Autoktonismi (Euroopassa ja USA:ssa käytetään termiä indigenismi ) on ideologia tai sosiaalinen oppi, joka ylläpitää tietyn alueen väestön historiallisen kehityksen geneettistä ja/tai kielellistä jatkuvuutta. Autoktonismi levisi Euroopassa laajalle 1700-luvun ensimmäisellä puoliskolla kansallisen itsetunton kasvun myötä ja vaikutti moniin yhteiskuntatieteisiin, joissa se vastusti " migrationismia " (hypoteesi, että historialliset kulttuuriset muutokset voitaisiin yhdistää väestön muuttoliike, etnisen alkuperän ja/tai kielen muutos tietyllä alueella) ja " invasionismi " (hypoteesi alkuperäisväestön tunkeutumisesta ja tuhoamisesta kulttuurin muutoksen syinä). Tänä aikana eurooppalaisten valtojen jatkuvien aluekiistojen yhteydessä autoktonismi sai ideologista ja poliittista merkitystä. Venäjän historiatieteessä autoktonismin erityisiä ilmentymiä olivat antinormalismi (hypoteesi slaavilaisen elementin vallitsemisesta varangilaisten keskuudessa ) , hypoteesit slaavilaisen väestön autoktonisuudesta esihistoriallisella kaudella ( B. A. Rybakov ja muut).
Euroopan rajojen muuttumattomuutta koskevien sopimusten solmimisen jälkeen autoktonismi menettää vähitellen merkityksensä Euroopassa, mutta on edelleen vahvaa Itä-Aasian, Afrikan ja Etelä-Amerikan maissa.
Muuttoliike nousi prosessiarkeologiaan 1960- ja 1970-luvuilla selittämään kulttuurimuutoksia neoliittisen ja pronssikauden esihistoriallisessa Euroopassa .