. - Voi. 255 , nro. 1 . - s. 86-94 . - doi : 10.1006 / erillinen 1999.4772 . — PMID 10666337 .
Mao Y., Desai SD, Liu LF SUMO-1 konjugaatio ihmisen DNA:n topoisomerase II -isoentsyymeihin (englanniksi) // Journal of Biological Chemistry : Journal. - 2000. - Voi. 275 , nro. 34 . - P. 26066-26073 . - doi : 10.1074/jbc.M001831200 . — PMID 10862613 .
Mirski SE, Voskoglou-Nomikos T., Young LC, et ai. Topoisomeraasi II alfa- ja beeta-isoformin mRNA:iden samanaikainen kvantifiointi keuhkokasvainsoluissa ja normaalissa ja pahanlaatuisessa keuhkokudoksessa // Laboratoriotutkimus : päiväkirja. - 2000. - Voi. 80 , ei. 6 . - s. 787-795 . - doi : 10.1038/labinvest.3780083 . — PMID 10879730 .